ALINHAMENTO DOS AMINOÁCIDOS PARA O

ALINHAMENTO DOS AMINOÁCIDOS PARA O SEQUENCIAMENTO
GENÉTICO DE PROTEÍNAS
KAISER, T. J. S.¹; BENICIO, A. A.¹
¹Docentes do Curso de Análise e Desenvolvimento de Sistemas da UNESC –
Faculdades Integradas de Cacoal – Cacoal-RO. E-mail: [email protected];
[email protected]
É inegável o importantíssimo papel desempenho pelos recursos tecnológicos nas mais
diversas áreas do conhecimento, em especial àquelas que se destinam à produção de
conhecimento e sua exequível aplicação. Alinhar as metodologias de pesquisa aos
recursos tecnológicos é fator primordial na obtenção de resultados fidedignos no menor
tempo e custo possíveis.Conhecida como uma “nova ciência”, a bioinformática está
pautada na multidisciplinariedade, envolvendo áreas como biologia molecular, ciência
da computação, matemática, estatística e engenharia de softwares (Filho et al, 2002),
todas voltadas a um único objetivo: superar as fronteiras das ciências pelo
desenvolvimento de novas abordagens capazes de promover a análise, apresentação e
armazenagem de dados. Em linhas gerais, a bioinformática pode ser definida com a área
de estudo responsável pelo desenvolvimento e utilização de ferramentas computacionais
para adquirir, armazenar, organizar e analisar dados genéticos. O emprego de
ferramentas computacionais no estudo de problemas e questões biológicas abrangendo
também as aplicações relacionais à saúde humana, como o planejamento de novos
fármacos.Pode-se citar o sequenciamento genético de proteínas como grande
beneficiada da utilização de tais recursos tecnológicos.Sequenciamento é o nome dado
ao processo de determinação da ordem sequencial das partes constituintes de um
biopolímero não ramificado, isto é, a ordem de nucleotídeos de uma molécula de DNA
ou RNA, ou de aminoácidos de uma proteína. Para auxiliar na análise dessas
sequências, diversos algoritmos de análise foram criados no intuito de alinhar as
sequências obtidas com foco na comparação de duas ou mais sequências na busca de
séries de caracteres individuais que se encontram na mesma ordem nas sequências
analisadas. Além de fundamentais em pesquisas de filogenética e análise evolutiva, os
alinhamentos são exigidos em estudos de inferência estrutural e funcional de proteínas.
(Verli, 2014). Identificar o a sequência dos aminoácidos de uma proteína e, a partir
desse sequenciamento, determinar sua estrutura tridimensional é basilar para a
compreensão de sua função. A função de uma proteína está intimamente associada à sua
estrutura tridimensional. A partir do sequenciamento genético, o desenvolvimento de
um novo fármaco se dá através da caracterização da estrutura tridimensional da proteína
codificada. Tal estrutura é responsável por guiar, de forma racional, o planejamento de
novos compostos medicinais. Essa área de pesquisa abrange os métodos que utilizam
informações de estrutura tridimensional da molécula receptora para descoberta e/ou
desenvolvimento de novos fármacos. Assim, pautado na elevada importância do
sequenciamento e alinhamento dos aminoácidos de uma proteína para posterior
modelagem tridimensional de sua estrutura com foco no desenvolvimento de novos
fármacos,é fundamental o desenvolvimento de um algoritmo com o objetivo de
aprimorar o alinhamento resultado da análise de sequência de aminoácidos de proteínas.
Palavras-chave: Proteína. Algoritmo. Alinhamento.