Os microrganismos e sua importância para a Agricultura

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Seminário internacional: Os desafios da agricultura tropical
Os microrganismos e
sua importância para a
Agricultura Tropical
João Lúcio de Azevedo
ESALQ/USP
CBA
São Paulo, FAPESP, 15/09/2009
Número de Espécies no Planeta
Espécie
Nº Conhecido
Bactéria
Nº Estimado
NC/NE %
4 700
40 000
11,0
Fungo
69 000
1 500 000
4,6
Alga
40 000
60 000
66,7
276 750
295 000
90,8
30 800
100 000
30,8
970 000
6 a 10 mi
9,7 a 16
29 000
515 000
5,6
98 000
100 000
98,0
Planta
Protozoário
Inseto
Porífera, cnídios
e nematóides
Outros
Fixação biológica de nitrogênio atmosférico por bactérias
Promoção de crescimento vegetal por fungos micorrízicos
Interações
 Planta hospedeira
 Estoque de microrganismos
 Microrganismos epifíticos
 Microrganismos endofíticos
Microrganismos endofíticos
Microrganismos depositados na Coleção de culturas do CBA
Microrganismos isolados
Actinomicetos depositados na Coleção de culturas do CBA
Endófitos e suas aplicações
 Controle de insetos–pragas
 Controle de patógenos
 Produção de fármacos
 Produção de hormônios de crescimento vegetal
 Resistência a condições de estresse
 Como vetores em tecnologia do DNA recombinante
Bactérias promotoras de crescimento e inibidoras de fitopatógenos de
guaraná - Colletotrichum guaranicola e cupuaçu - Crinipellis perniciosa
(53 isolados testados)
Bactérias
produtoras
de
fitohomônios (16 isolados)
Bactérias fixadoras de
nitrogênio (18 isolados)
Bactérias solubilizadoras
de fosfato (6 isolados ).
Bactérias capazes de inibir
fitopatógenos (isolados G1 e G2)
Produção de metabólitos
secundários
Microrganismos capazes de produzir metabólitos com atividade antimicrobiana; A)
metabólito de actinomiceto (isolado 1) inibindo E. coli, e B) metábólito de fungo
(isolado 81) inibindo S. marcescens)
Controle de bactérias humano-patogênicas por bactérias
endofíticas
Fungo atacando fungo
Controle de Rhizoctonia solani por Thrichoderma sp. em tomateiro
Pinta preta em citrus
(Guinardia citricarpa)
1992
2000
PATOGÊNICO
ENDOFÍTICO
ANÁLISE DE RAPD
PCP1
PCRJ1
PCP2
PCP3
PCP7
PCC2
PCP5
PCP8
PCP9
PC7L
PCRJ3
PCRJ2
PC23
PC97005
PC97008
PC97012
PC97013
PCFM
PCP10
PC18
PC97007
CBS111.20
PC97014
PC7LS
PCC9
PCP6
PC13
ECPR1
ECPR7
ECPR9
ECPR3
ECPR6
ECPR11
ECPR12
ECPR5
ECPR8
ECPR10
PC19
EC0L23
PC97010
ECPR14
ECPR16
EC15
EC80
EC86
EC45
ECTO1
PC48
EC1
PC2
PC4
PC45
EC4
P G1513
P G1506
ECA175
ECA245
EC171
ECA63
ECA196
ECN22
ECPOA7
ECPOA4
ECPOA5
ECN1
ECN14
ECN18
P G1509
P G1512
ECRP1
ECN2
ECRP5
ECPOA2
EG2Z
ECN19
ECRP2
ECRP4
P G1515
EENI2
P G1435
P G1508
PC58
P G1514
PC1
PCC4
PC50
PCC4S
EC210
PC16
EC216
ECN3
EC86S
EC384
ECRP6
EG1Z
EG4Z
EG3Z
P G1499
ECPOA1
ECPOA8
ECPOA6
EC131
EC145
100%
40%
100%
63%
%
79%
53%
0.05
0.29
0.53
0.76
Coeficiente de Similaridade Genética
1.00
Isolados patogênicos
•São Paulo (17)
•Rio de Janeiro (5)
•Rio Grande do Sul (4)
•Strain CBS 111.20
Isolados endofíticos
•Paraná (10)
Isolados endofíticos
•São Paulo (25)
•Rio Grande do Sul (8)
•Paraná (1)
•Tucumãn-Argentina (6)
•Amazonas-guaraná (4)
•São Paulo-eucalyptus (1)
•Distrito Federal-guava (9)
Isolados patogênicos
•São Paulo (11)
•Rio Grande do Sul (1)
SEQUÊNCIA DO FRAGMENTO ESPECÍFICO DO PATÓGENO
DETECÇÃO DE G. citricarpa
PATOGÊNICA EM TECIDO DE CITRUS
Triângulo da doença
Remoção de
plantas
sintomáticas
Controle do
vetor
Sobrevivência
com CVC
Certificação de mudas
Isolamento de bactérias endofíticas
Curtobacterium
Methylobacterium
Incidence of the main endophytes isolated from branches of sweet orange and
tangerine plants
Interação entre bactérias endofíticas e X. fastidiosa
X. fastidiosa
Methylobacterium sp.
