BIOINFORMÁTICA APLICADA À MODELAGEM DE BANCO

LIVRO DE RESUMOS DO XXIII SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFPA - 2012: ISSN 2176-1213.
BIOINFORMÁTICA APLICADA À MODELAGEM DE BANCO DE DADOS PARA UM
SISTEMA WEB DE CIANOBACTÉRIAS
Vitor Cirilo Araujo Santos (Bolsista PIBIC/CNPQ) – [email protected]
Curso de Sistemas de Informação, Faculdade de Computação, Instituto de Ciências Exatas e
Naturais.
Prof.ª Dr.ª. Maria Paula Cruz Schneider (Orientador)
As cianobactérias vêm recebendo crescente atenção por sua capacidade de produzir uma
grande variedade de produtos naturais biologicamente ativos. A era dos sequenciadores de
nova geração vem proporcionando um aumento exponencial na quantidade de genomas
armazenados nos bancos de dados biológicos, tornando as tarefas de manipulação desses
dados problemática. Este trabalho teve como objetivo armazenar as informações sobre as
cianobactérias utilizando como dados de referência arquivos .gb e .fasta do National Center for
Biotechnology Information (NCBI), e converter estas estruturas para um modelo relacional de
banco de dados utilizando o DBDesigner versão 4 e MySQL 4.0.12, armazenando as
informações de cianobactérias em um servidor local para permitir a construção de uma base de
dados relacional eficiente. Esta base de dados local irá permitir um acesso rápido e confiável
para análise de genômica comparativa. A importância da modelagem do sistema se dá ao fato
da base de dados proporcionar a integração de vários bancos de dados heterogêneos
(GenBank, RefSeq, UniProtKB, KEGG) e permitir a implementação de um sistema de busca
para automatizar as análises e predições gênicas sobre os dados publicados. Hoje a base de
dados dispõe de 45 genomas completos de cianobactérias obtidos a partir do GenBank. A base
de Genomas foi modelada a partir dos trabalhos correlatos: o modelo proposto na dissertação
de mestrado de Dieval Guizelini e a tabela fornecida pelo Instituto de Matemática e Estatística
(IME) da USP (http://www.linux.ime.usp.br/~cef/mac499-01/monografias/flc-rec/). A parti desta
etapa será realizada a modelagem do banco de dados de proteínas e produtos naturais
bioativos, permitindo a integração das três bases de dados de informações de cianobactérias
em um único sistema web. Este trabalho faz parte da tese de doutorado ainda não publicada
de Danielle Couto, que propõe a utilização de técnicas de Data Mining para predição de
informações biológicas no Sistema Web chamado Cyanbr.
Palavras-chave: Modelagem de Banco de dados, Banco de dados biológicos,
Cianobactérias.
Titulo do projeto do orientador: GENES BIOSSINTÉTICOS E PRODUTOS NATURAIS
BIOATIVOS DE CIANOBACTÉRIAS DA AMAZÔNIA: FRONTEIRAS EM BIOTECNOLOGIA.
Classificação do trabalho na Tabela de Áreas do Conhecimento no CNPq:
Grande-área: Ciências Biológicas
Área: Genética
Sub-área: Bioinformática