Lista de Exercícios 2 – Aminoácidos e Proteínas
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Lista de Exercícios 2 – Aminoácidos e Proteínas Globulares Curso: Bioquímica para Odonto / Bloco 1 (Profa. Lucia Bianconi) Aminoácidos 1. Qual dos seguintes aminoácidos tem a maior variação em solubilidade (em água) quando diminuímos o pH de 5 para 3? a) Arginina b) Prolina c) Tirosina d) Ácido Aspártico e) Asparagina 2. Com qual aminoácido foi obtida a curva de titulação abaixo? a) Alanina b) Ácido Glutâmico c) Lisina d) Histidina e) Serina 3. Indique o que está ocorrendo nos pontos A, B e C da curva de titulação ao lado. Qual o provável aminoácido usado nessa titulação? C Proteínas Globulares 1. Indique os efeitos prováveis na estrutura de uma proteína globular causados pelas seguintes mutações e explique suas razões: a. Leucina para Fenilalanina b. Metionina para Cisteína c. Valina para Treonina d. Glicina para Alanina e. Metionina para Prolina 2. Dado os seguintes polipeptídeos: I. Ala-Phe-Tyr-Phe-Ala-Met-Gly-Ser-Trp-Gly-Thr II. Ala-Glu-Phe-Met-Ile-Arg-Val-Cys-Leu-Ala-Pro-Gly-Met a. Que tipo de estrutura secundária seria mais provavelmente encontrada para cada polipeptídeo? Explique. b. Qual a consequência na estrutura do peptídeo II se fosse provocada uma mutação e o resíduo de Arg fosse trocado por Asp? c. Explique como a presença de um resíduo de Pro no peptídeo II possibilita a formação de uma dobra-β. 3. A termolisina é uma protease (enzima que degrada proteínas) que contém um íon de Zn2+ essencial para sua função. A posição correta desse íon na proteína é mantida pela interação com as cadeias laterais de três resíduos de aminoácidos: H142, H146 e E166. a) Descreva a proteína em termos estruturais (estrutura secundária e terciária). b) Explique como os aminoácidos em posições distantes da cadeia polipeptídica (142, 146 e 166) podem manter a interação com o Zn2+, com distâncias de poucos ângstroms entre eles. H142 H146 E166 4. A alfa1-antitripsina (AAT) é uma proteína de 52 kDa sintetizada no fígado, que atua como um inibidor natural de proteases (enzimas que degradam proteínas). A deficiência em AAT leva à enfisema pulmonar e cirrose hepática. A enfisema pulmonar ocorre porque a AAT é um inibidor responsável por inativar a elastase, uma protease que degrada elastina, que é a proteína responsável pela elasticidade do tecido pulmonar. A deficiência em AAT é causada pela mutação pontual E342K, ou seja, o resíduo de glutamato (E) na posição 342 foi trocado por um resíduo de lisina (K). Como consequência da mutação, a proteína se agrega no fígado, onde é sintetizada, levando à cirrose hepática. Discuta as causas da agregação da proteína mutante quando ela é sintetizada. 5. Muitas doenças degenerativas, como o Mal de Alzheimer, a Doença de Parkinson, a Doença de Huntington, a Esclerose Lateral Amiotrófica e a Doença do Príon (vaca louca), são causadas por agregação protéica. Os agregados (amilóides ou placas amiloidogênicas) são formados por fibras protéicas, contendo uma proteína com estrutura em folhas-β. A conformação original da proteína é em alfa-hélice e a mudança da conformação de alfa para beta leva à agregação da molécula. EXPLIQUE porque a proteína não agrega na sua forma original e porque ela agrega quando ocorre a mudança conformacional αβ.
