SEMINÁRIOS DE MICROBIOLOGIA 1. As Archaea Objectivos: - Definição e classificação de Archaea (posição taxonómica actual). - Habitats onde se encontram estas bactérias? - Em que se distinguem das Bactéria? - Como podem ser estudadas? - Quando teriam aparecido no planeta Terra? - Indicar alguns exemplos de cada grupo, nomeadamente, halófilas, hipertermófilas, metanogénicas? - Qual a importância destas bactérias nos ecossistemas? Bibliografia: - Gribaldo, S, Brochier-Armanet, C (2006). The origin and evolution of Archaea: a state of the art. Phil. Trans. R. Soc. 361: 1077-1022. - Oren, A (1999). Microbiological studies in the Dead Sea: future challenges toward the understanding of life at the limit of salt concentrations. Hydrobiologia 405: 1-9. 2. Os microrganismos e os alimentos Objectivos: - Microrganismos benéficos: - Qual o papel das bactérias do ácido láctico na produção de salsichas? - O que se entende por bactérias do ácido láctico? - Qual das bactérias estudadas no artigo de Lee e co-autores, indicou os melhores resultados? - Microrganismos patogénicos: - Que microrganismos foram detectados em peixes e mariscos da costa da Turquia? - Como foram isolados e identificados? - Que efeitos poderão ter esses microrganismos no homem? Bibliografia: - Lee, JY, Kim, CJ, Kunz, B (2006). Identification of lactic acid bacteria isolated from Kimchi and studies on their suitability for application as starter culture in the production of fermented sausages. Meat Science 72: 437-445. - Colakoglu, FA, Sarmasik, A, Koseoglu, B (2006). Occurrence of Vibrio spp. And Aeromonas spp. in shellfish harvested off Dardanelles cost of Turkey. Food Control 17: 648-652. 3. Bactérias com importância na saúde humana Objectivos: - Caracterização do género Listeria - Isolamento e identificação de Listeria (espécies estudadas no artigo) - Importância da Listeria no homem: patogenicidade, transmissão. - Quais as bactérias implicadas na tonsolite, prevenção e tratamento. Bibliografia: - Parihar, VS, Barbuddhe, SB, Danielsson-Tham, Tham, W (2008). Isolation and characterization of Listeria species from tropical seafoods. Food Control 19: 566–569 - Brook, I (2005). The role of anaerobic bacteria in tonsillitis. International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology 69: 9-19. 4. Vírus patogénicos do homem Objectivos - Caracterizar sucintamente o vírus HIV e os vírus do tracto respiratório (classificação e morfologia e tipo de replicação) - Efeitos patogénicos no homem - Modo de transmissão (por contacto, pelo ar, água….) - Tratamento e controle - Vacinação? - Distribuição geográfica Bibliografia - Gavin et al (2006). Factors associated with HIV infection in adolescent females in Zimbabwe. Journal of Adolescent Health 39: 596.e11-596.e18. - Wit, E, Fouchier, RAM (2008). Emerging influenza. Journal of Clinical Virology vol.41: 1-6. 5. Microrganismos indicadores da qualidade da água Objectivos: - O que se entende por microrganismo indicador de qualidade de água - Quais os indicadores de qualidade da água do mar (Banho) e de água para consumo. - Como se determina a qualidade da água com base nos indicadores. - Bordalo, A (2003). Water Research 37: 3222-3241 - Kay et al (2004). Derivation of numerical values for the World Health Organization guidelines for recreational waters. Water Research 38: 1296–1304 - Vivier, JC, Ehlers, MM, Grabow, WOK (2004). Detection of enteroviruses in treated drinking water. Water Research 38: 2699–2705 6. Protozoários Zoonóticos Objectivos: - O que se entende por protozoário zoonótico. - Quais os protozoários zoonóticos tratados nos artigos. - Breve caracterização desses protozoários - Como se transmitem ao homem e quais os problemas que causam. Bibliografia: - Fayer, R., Dubey, JP, Lindsay, DS (2004). Zoonotic protozoa: from land to sea. Trends in Parasitology 20,11: 531-536. - Hunter, PR, Thompson, RCA (2005). The zoonotic transmission of Giardia and Cryptosporidium. International Journal for Parasitology 35: 1181-1190. 7. Controle de Microrganismos Objectivos: - Tipo de radiação utilizada e que microrganismos se pretendia controlar? - Quais os microrganismos que podem estar presentes nos fertilizantes orgânicos. - O tipo de radiação utilizada foi ou não efectiva? - Quais os factores que poderão estar na origem da resistência a antibióticos pelas bactérias? - Quais os principais mecanismos de acção das famílias de antibióticos abordados no artigo de Alanis? Bibliografia: - Alanis, AJ (2005). Resistance to Antibiotics: Are we in the post-antibiotic era? Archives of Medical Research 36: 697-705 - Hye-Jeong Yun, Sang-Yong Lim, Hyun-Pa Song, Byung-Keun Kim, Byung-Yeoup Chung, Dong-Ho Kim (2007). Reduction of pathogenic bacteria in organic compost using gamma irradiation. Radiation Physics and Chemistry 76 (2007) 1843–1846 8. Técnicas de identificação de microrganismos Objectivos: - Relativamente a técnicas moleculares de identificação quais os genes utilizados na identificação? - Em que consiste e quais as vantagens da regions UARR (Universal Amplified Ribosomal Region)? -Qual a importância da bactéria Pseudomonas aeruginosa? - Quais os métodos fenotipicos utilizados na sua identificação? -Quais os métodos moleculares utilizados na identificação desta bactéria? -O estudo recomenda o uso de técnicas fenotipicas ou moleculares? Porquê? Bibliografia: - Atzél, B, Szoboszlay,S, Mikuska, Z, Kriszt, B (2008). Comparison of phenotypic and genotypic methods for the detection of environmental isolates of Pseudomonas aeruginosa. International Journal of Hygiene and Environmental Health 211: 143155. - Rivas, R., Velázquez, E., Zurdo-Pin˜eiro, ZL, Mateos, PF, Martínez,E., Molina, EM (2004). Identification of microorganisms by PCR amplification and sequencing of a universal amplified ribosomal region present in both prokaryotes and eukaryotes. Journal of Microbiological Methods 56: 413– 426 Artigos disponíveis com a docente, podem ser enviados por e-mail para um aluno do grupo de trabalho, ou descarregados da base de dados www.sciencedirect.com