MSc in Biochemistry Dissertation Project – 2nd Cycle Student´s Name: Student email address: No. Supervisor(s): Miguel Castanho Supervisor(s) email address: [email protected] Lab/Institution: Instituto de Medicina Molecular/Departamento de Bioquímica, Faculdade de Medicina, UL (www.biochemistry-imm.org/cat.php?catid=106) Scientific area: Bioquímica/Biomedicina TITLE: . Combater vírus, bactérias ou células tumorais usando fármacos selectivos para membranas BACKGROUND O estágio pode incidir sobre uma das seguintes três temáticas, a combinar com os futuros estagiários: 1- O vírus da imunodeficiência humana (HIV) é o retrovírus causador da síndrome da imunodeficiência adquirida (SIDA). Apesar dos esforços, ainda não foi possível desenvolver uma cura ou vacina. No entanto, os tratamentos antiretrovirais disponíveis têm sido bem sucedidos em reduzir tanto a mortalidade como a morbilidade associados à infecção por HIV. Os inibidores de entrada do HIV-1 são uma nova classe de compostos antivirais com provas dadas e grande potencial de desenvolvimento. Estes inibidores actuam no meio extracelular, em diferentes passos do processo de entrada do vírus, impedindo a sua entrada nas células alvo. 2- Algumas proteínas do vírus de Dengue interatuam normalmente com membranas e esse é um ponto-chave para o desenvolvimento de novos antibióticos contra bactérias multi-resistentes. As bactérias multi-resistentes são actualmente uma das maiores causas de vítimas mortais em hospitais. 3- As várias formas de cancro continuam entre as doenças mais mortais da actualidade. Os fármacos tradicionais usados contra tumores têm grandes limitações devido aos seus efeitos secundários. A necessidade de encontrar fármacos eficazes e completamente inovadores é uma prioridade na medicina moderna. OBJECTIVES Estudar formas eficientes de: 1) bloquear a entrada de vírus em células (estágio 1), ou 2) perturbar as membranas de bactérias (estágio 2), ou 3) provocar a lise de células tumorais (estágio 3), através da interação de fármacos inovadores com sistemas modelo de membranas 1 MSc in Biochemistry Dissertation Project – 2nd Cycle PROJECT DESCRIPTION Estágio 1) Apesar do potencial terapêutico dos inibidores de fusão do HIV, a sua aplicação clínica é ainda limitada devido à ineficácia da distribuição para o local de acção e fraca selectividade. Um dos trabalhos de estágio propostos consistirá em abordagens com moléculas inovadoras e sistemas avançados de distribuição de fármacos. Será usada microscopia de força atómica (AFM) e técnicas espectroscópicas como fluorescência, dispersão dinâmica de luz e potencial zeta em partículas virais modelo (virus like particles - VLP), linfócitos e linhas celulares. Estágio 2) Os vírus têm sido uma fonte inexplorada de antibióticos. O segundo projeto de estágio consiste em estudar a interação de domínios de proteínas selecionadas de vírus com modelos de membranas celulares em condições experimentais de relevância biológica. Compreender o mecanismo base destas interações é o primeiro passo para conceber estratégias de combate a bactérias baseadas na destruição das membranas, que muito dificilmente conseguirão adquirir resistência. Serão usadas técnicas de microscopia e espectroscopias ópticas em bactérias seleccionadas. Estágio 3) O terceiro projeto consiste em estudar a ação de péptidos directamente sobre a superfície de membranas celulares de células tumorais. As moléculas que causarem alteração da ultra-estrutura das células causando, por exemplo, lise poderão ser fármacos de extrema utilidade no combate a tumores. Até hoje, as membranas de células tumorais têm permanecido inexploradas como locais de ação de fármacos e espera-se que os efeitos secundários sejam muito menores quando comparados com os dos fármacos tradicionais, que têm o DNA como alvo. Serão usadas técnicas de microscopia e espectroscopias óticas, disponíveis nos laboratórios onde o trabalho irá decorrer 2