Introdução do HIV-1 subtipo B no Brasil

X Semana de Extensão, Pesquisa e Pós-graduação - SEPesq
Centro Universitário Ritter dos Reis
Introdução do HIV-1 subtipo B no Brasil
Wagner Fogaça, Gustavo Brum Schwingel, Dennis Maletich Junqueira
¹ Centro Universitário Ritter Dos Reis – Unirritter, Ciências da Saúde, Grupo de Bionformática e Evolução
Molecular, Porto Alegre, RS
O HIV é um vírus pertencente à família Retroviridae, gênero Lentivirus, cujos
membros apresentam genoma formado por duas fitas simples de RNA. Uma das
características marcantes do HIV-1 é a sua extensa diversidade nucleotídica.
Geneticamente, é classificado em quatro diferentes grupos: M, N, O e P. Em uma escala
global, as formas genéticas do HIV-1 grupo M são as mais disseminadas e são ainda
divididas em nove subtipos. Os subtipos C, A e B são os mais prevalentes em diversas
regiões do mundo. No Brasil, atualmente, existem cerca de 600.000 indivíduos HIV-positivos
e a maioria destes é infectado pelo HIV-1 subtipo B (HIV-1B). Este trabalho tem como
objetivo identificar o ano e origem da entrada do HIV-1B no Brasil. Sequências do gene pol
do HIV-1B serão selecionadas (posições 2253-3233 referente ao HXB2) a partir do Los
Alamos HIV Sequence Database e do Genbank. Apenas uma sequência por paciente será
considerada e as sequências problemáticas serão descartadas. O subtipo será confirmado
através das ferramentas Rega subtyping tool, Stanford HIV Drug Resistance Database e
RIP. Inicialmente, árvores filogenéticas serão reconstruídas através do método de maximum
likelihood (ML) utilizando o programa PhyML. Filogenias Bayesianas serão inferidas no
programa BEAST v1.8. Foram selecionadas, até o momento, 6.439 sequências do subtipo
B, incluindo sequências referência de diferentes países ao redor do mundo. A reconstrução
filogenética por ML aponta a existência de diferentes entradas do vírus no Brasil,
especialmente a partir de países da América, como Estados Unidos, Venezuela, Argentina,
Colômbia e países do Caribe. Os principais clados que incluem sequências do Brasil serão,
a partir de agora, submetidos a uma análise Bayesiana para verificar a data e o estado
brasileiro onde provavelmente ocorreu a entrada, permitindo estabelecer os principais links
epidemiológicos responsáveis pelo estabelecimento da epidemia de HIV-1 no Brasil.
X Semana de Extensão, Pesquisa e Pós-graduação
SEPesq – 20 a 24 de outubro de 2014