Estrutura e função de proteínas Colágeno Anticorpo IgG1
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Estrutura de Proteínas Insulina Aminoácidos: componentes das proteínas O DNA é uma molécula informacional: cada códon (sequência de três nucleotídeos) codifica um único residuo de aminoácido na proteína. ala asn asp cys gln arg gly glu phe his ile leu lys pro ser thr met tyr trp val Como as proteínas são construídas Os aminoácidos são unidos por ligações peptídicas com a liberação de uma molécula de água e passam a ser denominados resíduos A cadeia polipeptídica se dobra devido aos graus de liberdade da ligação e dos resíduos originando uma estrutura tridimensional funcional phe ile ile val val tyr val ψ φ ala phe val ile tyr trp ile Estrutura e função de proteínas As proteínas são moléculas essenciais para a estrutura e função das células, desempenhando ampla variedade de funções biológicas A função das proteínas é totalmente dependente de sua estrutura tridimensional Enzimas são proteínas que catalizam reações químicas no metabolismo Anticorpo IgG1 Adenilato kinase Colágeno Hemoglobina Insulina Estrutura Primaria Estruturas Secundarias Pontes de Hidrogênio a-Helice Estrutura Beta Estrutura Beta antiparalela Estrutura Beta paralela Estrutura Volta Proporções Relativas dos diversos AA nas Estruturas 2as. Estrutura Terciaria Mioglobina Grupo Heme Grupo Prostético Miniproteínas Nome Classificação PDB ID Nº de Resíduos Stable Mini-Protein A Domain, Z34C Ponte Dissulfeto 1ZDD 34 Avian Pancreatic Polypeptide Íon Complexante 1PPT 36 TRP-Zipper Empilhamento Aromático 1LE0 12 TRP-Cage Núcleo Hidrofóbico 1L2Y 20 Villin Headpiece Núcleo Hidrofóbico / DAminoácido 1VII 35 Figura Instantâneos da simulação por dinâmica molecular do folding da miniproteína villin headpiece (Duan e Kollman, 1998) Domínios Diferentes “porções” tridimensionais dentro de uma mesma cadeia polipeptídica 2 domínios cadeia única Estrutura Quaternária Arranjos de várias cadeias polipeptídicas com estruturas Terciárias definidas. Presente em proteínas Globulares e Fibrosas Dímero Tetrâmero globular Hemoglobina Catálise de Reação Química: Enzima enzima + substratos produtos Vírus Enovelamento ( Pentapeptideo ) Resíduos de Aminoácidos modificados Banco de Dados PDB • A Resource for Studying Biological Macromolecules • The PDB archive contains information about experimentally-determined structures of proteins, nucleic acids, and complex assemblies. As a member of the wwPDB, the RCSB PDB curates and annotates PDB data according to agreed upon standards. • The RCSB PDB also provides a variety of tools and resources. Users can perform simple and advanced searches based on annotations relating to sequence, structure and function. These molecules are visualized, downloaded, and analyzed by users who range from students to specialized scientists. FIM
