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EMENTÁRIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOENGENHARIA
1. TÓPICOS METODOLÓGICOS
Nome da disciplina: ESTRUTURA E ULTRAESTRUTURA CELULAR
Domínio: metodológica
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Código: MET01
Oferecimento: 10 trimestre
Docentes: Prof. José Batista de Jesus
Ementa: Fundamentos técnicos de microscopias ópticas e eletrônicas. Microscopias ópticas: campo claro,
campo escuro, polarização, contraste de fase, contraste interferencial de Nomarski e fluorescência.
Microscopias eletrônicas: transmissão e varredura. Preparo de material biológico para microscopias ópticas e
eletrônicas: congelamento, fixação, pós-fixação, desidratação, secagem e contrastação eletrônica.
Introdução à Microscopia de Varredura por Sonda (Scanning Probe Microscopy - SPM)
Bibliografia:
Alberts B., Johnson A., Lewis J. Raff M., Roberts K, and Walter P. Molecular Biology of the Cell (5 th Edition).
Chapter 9. Garland Science, USA. 2008.
Machado R.D. Microscopia Óptica. Brochura. UFRJ-Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, 1976.
Lacey A.J. (Editor). Light Microscopy in Cell Biology: a pratical approach (2nd Edition).Oxford University Press.
1999.
Davidson M.J. Optical microscopy primer. Disponível em http://www.micro.magnet.fsu.edu/primer/
Arimoto R., and Murray J.M. A common aberration with water-immersion objective lens. J. Microsc. 216: 4951, 2004.
De Souza W. (Editor). Técnicas Básicas de Microscopia Eletrônica aplicada às Ciências Biológicas.
Sociedade Brasileira de Microscopia Eletrônica; Universidade Estadual do Norte Fluminense, 1998.
Waters J.C., and Swedoww J.R. Interpreting fluorescence microscopy images and measurements. In
Evaluating Techniques in Biochemical Research. Zuk D. (Editor). Cell Press, 2007.
Nome da disciplina: MODELAGEM COMPUTACIONAL
Domínio: metodológica
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Código: MET02
Oferecimento: 10 trimestre
Docentes: Prof. Antonio Marcio Rodrigues
Ementa: Processos discretos em biologia; Aplicações de equações de diferenças à biologia populacional;
Processos contínuos e equações diferenciais ordinárias; Aplicações a modelos contínuos de dinâmicas de
populações; Modelos de eventos moleculares; Sistemas distribuídos espacialmente e modelos de equações
diferenciais parciais; Modelos de equações diferenciais parciais em biologia.
Bibliografia:
Edelstein-Keshet, L.; Mathematical models in biology; Classics in applied mathematics; SIAM, 2005.
Nome da disciplina: BIOQUÍMICA
Domínio: metodológica
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Código: MET03
Oferecimento: 10 trimestre
Docentes: Prof. Iola Gonçalves Boechat
Ementa: Propriedades coligativas das soluções. Determinacão de massa molecular de proteínas:
eletroforese em uma dimensão. Discriminacão de spots proteicos em diferentes pH: eletroforese em duas
dimensões. Marcacão isotópica de proteínas e oligopeptídeos. Fundamentos de cintilacão líquida.
Fundamentos de cromatografia e análise de cromatogramas. Fundamentos de zimografia e análise de
zimogramas. Cromatografia em camada fina e expressão lipídica em células eucarióticas
Bibliografia:
Voet, D.; Voet, J.G. (3ª edição) Biochemistry
Nome da disciplina: BIOLOGIA MOLECULAR
Domínio: metodológica
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Código: MET04
Oferecimento: 10 trimestre
Docentes: Profs. Ivan Carlos dos Santos, Ana Paula Madureira e José Batista de Jesus
Ementa: Sequenciamento de DNA, eletroforese de ácidos nucléicos, restrição enzimática e tecnologia do
DNA recombinante, tipos vetores de clonagem, transfecção celular, hibridizações, PCR, RT-PCR, PCR em
tempo real, genes repórteres, bibliotecas genômicas, microarranjos de DNA, imunoprecipitação de cromatina
(CHIP), SELEX, RNAi, animais e plantas transgênicos.