(bactéria endofítica)
X. fastidiosa
Crescimento de isolados de X. fastidiosa estimulado por isolados endofíticos de
Methylobacterium spp.
Relação entre populações bacterianas, sugerindo assim que os sintomas da CVC em
citrus pode ser o resultado do balanço populacional entre Methylobacterium spp., C.
flaccumfaciens e X. fastidiosa.
> 70 citações
Fungos endofíticos utilizados no controle de
C. perniciosa
% sintomas
87,50%
00,00%
29,16%
33-79%
Controle A (com C. perniciosa)
Controle B (sem C. perniciosa)
Endofítico Iso 2 ( Gliocadium catenulatum)
Outros endófitos (22 islados)
Soja
Promoção de crescimento por fungos endofíticos isolados de soja
Soja
Promoção de crescimento por fungos endofíticos isolados de soja
Eucalyptus
Promoção de crescimento por fungos endofíticos isolados de Eucalyptus
Fungos endofíticos isolados de folhas e
caule de milho
steam
field
leaf
leaf
steam
greenhouse
Mortalidade (20 dias) de fêmeas de Boophilus microplus tratadas com
suspensão de conídios (105 conídios ml-1) of B. amorpha (isolados B95, B157)
ou B. bassiana (linhagens CG166, CG478). As lagartas do controle foram
tratadas com solução de Tween 80 (0.1%). As barras representam o desvio
padrão. Valores acompanhados da mesma letra não diferem estaticamente
(Teste de Tukey, P>0.05).
Mortalidade (20 dias) de lagartas de S. frugipera tratadas com suspensão de
conídios (105 conídio ml-1) de B. amorpha (isolados B95, B157) e B. bassiana
(linhagens CG61, CG14, CG166). As lagartas do controle foram tratadas com
solução de Tween 80 (0,1%). Valores acompanhados da mesma letra não
diferem estaticamente (Teste de Tukey, P>0.05)
Utilização da tecnologia do DNA
recombinante em endófitos
 Clavibacter xyli/BT em milho
 Bradyrhizobium japonicum/BT em Cajanus cajan
 Pseudomonas/BT em cana-de-açúcar
 Herbaspirillum/quitinase em cana-de-açúcar
Desenvolvimento de vetor de expressão
PvuII PstI
BamHI
HincII
BglIII
pUC18
Digestão com BamHI and ligated
pPA 2.5
2,7 Kb
2,5 Kb
PstI
MCS
XbaI
EcoRI; SacI; KpnI; SmaHI; XbaI;
SlaI; HincII; PstI
Digestão com XbaI; PstI
pPA2.5/18
BamHI
5.2 Kb
BamHI
e ligação
XbaI
pSMC2
XhaI
GFP
5.2 Kb
PstI
PstI
XbaI
pPA2.5/18
6.0 Kb
PstI
X
a
b
b
Mortalidade (10 dias) de lagartas de D. sacchatralis tratadas com bactéria
endofítica Pantoea agglomerans (33.1) geneticamente modificada
expressando o gene cry1Ac (108 UFC/colmo). Valores acompanhados da
mesma letra não diferem estaticamente (Teste de Tukey, P>0.05)
Centro de Biotecnologia da Amazônia - CBA
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