UNIVÉRTIX CURSO AGRONOMIA MICROBIOLOGIA DO SOLO NUTRIÇÃO MICROBIANA PROFESSORA: MARIA LITA Nutrição microbiana Quais os Componentes necessários às células? Quais os Meios de cultura? Quais as Condições ambientais? Introdução Nutrição de microrganismos → Nutricionalmente são os mais versáteis e diversificados → Alguns podem viver substâncias inorgânicas com poucas → Outros são tão exigentes quanto o homem INTRODUÇÃO De todos os organismos vivos, os micror anismos são os mais versáteis e diversific ados em Suas exigências nutricionais. Todos os organismos vivos compartilha em algumas necessidades nutricionais em comum -carbono -nitrogênio - água Introdução Para caracterizar suas propriedades (morfológicas, fisiológicas e bioquímicas) é necessário o cultivo em laboratório: - Cultivo in vitro: se conhece as exigências nutricionais - Cultivo in vivo: não se conhece as exigências nutricionais Exemplo de microrganismos que precisam hospedeiro para ser cultivado: - Mycobacterium leprae (causador da hanseníase) - Glomus clarum (fungo simbionte) de Necessidade de meios de cultura adequados Para o cultivo laboratorial (in vitro) são utilizados meios de cultura que simulam e até melhoram as condições naturais. Os elementos químicos principais para o crescimento das células são denominados macronutrientes (C, N, H, O, S, P). O carbono é um dos elementos mais importante para o crescimento microbiano. Com exceção para CO2, os compostos orgânicos são os que contém carbono Macronutrientes: Necessários em grande quantidade. Tem papel importante na estrutura e metabolismo Micronutrientes: - Necessários em quantidades mínimas. Funções enzimáticas e estruturais biomoléculas C N H P, S, K, Na ... célula Matéria seca Água das Componentes necessários às células Macronutrientes Fonte de carbono: - Compostos orgânicos (microrganismos heterotróficos): carboidratos lipídeos proteínas - Dióxido de carbono (microrganismos autotróficos): É a forma mais oxidada do carbono, assim a fonte de energia deve vir da luz ou de outros compostos inorgânicos. Fonte de Nitrogênio - É elemento necessário em maior quantidade depois do carbono, cerca de 12 %. (constituinte das proteínas, ácidos nucléicos, etc.) moléculas orgânicas (aminoácidos, peptídeos) moléculas inorgânicas A capacidade de algumas bactérias em utilizar o nitrogênio atmosférico (FBN) é (NH3, NO3-, N2) de fundamental importância para a vida de todos os seres. Componentes necessários às células Hidrogênio: - Principal elemento dos compostos orgânicos e de diversos inorgânicos (água, sais e gases) Função: Manutenção do pH Formação de ligações de H entre moléculas Fonte de energia nas reações de oxi-redução na respiração Oxigênio: Elemento comum encontrado nas moléculas biológicas (aminoácidos, nucleotídeos, glicerídeos) É obtido a partir das proteínas e gorduras. Na forma de oxigênio molecular (O2), é requerido por muitos para os processos de geração de energia. Componentes necessários às células Outros macronutrientes: P – Síntese de ácidos nucléicos, ATP S – Estabilidade de aminoácidos, componente de vitaminas K – Estabilidade dos ácidos nucléicos, bomba de Na/K Mg – Estabilidade dos ribossomos Ca – Estabilidade da parede termoestabilidade de endósporos celular e Componentes necessários às células Na – Requerido em maior quantidade por microrganismos marinhos. Bactérias halofílicas extremas não crescem com menos de 15 % de sal. Fe - Papel-chave na respiração, componente dos citocromos e das no transporte de elétrons proteínas envolvidas Componentes necessários às células Micronutrientes Metais em quantidades muito pequenas (traços) na composição de um meio de cultura: Zn, Cu, Mn, Co, Mo e B ► Exercem função estrutural em várias enzimas (ativação) - Nem sempre sua adição é necessária - Meios sintéticos com compostos de alto grau de pureza e água ultra pura podem apresentar deficiências desses elementos. Ex: Mo+6 é necessário para a nitrogenase, a enzima que converte o N2 para NH3 durante a FBN. Água e outros aditivos Água: -Componente absolutamente indispensável (com exceção dos protozoários que englobam partículas sólidas) No laboratório de utiliza água destilada, filtrada e deionizada. Outros aditivos: Função de aumentar a conversão, evitar precipitação de íons, controlar a espuma, provocar inibição, estabilizar o pH: Quelantes: na autoclavagem