plano-de-ensino-bioinfo-v5 - Bioinformática_DOC

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UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO
PRÓ-REITORIA DE ENSINO DE GRADUAÇÃO
Rua Dom Manoel de Medeiros, s/n – Dois Irmãos 52171-900 Recife-PE
Fone: 0xx-81-332060-40 [email protected]
PLANO DE ENSINO
I – IDENTIFICAÇÃO
CURSO: Capacitação para Bioinformática
MODALIDADE: Presencial
DISCIPLINA: Formação em Bioinformática
PRÉ-REQUISITO: programação, algoritmos e estrutura de dados, noções de
banco de dados, noções de hardware e redes.
( ) OBRIGATÓRIA
( ) OPTATIVA
DEPARTAMENTO: Estatística e Informática
PROFESSOR RESPONSÁVEL : André Caetano Alves Firmo
Ano: 2008
Semestre Letivo:
( x ) Primeiro
(
) Segundo
Total de Créditos (se for o caso): ______________
Carga Horária: 32 horas
II - EMENTA (Sinopse do Conteúdo)
Visão geral de hardware, redes e protocolo TCP/IP. Identificação dos principais
problemas de hardware e conectividade. Visão geral do sistema de arquivos Linux
e principais comandos em modo texto. Apresentação do ZOPE/PLONE.
Apresentação dos principais conceitos de programação. Apresentação da
linguagem de programação PYTHON e suas principais funções. Apresentação dos
conceitos básicos de banco de dados. Apresentação do MY-SQL. Apresentação
dos principais softwares para alinhamento e seqüenciamento genético.
III - OBJETIVOS DA DISCIPLINA
Formar e selecionar capital humano para Bioinformática, Introduzindo o aluno
aos conceitos elementares e ferramentas básicas de hardware e rede, capacitandoo em solucionar pequenos problemas relacionados. Apresentar a programação
para computadores como uma metodologia do raciocínio construtivo aplicável à
solução de problemas em Bioinformática. Fornecer ao aluno os fundamentos e
conceitos de Banco de Dados possibilitando: modelagem, implementação e
instalação de um Sistema de Informação suportado por um Banco de Dados.
IV - CONTEÚDO PROGRAMÁTICO
1. Identificação dos componentes e problemas de Hardware
2. Visão geral do protocolo TCP/IP
3. Identificando problemas de redes
4. Visão geral dos softwares de alinhamento e sequenciamento genético
5. Eficiência e correção de algoritmos
6. Conceitos tradicionais de programação
7. Conhecendo o Python
8. Tópicos gerais de Banco de Dados
9. O modelo relacional
10. Conhecendo o MYSQL
V – MÉTODOS DIDÁTICOS DE ENSINO
( x ) Aula Expositiva
( x ) Seminário
( x ) Leitura Dirigida
( x ) Demonstração (prática realizada pelo Professor)
( x ) Laboratório (prática realizada pelo aluno)
( ) Trabalho de Campo
( ) Execução de Pesquisa
( x) Outra. Especificar: Atividades práticas com execução de projetos orientado a
competências
VI - CRITÉRIOS DE AVALIAÇÃO
O critério para score final, será uma média ponderada entre os critério abaixo:
Presença – 15%
Atividades propostas – 15%
Realização de projetos – 30%
Verificação de Aprendizagem – 40%
FORMAS DE ACOMPANHAMENTO DO ALUNO DURANTE O SEMESTRE:
CRONOGRAMA
DATA
CONTEÚDO
05/04/08
Identificação dos componentes e problemas de Hardware
Visão geral do protocolo TCP/IP
Identificando problemas de redes
12/04/08
Visão geral dos softwares de alinhamento e seqüenciamento genético
19/04/08
Eficiência e correção de algoritmos
Conceitos tradicionais de programação
Conhecendo o Python
26/04/08
Programando com Python
03/05/08
Tópicos gerais de Banco de Dados
O modelo relacional
Conhecendo o MYSQL
10/05/08
Criando Banco de dados com MYSQL
17/05/08
Projeto de implementação
24/05/08
Avaliação final
VIII – BIBLIOGRAFIA (Conforme normas da ABNT)
BÁSICA:
Brookshear, J. Glenn – Ciência da Computação: uma visão abrangente.
Morimoto, Carlos E. – Hardware o guia definitivo.
Torres,Gabriel – Redes de computadores curso completo.
Seuhring, Steve – MySQL Bible.
Norton, Peter C. – Beginning Python
Gibas, Cynthia – Desenvolvendo Bioinformática
Recife, ____ de __________________ de ______
_______________________________________
Professor Responsável
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mariomazzolli2
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