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50º Congresso Brasileiro de Genética
Resumos do 50º Congresso Brasileiro de Genética • 7 a 10 de setembro de 2004
Costão do Santinho • Florianópolis • Santa Catarina • Brasil
www.sbg.org.br - ISBN 85-89109-04-6
[email protected]
Palavras-chave: Genes ortólogos, comparação, UTRs
Zerati, KF; Miziara, MN; Amaral, MEJ
Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Departamento de Biologia, Universidade Estadual Paulista (UNESP).
Comparação das seqüências transcritas
não-traduzidas de genes ortólogos
entre bovino, humano e camundongo
As regiões não-codificantes de um gene incluem as regiões 5’ e 3’ flanqueadoras (FLRs), que não são transcritas
e as regiões transcritas 5’ e 3’ não-traduzidas (UTRs). As seqüências 5’-UTR são definidas como a região
do mRNA que se estende do sitio cap até o start codon, enquanto as seqüências 3’-UTR como a região que
vai do stop codon até o início da cauda poli-A. Estas regiões são conhecidas por seu papel crucial na regulação
pós-transcricional da expressão gênica, que incluem o controle do transporte do mRNA para fora do núcleo,
da tradução eficiente e da localização e estabilidade do mRNA. Utilizando a genômica comparativa, muitos
autores têm descrito genes com alta conservação de seqüências não-codificantes entre espécies distantemente
relacionadas. Estudos baseados em análise comparativa de genes ortólogos permitem aliar este alto grau de
conservação com o caráter funcional de suas seqüências. O presente estudo teve como objetivo analisar a
conservação entre seqüências transcritas não traduzidas de 6 genes, BGN, COX4I1, CYB5, PTGS2, RPE65
e SCD, ortólogos entre humano e bovino. Para tal, foi usado o algoritmo AVID para os alinhamentos e a
visualização foi feita pela ferramenta VISTA. Além das seqüências dos genes humanos e bovinos, inseriu-se
um terceiro organismo, o camundongo, para que fossem realizados alinhamentos múltiplos. Foi definido como
seqüências não-codificantes ativamente conservadas aquelas com identidade igual ou superior a 70% nos 3
alinhamentos – humano/bovino, humano/camundongo, bovino/camundongo. A maior porcentagem média de
identidade foi obtida na seqüência PTGS2 – 3UTR, com 66.6% de identidade e as seqüências CYB5 – 5UTR
e RPE65 – 3UTR não apresentaram alinhamentos, devido à baixa identidade entre suas seqüências. Portanto,
todas as seqüências analisadas apresentaram porcentagem de identidade abaixo daquela definida como mínima,
caracterizando assim regiões sem provável importância biológica.
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