Criação de um ambiente computacional para a

CRIAÇÃO DE UM AMBIENTE COMPUTACIONAL PARA A CARACTERIZAÇÃO DE FAGOS
EM GENOMAS BACTERIANOS COMPLETOS.
Ailton Lopes de Sousa (Bolsista PIBIC/CNPq) – [email protected]
Bacharelado em Sistemas de Informação - Universidade Federal do Pará
Prof. Dr. Artur Luiz da Costa da SILVA (Orientador) – [email protected]
Faculdade de Biotecnologia, Instituto de Ciências Biológicas.
O surgimento das plataformas de sequenciamento de segunda geração, também conhecidas
como NGS, possibilitaram o sequenciamento de genomas completos com redução de custo e
de tempo de sequenciamento. Em consequência disto, os genomas bacterianos passaram a
ser sequenciados a um ritmo bastante acelerado que resultou no crescimento do depósito dos
genomas desses organismos em bancos de dados públicos, onde muitos desses genomas
contêm o DNA de fago integrado em seu cromossomo bacteriano. Os fagos, também
conhecidos como bacteriófagos, são vírus que infectam bactérias e têm contribuído para o
desenvolvimento de produtos biotecnológicos devido o seu potencial para serem utilizados
como antibacterianos, sistemas de visualização de fagos e veículos para a entrega de vacinas,
bem como para diagnósticos (Fagotipagem).
A identificação de profagos pode ser realizada por ferramentas computacionais, por isso este
estudo propõe o PhageWeb: uma ferramenta computacional para Web com uma interface
gráfica que permite desempenhar suporte a caracterização de fagos em bactérias do grupo
CMNR (Corynebacterium, Mycobacterium, Rhodococcus e Nocardia). Para realizar a busca por
fagos, criou-se um banco de dados específico com genomas completos de bacteriófagos do
grupo CMNR e por meio de buscas por homologia e da integração de informações biológicas
pelos serviços de webservices de outras aplicações, é possível identificar a existência de fagos
em genomas de bactérias e ainda, por exemplo, visualizar informações referentes aos
domínios e famílias protéicas destes organismos. O PhageWeb também disponibiliza
resultados em saída gráfica que dá suporta ambas as visões genômicas (circulares e lineares),
e também todos seus resultados podem ser exportados para diversos formatos de interesse.
Palavras-chaves: fagos, genômica, bioinformática.
Título do projeto o orientador: Análise da genômica Funcional de Corynebacterium
pseudotuberculosis Biotipos Ovis e Equi sob diferentes condições de estresse biologicamente
relevantes.
Classificação do trabalho na Tabela de Áreas do Conhecimento no CNPq.
Grande-área: Ciências Biológicas.
Área: Biologia Geral
Sub-área: Bioinformática.