Seqüenciamento de ESTs do Schistosoma mansoni – Projeto

Propaganda
51º Congresso Brasileiro de Genética
Resumos do 51º Congresso Brasileiro de Genética • 7 a 10 de setembro de 2005
Hotel Monte Real • Águas de Lindóia • São Paulo • Brasil
www.sbg.org.br - ISBN 85-89109-05-4
[email protected]
Palavra-chave: EST, transcriptoma, bioinformática
Santos, FAA; Souza, GRL; Prudencio, CR; Almeida, JF; Goulart, LR
Instituto de Genética e Bioquímica, Departamento de Genética e Bioquímica, Universidade Federal de Uberlândia.
Seqüenciamento de ESTs do
Schistosoma mansoni – Projeto Genoma
Mineiro FAPEMIG-CNPq
O Schistosoma mansoni é o agente etiológico da Esquistossomose, uma doença considerada um dos mais
sérios problemas de saúde pública em escala mundial, atingindo cerca de 200 milhões de pessoas. O
genoma deste endoparasito é composto por 270Mpb, seu cariótipo possui 8 pares de cromossomos
com determinação de sexo ZW, sendo que o número de genes expressos é em torno de 15.000 a
20.000. O Sequenciamento de ESTs do Schistosoma mansoni está vinculado a Rede Genoma Minas, e é
financiado pelos órgãos FAPEMIG-CNPq. Além disso, o projeto de transcriptoma faz parte do Núcleo
de Sequenciamento e Análises de Genomas do INGEB, alocado no Laboratório de Genética Molecular
da UFU, e tem como objetivo a produção e análise de 10.000 etiquetas de sequências transcritas (EST,
do inglês expressed sequence tags). Este projeto justifica-se pelo fato de possibilitar novos estudos para
o conhecimento da biologia molecular do parasito, assim como os mecanismos de resistência a drogas e
a variação antigênica que lhe permite escapar do sistema imunológico do hospedeiro, a fim de descobrir
novas drogas terapêuticas, novos testes para diagnóstico ou ainda produzir vacinas eficazes. Para o
desenvolvimento do projeto foi necessária a realização do crescimento e manutenção dos clones enviados
pela coordenação, extração do DNA plasmidial para sequenciamento seguida de uma avaliação em gel
de eletroforese, posteriormente, foi feita a reação de sequenciamento e sua precipitação, para que fosse
realizada a injeção das amostras no sequenciador. Foi realizado o sequenciamento de aproximadamente
13.200 sequências, incluindo testes para otimização da quantidade de DNA e primers, e reinjeções.
As sequências foram armazenadas em arquivos no formato esd e posteriormente foram feitas análises
de bioinformática. Após a clusterização obtivemos 1471 uni gene, sendo 131 clusters e 1340 singlets.
Para a anotação gênica, foram feitos dois alinhamentos, um contra todas as proteínas conservadas
entre organismos modelo eucarióticos com genoma completo, utilizando o banco de dados KOG, e
outro contra todas as proteínas conhecidas depositadas no banco de dados Uniprot. Tais alinhamentos
resultaram em 190 clusters com sequências conhecidas e 1281 desconhecidas, que podem se tratar
de sequências inviáveis ou genes desconhecidos.
Apoio financeiro: FAPEMIG e CNPq.
1094
Download
Random flashcards
A Jornada do Herói

6 Cartões filipe.donner

teste

2 Cartões juh16

Criar flashcards