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MSc in Biochemistry
Dissertation Project – 2nd Cycle
Student´s Name:
Student email address:
No.
Supervisor(s): Sofia Pauleta
Supervisor(s) email address: [email protected]; https://sites.google.com/site/spauletagroup/home
Lab/Institution: Lab 617/613 UCIBIO, Dep. Química, FCT-UNL
TITLE: Novo sistema de divisião celular em bactérias anaeróbias (Inclui dois projectos de Tese)
BACKGROUND
Este estudo está incluido num projecto recentemente financiado pela Fundação para a
Ciência e Tecnologia, FCT-ANR/BBB-MET/0023/2012, e por uma acção bilateral entre
Portugal-França/Marselha. O aluno poderá ter uma bolsa de investigação para realizar a tese
de mestrado.
Recentemente foi descoberto um operão (ver Figura), conservado em bactérias anaeróbias e
essencial para que elas possam manter este modo de vida (na ausência deste operão a
divisão celular não é correcta).
No entanto, a função/estrutura das proteínas/enzimas codificadas por este operão ainda não é
conhecida, sabendo-se por estudos in vivo que estão envolvidas na divisão celular. Este
operão constitui portanto um novo sistema de divisão celular.
Uma das proteínas é a proteína Laranja, cuja estrutura já é conhecida, e que apresenta um
cluster heterometálico Cu-Mo que é único na natureza. O/a(s) aluno/a(s) irão caracterizar
bioquímicamente uma das proteínas deste operão: o seu regulador da transcrição ou a MRP,
uma ATPase que tem um novo centro Fe-S . O trabalho de investigação será efectuado em
colaboração com o laboratório no CNRS, Marseille, França, da Dr. Corinne Aubert.
OBJECTIVES
Assim, é proposto o isolamento heterólogo destas duas proteínas, e a sua caracterização
bioquímica, e enzimática.
No caso do regulador da transcrição pretende-se descobrir qual o sinal ambiental que irá
induzir a transcripção deste operão que é conservado neste tipo de bactérias. A
caracterização do regulador da transcrição irá incluir:
Tarefa 1. Purificação da proteína e caracterização bioquímica.
Tarefa 2. Estudos por Real-Time PCR.
Tarefa 3. Interacção com o DNA (várias técnicas e também determinação de actividade
ATPase).
No caso da proteína ATPases com um centro Fe-S pretende-se:
Tarefa 1. Isolamento e caracterização das suas propriedades bioquímicas e espectroscópicas. 1
Tarefa 2. Estudo da interacção com a proteína laranja.
Tarefa 3. Caracterização da actividade enzimáticas como ATPase.
MSc in Biochemistry
Dissertation Project – 2nd Cycle
Desta forma, esperamos obter novas informações que nos permitam determinar como é que
este novo sistema de divisão celular funciona.
Methodologies
Expressão heteróloga e homóloga de proteínas e sua purificação (diversas técnicas
cromatográfias), espectroscopia de visível, ITC, NMR, RT-PCR, actividades enzimáticas.
TIMELINE (use fill tool for the cells)
1. Regulador da Transcrição
Month 1
Month 2
Month 3
Month 4
Month 5
Month 6
Month 7
Month 8
Month 9
Month 10
Month 3
Month 4
Month 5
Month 6
Month 7
Month 8
Month 9
Month 10
Task 1
Task 2
Task 3
Thesis
2. Proteina ATPase MRP
Month 1
Month 2
Task 1
Task 2
Task 3
Thesis
2