Bibliografia:
Genes VIII. B. Lewin e Molecular Biology of the Gene (última edição) de Watson, Hopkins, Roberts, Steitz e
Weiner.
Molecular Cell Biology. Arnold Berk, S. Lawrence Zipursky, Paul Matsudaira, David Baltimore, James Darnell,
Harvey F. Lodish W H Freeman (1999)
The Cell: A Molecular Approach Geoffrey M. Cooper Sinauer Associates Incorporated (2003).
Nome da disciplina: BIOFÍSICA
Domínio: metodológica
Código: MET05
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Oferecimento: 10 trimestre
Docentes: Prof. Mário Antônio Duarte
Ementa: Introdução a membranas celulares. Introdução a mecanismos de transporte transmembrânico.
Solutos concorrentes e transporte. Transportes mediante carreadores. Transporte iônico e potencial de
repouso. Equilíbrio homeostático. Mecanismos de difusão em tecidos biológicos. Fundamentos de
termondinâmica e aplicações a sistemas biológicos. Descrição de algumas Medidas experimentais dos
mecanismos intracelulares. Modelos de viscosidade e elasticidade para a célula. Microscopia de
fluorescencia e aplicações em sistemas biológicos.
Bibliografia:
Weiss, T.F.; Cellular Biophysics - Transport, MIT Press, 1995
Giebisch, G.; Tosteson, D.C. & Ussing, H.H.; Membrane Transport in Biology, Springer Verlag, vol.1, 1978.
Boyce, W.E. e Diprima, R.C.; Equações diferenciais elementares e problemas de valores de contorno;
Editora Guanabara,; 1995.
Jonathon Howad; Mechanics of Motor Proteins and the Cytoskeleton
Mohammad R. K. Mofrad and Roger Kamm; Cytoskeletal Mechanics: Models and Measurements (Cambridge
Texts in Biomedical Engineering).
W. James Nelson, Arnost Kleinzeller, and Dale J. Benos; Membrane Protein Cytoskeleton Interactions
(Current Topics in Membranes).
Nome da disciplina: ANÁLISE ESTATÍSTICA DE DADOS
Domínio: metodológica
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Código: MET06
Oferecimento: 10 trimestre
Docentes: Prof. Bjorn Gucker
Ementa: Amostragem de dados, índices de riqueza e diversidade, modelos de distribuição e distância.
Métodos paramétricos e não paramétricos para análises de variância entre dois ou mais grupos de amostras
independentes e dependentes. Análises de co-variância. Análises paramétrica e não-paramétrica de
correlação. Análise de regressão linear simples e múltipla. Análises multivariadas descritivas e ordenativas
(PCA, Cluster, MDS, Correlação Canônica e Análise Discriminante). Análises de padrões espaciais de
distribuição e abundância. Análises da afinidade de espécies e classificação de comunidades. Meta-análise
em ecologia. Modelos Nulos.
Bibliografia:
Díaz, F. R. e López, F. J. B. (2007) Bioestatística. Thomson Learning.
Ludwig, J. A. & Reynolds, J. F. (1988) Statistical Ecology. A primer on methods and computing. Wiley
Interscience.
Magurran, A. E. (2004) Measuring Biological Diversity. Blackwell Publishing.
Quinn, G. P. & Keough, M. J. (2002) Experimental Design and data analysis for biologists. Cambridge
University Press.
Ruxton, G. D. & Colegrave, N. (2006) Experimental design for the life sciences, 2 a ed., Oxford University
Press.
Zar, J. H. (1999) Biostatistical analysis, 4a ed., Pearson Education.
Nome da disciplina: QUÍMICA ANALÍTICA APLICADA A BIOSSISTEMAS
Domínio: metodológica
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Código: MET07
Oferecimento: 10 trimestre
Docentes: Prof. Rogério Martins Maurício
Ementa:
Bibliografia:
Nome da disciplina: ANÁLISE ESTATÍSTICA DE DADOS II
Domínio: metodológica
Creditos (carga horaria): 03 (45h)
Docentes: Prof. Ana Paula Madureira
Ementa:
Bibliografia:
Código: MET08
Oferecimento: 10 trimestre