ocorre precipitação dos fosfatos metálicos a EDTA, ácido cítrico, polifosfatos. Inibidores Ex: produção de ácido cítrico por Aspergillus niger Utiliza-se Fosfato e pH < 2 para reprimir o ácido oxálico Outros aditivos Tampões - Carbonato de cálcio - Fosfatos - Proteínas (peptona) Indutores: a maioria das enzimas de interesse comercial precisa de indutores. Ex: celulose induz a celulase pectina induz a pectinase amido induz a amilase Outros aditivos Antiespumantes: cultivos com aeração ocorre a produção de espuma Remoção de células, perda do produto, contaminação Redução do volume do meio álcoois, ácidos graxos, silicones, poliglicóis: reduzem a tensão superficial das bolhas Meios de cultura Soluções de nutrientes para promover o crescimento de microrganismos. Não existe um meio de cultura universal, mas Existem vários tipos meios para diversas finalidades Para obter sucesso no cultivo de microrganismos é necessário o conhecimento de suas exigências nutricionais, para que os nutrientes sejam fornecidos de forma e proporção adequada. Classes Quimicamente definidos purificados, água) (sais, compostos orgânicos Complexos (utilizam hidrolisados carne e soja, extratos de levedura, sangue, soro, leite, solo e rúmem de bovino) Meios de cultura Meios quimicamente definidos são utilizados para determinar as necessidades nutricionais Até 1880 os microrganismos eram cultivados em meios líquidos. Robert Koch introduziu os meios de cultura sólidos, os quais permitiram o estudo de espécies isoladas (culturas puras). Meio de cultura solidificado com 1,5 % de ágar. Controle é um meio mínimo com apenas glicose e sais. 3 isolados bacterianos sendo testados quanto a necessidade de suplementos orgânicos. Meios de cultura Embora não existam meios específicos para todos os microrganismos, existem centenas de formulações para inúmeras finalidades. Alguns são meios gerais: permitem o crescimento de muitas espécies Outros são meios específicos: servem para identificação de espécies, por ex. Escherichia coli e Shigella sonnei em meio MacConkey Meios especiais Meios para anaeróbios: adição de agentes redutores (tioglicolato de sódio) Meios seletivos: favorece o crescimento de um tipo particular ou suprime outros. Ex. meio ágar verde brilhante. Meios diferenciais: para diferenciar microrganismos dentro de uma cultura mista. Ex. meio com sangue para distinguir as hemolíticas. Meios especiais Meios seletivos/diferenciais: Ex. Meio McConkey que contém sais de bile e cristal violeta. Meios de enriquecimento: se objetiva o aumento de uma determinada espécie sem inibir as demais. Ex. isolar bactérias que oxidam fenol, fornecendo fenol como única fonte de carbono. Microplacas com diferentes meios de cultura para identificação de enterobactérias. Meios de cultura para bactérias Normalmente imitam o habitat normal Ex. Se a bactéria prefere os nutrientes encontrados no sangue, então o sangue é adicionado no meio de cultura. Meio definido para quimioautotróficas Meio definido para heterotróficas Meio complexo para heterotróficas Meios de cultura para fungos • Todos os fungos são heterotróficos - Geralmente são utilizados meios ricos contendo grande variedade de compostos orgânicos providos pela peptona e extratos de carne ou soja. - Também são utilizadas maiores concentrações de açúcares (4%) e pH menor (3,8 a 5,6) do que os meios para bactérias. - Essa combinação permite inibir o crescimento de bactérias. Meios de cultura para protozoários • Os protozoários são heterotróficos aeróbios com exigências nutricionais complexas Muitos não são cultivados in vitro. Os que são necessitam muitos complementos, como emulsões de tecidos cerebrais, soro fetal, infusão de fígado e células bacterianas. Ex: Tetrahymena pyriformis necessita de um meio contendo 10 aminoácidos, 7 vitaminas e sais inorgânicos. Tetrahymena pyriformis não é patogênico mas é utilizado em pesquisas médicas e biológicas. Meios de cultura para algas • As algas utilizam luz como energia, dióxido de carbono, água e íons inorgânicos solúveis. São fotoautotróficos. Ao contrário dos meios para bactérias e fungos, existem poucos meios prontos para algas. Preparar um meio definido para algas marinhas pode ser muito trabalhoso, pois muitos sais contidos na água do mar poderão ser necessários. Maré vermelha. Algas que produzem toxinas. Algas unicelulares