IDENTIFICAÇÃO MOLECULAR DE ISOLADOS DE BACTÉRIAS ASSOCIATIVAS OBTIDOS DE PLANTAS MEDICINAIS Giovana Oliveira Gutuzzo, Ana Camila Munis Jardim, Elisete Pains Rodrigues, e-mail do orientador: [email protected] Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas Ciências Biológicas, Genética molecular e de microrganismos. Palavras-chave: Diversidade, 16S rDNA, bactérias endofíticas. Resumo Plantas nativas da flora brasileira constituem uma fonte promissora para o estudo da biodiversidade e a bioprospecção de microrganismos com potencial aplicação biotecnológica em diferentes áreas de interesse. Neste contexto, as plantas medicinais são especialmente importantes para a bioprospecção de microrganismos com potencial aplicação na prospecção de antimicrobianos e outras biomoléculas ativas. Portanto, a planta medicinal escolhida pelo Laboratório de Genética de Microrganismos Baccharis trimera conhecida popularmente como carqueja, foi visada para o estudo de bactérias associativas desta planta, contudo poucas espécies vegetais têm sido estudadas e muito pouco se conhece a respeito da diversidade microbiana e o potencial destas bactérias. Neste sentido, o objetivo do presente subprojeto identificar os isolados obtidos destas plantas por meio da amplificação, sequenciamento e análise do gene 16S rDNA. Introdução e objetivo 1 Os microrganismos possuem uma grande adaptabilidade genética e uma extensa diversidade metabólica, o que os torna uma importante fonte de recursos para os avanços da biotecnologia (OLIVEIRA et al., 2006). A carqueja é muita usada na farmacopéia popular, atribuindo-se a ela várias propriedades, especialmente a de estimular o sistema digestivo, para combater gripes, febre, problemas intestinais, diabetes, impotência, entre outros (Cruz, 1962). O laboratório de Genética de Microrganismos da Universidade Estadual de Londrina coletou plantas da espécie Baccharis trimera, conhecida como “Carqueja” e isolou bactérias associativas da mesma. Para o melhor aproveitamento do potencial biotecnológico destas bactérias faz-se necessário a caracterização da diversidade genética, através das técnicas de 16S-RFLP, possibilitando a identificação de genótipos (isolados) promissores para diferentes aplicações, como, por exemplo, na produção de antimicrobianos de interesse industrial. O RFLP é baseado em padrões de restrição com o uso de enzimas selecionadas com base na sua habilidade de revelar polimorfismo nos fragmentos de DNA analisados. Materiais e métodos Para o isolamento de microrganismos endofíticos foi utilizada a técnica descrita por Matsumoto, 2014. As amostras foram submetidas a lise alcalina descrita por Birnboim, HC & Doly, J. 1979, e submetidas a técnica de 16S-RFLP em seguida. Para a reação de PCR foram utilizados os primers FD1 (5’AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’) E RD1 (5’-AAGGAGGTGATCCAGCC-3’) (Weissburg et al., 1991), que amplificam quase todo comprimento da região correspondente ao gene ribossomal 16S (1500 pb). O produdo da PCR foi analisado por eletroforese em gel de agarose. Após eletroforese, o gel foi submetido à coloração com brometo de etídio, visualizado sob radiação ultravioleta e fotografado no fotodocumentador (L-PIX Transilluminator Loccus 2 Biotecnologia). Para o RFLP, foram utilizadas as enzimas BsuRI (HAEIII) e MspI. Resultados e Discussão Figura1: Eletroforese em gel de agarose (1%) dos produtos de amplificação da região 16S rDNA de bactérias com os primers FD1 e RD1. Figura2: Eletroforese em gel de agarose (2%) dos produtos de PCR obtidos após 16S rDNA, submetidos a restrição com a enzima MspI. 3 Conclusões Para a realização do sequenciamento é necessário obter mais resultados das amostras coletadas da planta Baccharis trimera, portanto o trabalho segue em continuidade nos processos de 16S-RFLP e corte com enzimas de restrição. Agradecimentos Ao Programa de Iniciação Científica da UEL pela concessão da bolsa de Iniciação científica (IC-UEL), a mestranda Ana Camila Muniz e a graduanda Jéssica Ellen de Oliveira pela cooperação no desenvolvimento do projeto. Ao técnico Ideval Azarias de Souza pela assistência técnica e a prof. Dra. Elisete Pains Rodrigues pela orientação. Referências BIRNBOIM, HC & Doly, J. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA. Nucleic Acids. Res. 7: 1513-1523. 1979. CRUZ, G.L. Dicionário das plantas úteis do Brasil. Rio de Janeiro: Civilização Brasileira, 1962. 177p. MATSUMOTO, L. da S. Isolation of associative bacteria of Baccharis dracunculifolia and diversity analysis of the isolated by 16S-RFLP and rep-PCR fingerprinting techniques. 2014. 57p. Trabalho de Conclusão de Curso (Especialização em Genética Aplicada) – Universidade Estadual de Londrina, Londrina, 2014. OLIVEIRA, V.M; SETTE, L.D; GARBOGGINI, F.F. Preservação e prospecção de recursos microbianos. Multiciência, Campinas, n.7, p.1-19, out 2006. WEISSBUR W. G., BARNS S. M., PELLETIER D. A., LANE D. J. 16S ribossomal DNA amplification for phylogenetic study. J Bacteriol 173: 697-703. 1991. 4