José Miguel Ortega CURRICULUM VITAE Belo - Biodados

José Miguel Ortega
CURRICULUM VITAE
Belo Horizonte
2005
2
CURRICULUM VITAE
Julho, 2005
1 DADOS PESSOAIS
Nome: José Miguel Ortega
Nascimento: 26/07/1960, São Paulo/SP - Brasil
CPF: 05950126807
Endereço profissional:
Universidade Federal de Minas Gerais, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento
de Bioquímica e Imunologia.
Av. Antonio Carlos 6627
Pampulha
31270010 Belo Horizonte, MG - Brasil
Telefone: (31) 4992654 Fax:
4415963
E-mail: [email protected]
URL da home page: www.lbcd.icb.ufmg.br
Endereço residencial:
Av. Portugal 1321 apto. 201
Sta. Amélia
31550-000 Belo Horizonte, MG - Brasil
Telefone: (31)
4866488
E-mail: [email protected]
URL da home page: www.lbcd.icb.ufmg.br
2 FORMAÇÃO ACADÊMICA/TITULAÇÃO
1991 - 1994
1981 - 1987
1978 - 1981
Pós-doutorado.
Roche Institute Of Molecular Biology, R.I.M.B., Estados Unidos.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPQ,
Brasil.
Doutorado em Bioquímica.
Universidade de São Paulo, USP, São Paulo, Brasil.
Título: Alterações da Estrutura da Cromatina durante o Ciclo Celular e o Reparo de DNA em
Células de Mamífero. Ano de obtenção: 1987.
Orientador: Rogério Meneghini.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Graduação em Biociências.
Universidade de São Paulo, USP, São Paulo, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
3 ATUAÇÃO PROFISSIONAL
Universidade Federal de Minas Gerais - UFMG
Vínculo institucional
1989 - Atual Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento funcional: Prof. Adjunto RIII, chefe
de laboratorio, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
3
4/2000 - Atual
Cargos ou funções
1. Membro da Comissão Assessora do Programa UFMG Jovem.
10/1999 - Atual
Cargos ou funções
1. Membro de Comissão Permanente de Informática.
1/1997 - Atual
Linhas de pesquisa
1. Bioinformática.
03/1994 - Atual
Treinamentos ministrados
1. Mestrado.
2. Iniciação Científica.
12/1989 - Atual
Disciplinas ministradas
1. Bases Moleculares de Estrutura e Função da Célula.
2. Processamento de Dados de Pesquisa (Prodap).
3. Moléculas que Regulam e Desregulam o Ciclo Celular Eucariótico.
4. Iniciação de Transcrição em Eucariotos.
12/1989 - Atual
Disciplinas ministradas
1. Processamento de Dados em Bioquímica e Imunologia (Prodabi).
2. Fatores de Transcrição.
3. Controle do Ciclo Celular.
4. DNA & Cromossomos.
5. Bioquímica Celular.
12/1989 - Atual
Linhas de pesquisa
1. Bioquímica de Fatores de Transcrição.
Universidade de São Paulo - USP
Vínculo institucional
1988 - 1989 Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento funcional: Pós-doutorando, Carga horária:
40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
08/1988 - 07/1989
Linhas de pesquisa
1. Estrutura de Cromatina.
2. Controle de Proliferação Celular.
Instituto Butantan - IBU
Vínculo institucional
1987 - 1988 Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento funcional: Pós-Doutorando, Carga horária:
40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
08/1987 - 07/1988
Linhas de pesquisa
1. Controle de Proliferação Celular.
2. Estrutura de Cromatina.
4
4 PRODUÇÃO CIENTÍFICA, TECNOLÓGICA E ARTÍSTICA/CULTURAL
4.1 PRODUÇÃO BIBLIOGRÁFICA
4.1.1 Trabalhos completos em anais de eventos
1
ORTEGA, José Miguel; FARIACAMPOS, Alessandra Conceição; MUDADO, Maurício de Alvarenga.
Bioinformática. In: VIII SIMPÓSIO DE ATUALIZAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE
PLANTAS, 2004, Lavras. Anais do VIII Simpósio de Atualização em Genética e Melhoramento de
Plantas. Lavras: UFLA, 2004. v. 1, p. 1-6.
2
SANTOS, Francisco Prosdocimi dos; PEIXOTO, Fabiano Cruz; ORTEGA, José Miguel. DNA Sequences
Base Calling by PHRED: Error distrtibution. In: II WORKSHOP ON BIOINFORMATICS, 2003, Macaé.
CD de trabalhos. 2003.
3
PEIXOTO, Fabiano Cruz; ORTEGA, José Miguel. On the pursuit of optimal sequencec trrimming
parameters for EST projects. In: I WORKSHOP BRASILEIRO DE BIOINFORMÁTICA, 2002, gramado.
Anais do I workshop brasileiro de bioinformática. Gramado: Sociedade Brasileira dee Computação,
2002. v. 1, p. 48-55.
4.1.2 Resumos simples em anais de eventos
1
MUDADO, Maurício de Alvarenga; PINTO, Saulo A P; BARBOSA, Adriano S; TORRES, João A;
ORTEGA, José Miguel. A PICTURE OF THE SAMPLING OF GENE EXPRESSION IN MODEL METAZOA
USING EST AND KOG PROTEINS. In: II ICOBICOBI, 2004, Angra dos Reis. livro de resumos.
2004. v. 1, p. 1-1.
2
MUDADO, Maurício de Alvarenga; BRAVO NETO, Estevam; CAMPOS, Alessandra Conceição Faria;
TORRES, João A; ORTEGA, José Miguel. Annotation of D. melanogaster ESTs with KOG Database
Artificially Depleted of D. melanogaster Proteins - Tests of Protein Classification Tool at Biodados Server.
In: XXIVª REUNIÃO ANUAL DA SBBQ, 2004, Caxambu. Livro de resumos. São Paulo: SBBq, 2004.
v. 1, p. 1-1.
3
CAMPOS, Alessandra Conceição Faria; MUDADO, Maurício de Alvarenga; CAMPOS, Sergio V A;
FRANCO, