UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO – CENTRO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS DEPARTAMENTO DE GENÉTICA – GENÉTICA MOLECULAR- 2008.2 2ª Avaliação – 19/11/2008 Nome:____________________________ Assinatura: ______________________ Observação: Cada questão vale 1,0 ponto. 1. Observe a figura abaixo, que mostra a composição do genoma de um mamífero. A que conclusão não se pode chegar baseado nas informações da figura? a) a redução da densidade gênica dos mamíferos em relação à de procariotos é devida a transposons e outras sequências não codificantes b) os genes são em grande parte compostos por íntrons c) a parte do genoma dedicada à codificação de aminoácidos representa cerca de 1/4 do genoma. d) uma parte importante do genoma é composta de repetições e sequências transpostas e) mesmo considerando íntrons como componentes intrínsecos do gene, a densidade de genes no genoma do mamífero ainda é muito mais baixa do que a observada nos procariotos 2. Das afirmativas abaixo, qual a errada? a) Os mamíferos humanos compartilham cerca de 20% de seus genes com todas as formas de vida. Estes são os genes “de manutenção” de cada célula,que regulam a maquinaria celular básica. b) A maioria dos genes de manutenção evolui lentamente e vem sendo copiada, com poucas modificações, ao longo de bilhões de anos. c) Cerca de 1/3 do genoma é composto de genes homólogos aos genes de todos os eucariotos, mas não aos das bactérias. Eles também são genes de manutenção celular que refletem a grande complexidade do metabolismo celular dos eucariotos. d) Outra 1/4 parte de nossos genes são compartilhados com outros animais, mas não com eucariotos unicelulares, nem com procariotos. Esses genes “animais” compreendem genes como os Hox, que controlam o desenvolvimento e) Cerca d 20% de nossos genes são compartilhados somente com vertebrados. Incluem genes que atuam nos sistemas imune e nervoso e proteínas que auxiliam o enrolamento do enorme genoma dos vertebrados superiores,como as histonas. 3. As tabelas abaixo mostram as características de dois genomas virais,ambos a DNA fita dupla. Qual das afirmativas a seguir é correta? a) O densidade de genes no adenovírus é muito maior do que no mimivírus, devido ao seu pequeno genoma. b) Os dois genomas contêm exclusivamente genes para proteínas e enzimas. c) Como a % de regiões codificantes é aproximadamente igual nos dois genomas, isso implica que, no mimivírus, muitas longas regiões do genoma não devem codificar nada d) o genoma do mimivírus contém uma categoria de genes que não existe no genoma do adenovirus e) a densidade de genes no mimivírus é muito maior do que a do adenovirus, devido ao seu grande genoma. 4. Há vírus a RNA fita simples ditos "de fita negativa" e outros "de fita positiva". Que opção abaixo responde corretamente esta questão? a) os vírus de fita negativa são aqueles que precisam ser retrotranscritos e do DNA produzido será transcrito o mRNA final. Nos vírus de fita positiva, o próprio RNA viral serve de mRNA b) os vírus de fita negativa são aqueles que apresentam genes inseridos no genoma por retrotransposição c) os vírus de fita positiva são aqueles que tem ORFS codificando preferencialmente aminoácidos de carga positiva, constituintes do capsídeo d) Os vírus de fita positiva são aqueles cujos genes não apresentam sobreposições e) Os vírus de fita positiva são aqueles cujos genes apresentam sobreposições 5. Indique a afirmativa errada quanto aos genomas virais. a) têm uma densidade gênica elevada b) codificam em geral apenas proteínas c) não têm pseudogenes d) em geral não têm genes duplicados. e) apresentam pouca variação de tamanho 6. São estes, atualmente, o maior genoma procarioto: Sorangium cellulosum, uma deltaproteobactéria, com 13 Mb, e o menor: Carsonella ruddii, com apenas 159 kb. Qual das afirmativas abaixo não é verdadeira. a) Há por vezes sobreposição de genes, tanto em fitas complementares, como na mesma fita b) a variação do tamanho dos genomas entre bactérias é maior do que aquela observada entre vírus c) mesmo o menor genoma possui genes para tRNA d) mesmo o menor genoma possui genes para rRNA e) algumas vezes pode haver pseudogenes e genes duplicados em genomas procariotos 7. A densidade de genes varia muito entre espécies diferentes de eucariotos, indo de 1gene para cada 900 pb na levedura e a um gene por 127.900 pb em humanos. A diminuição observada da densidade gênica com o aumento da complexidade relacionada ao desenvolvimento fomenta especulações sobre as funções do DNA não codificante. Indique qual delas é fantasiosa. a) parte deste DNA contém sequências altamente repetitivas b) uma parte importante deste DNA é formada de transposons c) pequenos RNAs transcritos destas regiões podem ter funções reguladoras d) grande parte deste DNA pode ter sido fruto de transferência horizontal de trechos não codificantes de genomas de outros organismos e) sequências pouco ou moderadamente repetidas formam parte importante do genoma não codificante. 8. Fica evidente, pela inspeção da tabela de genomas eucariotos mostrada em sala de aula e discutida no portal da disciplina, que os genomas de mamíferos são os maiores, outros vertebrados têm genomas geralmente bem menores. Da mesma forma, as dicotiledôneas costumam ter genomas maiores que a monocotiledônias. Vermes têm genomas menores que peixes. O que se conclui disso? a) que os genomas acompanham a complexidade do proteoma b) que os genomas acompanham a complexidade do transcriptoma c) que o número de genes aumenta em proporção direta ao aumento do genoma d) que o número de novos genes aumenta diretamente com o aumento da complexidade do organismo e) que há uma relação direta aproximada entre a complexidade do organismo e o tamanho de seu genoma 9. O mt DNA humano é uma molécula circular que engloba 16.569 pb que codificam 24 RNAs estruturais (dois rRNAs, 22 tRNAs) e 13 proteínas envolvidas na respiração, não há íntrons e alguns genes se sobrepõem. Como é possível duplicar e manter a mitocôndria ativa com tão poucas proteínas. a) as demais proteínas são obtidas de outro genoma na mitocôndria b) as 13 proteínas são poliproteínas c) as demais proteinas são codificadas pelo núcleo da célula hospedeira d)a evolução garantiu que apenas estas proteínas fossem suficientes e) a replicação da mitocôndria é garantidas pelo mecanismos de replicação da hospedeira 10. Na figura abaixo observamos que os resultados do blastn de uma sequência de mRNA (parte superior) retorna um resultado diferente do blastx com a mesma sequência (parte inferior). Qual a diferença mais importante e por que ela acontece? (indique a resposta certa) a) é o comprimento das regiões de similaridade, maior no segundo caso, devido ao maior comprimento da proteína em relação ao mRNA b) é a extensão das regiões de similaridade, sobretudo na parte 5´, no caso da comparação de aminoácidos, porque as proteínas são mais conservadas na região amino do que na carboxi c) é a extensão das regiões de similaridade, sobretudo na parte 5´, no caso da comparação de aminoácidos, porque as proteínas são mais conservadas na região carboxi do que na amino d) é a inexistência de similaridade na região 3´ da sequência, quando aminoácidos são comparados, devido à perda da cauda poli A na tradução. e) é o número maior de sequências com elevada similaridade quando sequências de aminoácidos são comparadas, porque as diferenças de uso de códons entre os organismos, presente no blastn, é superada. Boa Prova!!!