Mutações pontuais de seqüências nucleotídicas brasileiras da

51º Congresso Brasileiro de Genética
Resumos do 51º Congresso Brasileiro de Genética • 7 a 10 de setembro de 2005
Hotel Monte Real • Águas de Lindóia • São Paulo • Brasil
www.sbg.org.br - ISBN 85-89109-05-4
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Palavras-chave: Mutação, HIV-1 subtipo C, Alinhamento Múltiplo
Lira, RCP; Filho, BFS; Souza, GRB; Nova, MCV; Belo, MLM
Centro Universitário de Ciências Biológicas e da Saúde, Centro de Estudos Superiores de Maceió-CESMAC/FEJAL, Alagoas.
Mutações pontuais de seqüências
nucleotídicas brasileiras da protease do
HIV-1 subtipo C depositadas no GenBank
Desde o inicio deste novo milênio o subtipo C do HIV-1 tem sido o de maior incidência no globo, sendo
responsável por 56% das infecções mundiais em relação aos outros subtipos. No Brasil, o subtipo C foi
detectado pela primeira vez nas cidades de Porto Alegre e São Paulo e tem provocado grande preocupação
médica e social. De forma geral, o HIV possui grande variação genética, pois apresenta alta taxa de mutação
em sua seqüência de RNA, principalmente na região que codifica a protease, uma vez que a transcriptase
reversa não é muito precisa durante a replicação. A seqüência da protease viral está localizada no gene POL
e possui em média 297 nucleotídeos. As mutações pontuais podem ocorrer por substituição, deleção ou
inserções de bases nucleotídicas. As substituições podem ser divididas em transições e transversões, de acordo
com os tipos de bases alteradas. A presente pesquisa objetivou verificar os tipos de mutações encontradas entre
seqüências de cDNA brasileiras que codificam a protease do HIV-1 subtipo C. No período compreendido
entre janeiro e maio de 2005, foram selecionadas 10 seqüências de cDNA brasileiras da protease do HIV-1
subtipo C, identificadas no Genbank pelos números de acesso AF527292, AF527264, AF527286, AF527340,
AF527277, AF527272, AF527266, AF527284, AF527305 e AF527294, os quais podem ser acessados no
LASP – Laboratório Avançado de Saúde Pública (http://www.lasp.cpqgm.fiocruz.br/laboratório.html). O
alinhamento múltiplo das seqüências foi realizado no programa CLUSTAL W, utilizando como seqüência
padrão a região que codifica a protease no genoma do HXB2, referência para pesquisas em HIV, obtida no site
do laboratório de Los Alamos (HIV databases – http://hiv-web.lanl.gov/content/index). As mutações foram
qualificadas e quantificadas, possibilitando a construção de uma tabela indicando a posição da substituição, o
nucleotídeo usado como padrão, os números de acesso de todas as seqüências alinhadas e o tipo da alteração.
Considerando a análise simultânea das seqüências foram observadas 69 substituições, dentre as quais 49 (71%)
do tipo transição e 20 (29%) do tipo transversão. As trocas mais freqüentes do primeiro grupo ocorreram entre
os nucleotídeos A→G (15), G→A (13), C→T (10) e T→C (11). No segundo grupo ocorreram mudanças de
A→C (3), C→A (6), A→T (2), T→A (5), G→C (1), C→G (3), não sendo observadas trocas de G→T e de
T→G. Quando analisadas isoladamente as seqüências apresentaram em média de 32 alterações em relação à
seqüência padrão. Como se esperava, houve maior probabilidade de mutações pontuais por substituição entre
bases de um mesmo grupo, purinas ou pirimidinas, que a principio pode não gerar alterações grosseiras. O
estudo dessas variações em nível de nucleotídeo facilita a compreensão quanto às alterações de aminoácidos,
contribuindo, assim, para o estudo da resistência viral aos tratamentos com inibidores da protease.
Apoio Financeiro: FEJAL.
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