IV Encontro de Ciências Biológicas da Universidade Estadual de Londrina “2013 – Ano Internacional de Cooperação pela Água (06/08/2013 – 10/08/2013)” OLIGONUCLEOTÍDEOS INICIADORES UNIVERSAIS Área Temática: NA AVALIAÇÃO DA POPULAÇÃO BACTERIANA EM Genética ECOSSISTEMAS COMPLEXOS HENRIQUE, F. C.; COSTA, G. N.; VILAS-BOAS, L. A.; MIGLIORANZA, L. H. S. Universidade Estadual de Londrina. [email protected] Palavras-chave: RNA ribossomal, PCR, Microbiota fecal Resumo Abordagens envolvendo o RNA ribossomal da subunidade menor do ribossomo tornaram-se um método padrão para se determinar a composição da comunidade microbiana. O gene codificante para o RNA ribossomal 16S é considerado o biopolímero mais adequado para estudos de diversidade, visto que é essencial para a sobrevivência dos organismos e altamente conservado entre as espécies. Além disso, este gene pode ser obtido diretamente de uma amostra sem necessidade de procedimentos de cultura, o que permite a detecção de basicamente todos os membros do ecossistema, incluindo aqueles que não são cultiváveis. A aplicação de oligonucleotídeos iniciadores universais para amplificação direta do rRNA 16S, por meio de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) do DNA total de uma comunidade microbiana, combinada com tecnologias de clonagem e sequenciamento têm gerado uma vasta quantidade de dados sobre a diversidade de procariotos em ecossistemas microbianos complexos. Na presente investigação, foram analisadas a presença bacteriana e possíveis alterações no perfil da microbiota fecal durante e após o consumo de leite fermentado probiótico. A linhagem Lactobacillus plantarum – Lp 115 foi utilizada para produção de leite fermentado e o produto aplicado em um estudo clínico envolvendo 61 indivíduos, os quais receberam diariamente doses do leite fermentado contendo 2 x 1011 UFC/dose da espécie alvo por noventa dias. Amostras fecais foram fornecidas no início, durante e após a interrupção da terapia. O DNA das amostras fecais de 10 indivíduos selecionados, nos 3 períodos de ingestão, foi extraído e o gene codificante para o RNA ribossomal 16S amplificado por meio da técnica de PCR com a utilização de oligonucleotídeos iniciadores universais (fD1, rD1). Após obtenção das bandas de amplificação entre 275 a 1500 pb, foram verificadas variações em função do consumo do leite fermentado, por meio da análise comparativa dos 3 períodos de ingestão. Os dados deste trabalho demonstraram alterações no perfil da microbiota fecal dos indivíduos submetidos ao tratamento e, consequente, sensibilidade e eficiência da PCR em conjunto com o marcador molecular 16S rRNA na amplificação do universo bacteriano em amostra de ecossistema complexo. Apoio Financeiro: CNPq