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50º Congresso Brasileiro de Genética
Resumos do 50º Congresso Brasileiro de Genética • 7 a 10 de setembro de 2004
Costão do Santinho • Florianópolis • Santa Catarina • Brasil
www.sbg.org.br - ISBN 85-89109-04-6
[email protected]
Palavras chave: Comparação genômica, Bioinformática, Transferência Horizontal de Genes.
Fonseca, JP; Pereira, GA
Instituto de Biologia, Departamento de Genética e Evolução, UNICAMP
Transferência Horizontal de genes em
Crinipellis perniciosa, agente causador da
“Vassoura de Bruxa” no cacau
Aquisição de material genético novo através de Transferência horizontal de genes (THG) há muito é reconhecido
como uma das principais forças atuantes na evolução de genomas. THG pode ser definido como a transferência
de um gene ou até mesmo grupo de genes de um genoma para outro em algum ponto do processo evolutivo
(Doolittle, 1999). Para determinar a contribuição de THG no fungo C.perniciosa, o fitopatógeno causador da
vassoura de bruxa, foi desenvolvido um sistema de eliminação passo-a-passo que identifica genes ou proteínas
de outra origem que não fungos no genoma do fungo. Esse sistema compara e-values de BLASTP para cada
proteína predita em C.perniciosa contra o banco mundial (GenBank) como um “screening” preliminar de
candidatos a THG. Proteínas com altos valores de e-value contra não-fungos (bactérias, vertebrados ou plantas),
geralmente abaixo de E<-10 foram selecionados como possíveis candidatos a THG. Este projeto propõe a
identificação e caracterização de genes horizontalmente transferidos no genoma de Crinipellis utilizando-se os
seguintes métodos: Comparação genômica, filogenias moleculares baseadas em genes candidatos a THG, padrões
filéticos (KOG) e homologia (BLASTP). O objetivo do trabalho é definir uma metodologia de identificação
de THG que possa posteriormente ser utilizada em outros projetos genoma. Foram detectados 359 possíveis
candidatos a THG em um primeiro “screening” da montagem de contigs de C.perniciosa contra um banco de
dados criado somente com sequências de fungos do NCBI e do banco FTP, posteriormente, após uma análise
manual este número caiu para 44 incluindo genes completos e fragmentos. Dentre os candidatos mais robustos
encontram-se transposons, genes de prófagos e genes cujos e-values com outros organismos que nao sejam
fungos fossem abaixo de e<-10. A presença no genoma de C.perniciosa de uma proteína putativa de pólen,
apresentando e-value de e-51 (BLASTP) com uma proteína de pólen em plantas (NCBI-NR) foi comprovada
através de PCR e é um exemplo de um candidato a THG. Foi confirmada a ausência de ortólogos desta
proteína de pólen (Pollen_OLE_E_1) em outros fungos através da comparação com outros bancos de dados
(EST_OTHERS e PFAM). THG entre espécies pouco relacionadas taxonomicamente vem sendo amplamente
demonstrada na medida em que os dados de diversos projetos genoma se tornam disponíveis para comparação
genômica. Tipicamente frações pequenas de um genoma vem sendo demonstrados como sendo adquiridos
através de THG Em média 17% dos genes de procariotos e uma porcentagem desconhecida do genoma em
eucariotos. A maioria dos estudos de THG em eucariotos utiliza-se de famílias de genes ao invés do genoma
inteiro pela dificuldade de se detectar transferência horizontal em eucariotos.
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