Quimotripsina COMPLEMENTARIDADE ENTRE DIIDROFOLATO REDUTASE ES SEUS SUBSTRATOS Amarelo: tetraidrofolato Vermelho: NADP+ “BASTÃO-ASE” DGM contribuido pelas interações entra e enzima e o estado de transição Cinêtica Enzimática Michaelis-Menten k1 kcat E + S ES E + P k-1 V = kcat[ES] Assumir que: d[ES]/dt = 0 k1[E][S] – k-1[ES] – kcat[ES] = 0 [E]tot = [E] + [ES] Vmax = kcat x [E]totKM = k-1/k1 Vo = Vmax[S] = kcatx[E]totx[S] Km+[S] Km+[S] Diagrama Lineweaver-Burk (Duplo-reciprocal) INIBIÇÃO COMPETITIVO: substrato e inibidor competem para o mesmo sítio Km kcat Vo = Vmax[S]/(aKm + [S]) a = 1 + [I]/KI Vo = Vmax[S]/(Km + a’[S]) Quando [S]>>Km, Vo = Vmax/a’ a’ = 1 + [I]/K’I INIBIÇÃO NÃO-COMPETITIVO: substrato e inibidor competem para sítios diferentes; inibidor somente liga ao complexo ES Vo = Vmax[S]/(aKm + a’[S]) Diagrama Lineweaver-Burk para inibição competitiva a = 1 + [I]/KI Diagrama Lineweaver-Burk para inibição não-competitiva Diagrama Lineweaver-Burk para inibição mista ativa inativa EH+ E + H+ pKa = 3,5 inativa ativa inativa EH22+ EH+ + H+ E + 2H+ pKa = 6,0 pKa = 9,0 Quimotripsina Quimotripsina vermelha: ser195, asp 102, his57 Quimotripsina vermelha: ser195, asp 102, his57 Sítio ativo de quimotripsina HEXOQUINASE Sem glicose Com glicose Inibição “Feedback” Alosteria: curva sigmoidal de uma enzima homotrópica: o substrato age como uma moduladora positiva Alosteria: curvas sigmais de uma enzima em que moduladoras positivas e negativas modificam K0.5 sem modificar Vmax. Alosteria: curvas sigmoidais de uma enzima em que moduladoras positivas e negativas modificam Vmax Sem modificar K0.5 (menos comum). Estrutura da mioglobina (153 aminoácidos, MW = 16700 Da) Estrutura básica das Porfirinas 4 anels de pirrole conectados por pontes de =C- HEME = Prorporfirina IX HEME His próximal P + L PL Ka = [PL]/[P][L] = 1/Kd q = [PL]/{[PL]+[P]} P + L PL Ka = [PL]/[P][L] = 1/Kd q = [PL]/{[PL]+[P]} Ka = constante de associação, Kd = constante de dissociação = 1/Ka Fração de sítios ocupados = q q = [PL]/{[PL]+[P]} q = Ka[P][L]/{Ka[P][L]+[P]} q = Ka[L]/{Ka[L]+1} q = [L]/{[L]+1/Ka} q = [L]/{[L]+Kd]} equação tipo x = y/(y+z) descreve uma hipérbola Quando [L]=Kd=1/Ka, q = 0,5 (50% dos sítios ocupados) Curva de ligação de oxigênio a mioglobina P50 = 0,26 kPa q= fração dos sítios ocupados com ligantes q= [L]/{[L]+Kd]} q= [02]/{[02]+ [02] 50} q=p02/{p02+P50} Ligação de oxigênio a heme Ligação de monôxido de carbono a heme Aminoácidos chaves de mioglobina que interagem com heme e O2 His distal His proximal Conservado em todas as globinas Conservado nas três estruturas Interações entre subunidades em hemoglobina Contatos a1-b1 mudam pouco quando O2 liga Contatos a1-b2 Contatos a1-b2 no estado T INTERAÇÕES IÔNICAS NO ESTADO T da Hb Ligação de oxigênio a hemoglobina Curva hiperbólica de Ligação de baixa afinidade Curva sigmoidal de Ligação cooperativa Curva hiperbólica de Ligação de baixa afinidade Dois modelos moleculares para explicar ligação cooperativa T R Modelo MWC Monod, Wyman Changeux (“simultânea”) Modelo “sequencial” Efeito Bohr (Christian, pai e médico; não Niels, filho e físico) Hb + O2 HbO2 Sangue no pulmão HHb+ + O2 HbO2 + H+ Logo nos tecidos internos onde [H+] é alto, H+ liga a Hb e causa a dissociação de O2. Sangue nos tecidos internos H+ e O2 ligam em sítios diferentes: -O2 liga no Fe do grupo heme -H+ liga em vários grupos de aminoácidos que estabilizam o estado T (baixa afinidade para O2) ie: His146(+) ..... Asp94(-) CO2 + H2N----(a-amino da cadeia) H+ + -O2C-NH---terminal “carbamino” Contribui para o efeito Bohr [BPG] alta em hemácias HbO2 + BPG HbBPG + O2 HbO2 + BPG HbBPG + O2 No nível de mar, a diferença entre pO2 nos pulmões e nos tecidos permite o sangue soltar ~40% da sua capacidade de O2 nos tecidos. Em altitudes altas, o forneciemnto de O2 diminuiria para 30% de capacidade sanguina.... Para compensar, a [BPG]aumenta e a afinidade da Hb para O2 cai, resultando no aumento de fornecimeno de O2 para os tecidos até ~40% de sua capacidade. O estado T da Hb tem um sítio para BPG (cargas positivos em azul) O estado R da Hb perdeu seu sítio para BPG Hemácias normais Variação de formas de hemácias em anemia falsiforme Anemia falsiforme: uma doença molecular Glu6 Val na cadeia beta Glu6 Val na cadeia beta resulta num superfície hidrofóbico que promove associação entre moléculas para formar filamentos e fibras