UBA III – Biologia Molecular Aula prática 2 2012/2013 Maria José Correia [email protected] Sumário P2: • Aplicações biotecnológicas das enzimas de restrição • Eletroforese em gel de agarose • Avaliação do padrão de restrição obtido pela digestão de DNA λ com as enzimas PstI, EcoRI e HindIII. 11/10/2013 Enzimas de restrição – ferramentas básicas em biologia molecular • Tecnologia do DNA recombinante/ clonagem de genes • Farmacologia • Biotecnologia em processos industriais • Fingerprinting de DNA • Testes de paternidade • Investigações criminais e outras aplicações forenses • Manipulação de produtos transgénicos • Incremento valor comercial de espécies • Terapia génica • transferência direta de genes em humanos com fim terapêutico 11/10/2013 Eletroforese em gel de agarose • Separação de diferentes fragmentos de DNA em função da sua mobilidade num campo elétrico • Fatores que influenciam a migração de DNA em gel • Peso molecular • Conformação do DNA • Concentração de agarose • Voltagem aplicada • Composição do tampão de eletroforese http://www.sobiologia.com.br/conteudos/Biotecnologia/eletroforese.php 11/10/2013 4 Eletroforese: preparação do gel de agarose 1. Preparar uma solução de agarose em tampão TAE (1x) com concentração final de 1% (m/v). 2. Aquecer a mistura em microondas até toda a agarose se ter dissolvido. 3. Montar o suporte do gel na respetiva base de preparação do gel. 4. Colocar o pente formador de poços na posição correta. 5. Verter a agarose no suporte eliminando bolhas de ar que se tenham formado e deixar solidificar à temperatura ambiente. 6. Retirar o pente cuidadosamente para não danificar os poços. 7. Colocar o suporte na tina de eletroforese, de modo a que os poços estejam do lado do elétrodo negativo, e adicionar tampão TAE(1x) 11/10/2013 5 Electroforese: preparação das amostras 1. Adicionar tampão de carga às reações de digestão (L, P, E e N) • este vai conferir densidade à amostra, facilitando a sua aplicação nos poços 2. Aplicar as amostras nos respetivos poços com uma micropipeta, evitando a contaminação dos poços adjacentes. 3. Reservar um dos poços para aplicar marcador de pesos moleculares (para referência) 4. Colocar a tampa na tina e verificar se a migração das amostras se dá no sentido cátodo-ânodo (preto-vermelho). 5. Estabelecer a corrida a 100V durante 30 minutos. 6. Depois da corrida, desligar a tina e retirar o gel e colocá-lo numa tina com corante. 7. Lavar o gel com água (40-55ºC) 8. Examinar os resultados. 11/10/2013 6 Registo e análise dos resultados • Medir a distância “poço – banda” • registar valores na tabela x y x y 11/10/2013 7