Resumo - Sociedade Botânica do Brasil

CONGRESO
LXV CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA
BOTÁNICA
XXXIV ERBOT - Encontro Regional de Botânicos MG, BA, ES 18 A 24 DE OUTUBRO DE 2014 - SALVADOR - BAHIA - BRASIL
Latinoamericano de
Botânica na América Latina: conhecimento, interação e difusão
IDENTIFICAÇÃO E ANCORAGEM DE GENES DE
RESISTÊNCIA TIR-NBS-LRR NO GEMONA DO
FEIJÃO-CAUPI
AUTOR(ES):Ana Maria Benko-Iseppon;Flávia Tadeu de Araújo;João
Pacífico Bezerra Neto;Lidiane Lindinalva Barbosa Amorim;Ana Carolina
Wanderley-Nogueira;
INSTITUIÇÃO:
Universidade Federal de Pernambuco – UFPE - Centro de Ciências Biológicas
Departamento de Genética - Laboratório de Genética e Biotecnologia
Vegetal
O feijão-caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp.], leguminosa adaptada a
condições ambientais adversas, destaca-se como importante fonte de
proteína na região Norte e Nordeste do Brasil. Devido às perdas geradas
pelos estresses bióticos, fazem-se necessários estudos que possam
identificar genes envolvidos nas respostas de defesa. O objetivo desse
trabalho é identificar genes de resistência TIR-NBS-LRR (Toll Interleukine
Receptor- Nucleotide Binding Site - Leucine Rich Repeat) no genoma do
feijão-caupi, bem como ancorá-los no pseudogenoma de feijão-comum
(Phaseolus vulgaris, L.), inferindo sobre sua abundância e distribuição no
genoma. Para isso, sequências proteicas da região TIR-NBS-LRR foram
submetidas a um tBLASTn (cut-off de 1e-10) contra o banco de dados do
feijão-caupi (NordEST), visando identificar possíveis ortólogos nesta
espécie. Os transcritos obtidos foram então anotados, traduzidos
(OFR-Finder) e analisados em termos de seus domínios conservados
(CD-search). Em seguida, os candidatos foram alinhados via Clustal Ômega,
sendo seus motivos identificados através da ferramenta MEME. A
ancoragem destes no pseudogenona do feijão-comum foi realizada por meio
do Webbrowser Phytozome. A mineração identificou 17 sequências da
subfamília TIR-NBS-LRR, todas com os domínios completos. O tamanho
dessas proteínas variou entre 123 a 1.324 aminoácidos. Na análise de
estrutura do domínio NBS, foi possível detectar seis motivos conservados:
p-loop, NBS-II, Kinase-2, Kinase-3, NBS-V e GLPL, sendo o p-loop, Kinase-2
e GLPL os mais conservados entre os genes analisados de feijão-caupi. Já
os motivos NBS-II e NBS-V apresentaram uma maior variação na
conservação dos aminoácidos. A subfamília TIR foi caracterizada pelo
motivo Kinase-2. O domínio LRR foi identificado pelo motivo LXXLXL e
LXXLXX, onde “L” corresponde ao aminoácido leucina e “X” representa
qualquer outro aminoácido. Foram identificados loci cromossômicos para
genes TIR-NBS-LRR nos 11 pseudocromossomos de P. vulgaris, totalizando
5.685 posições. O maior número de genes ancorados foi observado no
cromossomo 10, com 1.578 genes correspondentes, enquanto que o
cromossomo 9 apresentou apenas 64 genes ancorados. As sequências
identificadas representam fonte valiosa para aplicação no melhoramento do
feijão-caupi e de outras leguminosas, tendo em vista sua função frente a
estresses bióticos, podendo ser utilizados ainda no desenvolvimento de
CONGRESO
LXV CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA
BOTÁNICA
XXXIV ERBOT - Encontro Regional de Botânicos MG, BA, ES 18 A 24 DE OUTUBRO DE 2014 - SALVADOR - BAHIA - BRASIL
Latinoamericano de
Botânica na América Latina: conhecimento, interação e difusão
marcadores moleculares. (CNPq, FACEPE, FINEP e Embrapa Macroprograma
2).