EXAME 2ª Época BIOQUIMICA E FISIOLOGIA MICROBIANA 1 julho 2015 Duração máxima: 2 horas 1. Escherichia coli assimila monossacáridos usando um processo denominado translocação de grupo. Descreva esse processo para o caso do manitol. (2,0 valores) 2. É comum dizer-se que o ciclo de Krebs ou dos ácidos tricarboxílicos possui um carácter anfibólico. No entanto, quando o seu funcionamento ocorre com sentido anabólico, são necessárias reacções adicionais para que o ciclo possa funcionar. a) Descreva o que se entende por carácter anfibólico do ciclo de Krebs dando alguns exemplos. (1,0 valores) b) Diga qual o nome genérico por que são conhecidas as reações que terão que ocorrer quando o ciclo funciona com carácter anabólico, dando dois exemplos concretos. (1,0 valores) 3. A assimilação de amónia pelos microrganismos é crítica para que possa ocorrer a síntese de um grupo muito importante de moléculas a) Diga que compostos são e quais os seus precursores (0,5 valores) b) Descreva como ocorre a assimilação da amónia por um microrganismo como por exemplo E. coli quando o meio de cultura usado contém 0,05 mM de amónia. (1,5 valores) 4. A fermentação lática é efectuada por um grupo de organismos diverso, coletivamente conhecidos por bactérias láticas. a) Indique as diversas vias para a fermentação lática que poderão ser encontradas nestas bactérias, referindo-se concretamente aos seus rendimentos finais em termos de produtos e energia. (1,0 valores) b) Para uma via à sua escolha, descreva os metabolitos e enzimas envolvidos. Discuta ainda o significado metabólico da reacção catalisada pela enzima lactato desidrogenase. (1,0 valores) 5. Os organismos pertencentes ao domínio Bacteria possuem na sua constituição peptidoglicano, um componente que não é encontrado em organismos de qualquer organismo pertencente a um dos outros domínios da vida. A sua biossíntese compreende várias etapas, desde os percursores até que sejam incorporados na parede celular de bactérias. Descreva detalhadamente os vários processos envolvidos na biossíntese do peptidoglicano. (3,0 valores) 6. A elevada adaptabilidade de muitos microrganismos está intrinsecamente ligada à sua capacidade de se adaptar a alterações das condições específicas do ambiente que os rodeia. Esta capacidade deve-se em parte a sistemas especializados na perceção e adaptação a essas alterações, conhecidos como sistemas reguladores de 2 componentes. Descreva a constituição geral destes sistemas e o modo como funcionam de forma a permitir que os microrganismos adaptem a sua fisiologia às mudanças ambientais. Detalhe o funcionamento de um deles à sua escolha (2,0 valores) 7. A descoberta recente da existência em bactérias de uma classe de RNAs com funções regulatórias evidenciou o papel central destas moléculas enquanto reguladores da expressão génica ao nível pós transcricional. Descreva as características dessa classe de RNAs bacterianos, bem como os mecanismos envolvidos na sua acção. Dê 3 exemplos desses RNAs indicando os processos por eles regulados. (2,0 valores) 8. Descreva o fenómeno de regulação por quorum-sensing, detalhando as diferenças deste tipo de regulação entre bactérias Gram-positivas e Gramnegativas. (2,0 valores) 9. A secreção de proteínas pode ocorrer em bactérias por diversos mcanismos, sendo actualmente conhecidos vários sistemas de secreção. Descreva os vários componentes e como funciona o sistema geral de secreção de proteínas de E. coli. (1,5 valores) 10. A sequenciação e anotação do genoma de uma nova espécie bacteriana mostrou que possui 2 genes distintos mas que codificam 2 isoenzimas com actividade de superóxido dismutase. Estas duas isoenzimas mostraram ter uma elevada homologia, ao nível da sua sequência de aminoácidos, com enzimas dependentes de Fe e Mn de outras espécies. Como procederia experimentalmente para demonstrar as actividades destas enzimas e distinguir entre as isoenzimas dependentes de Fe e Mn? (1,5 valores)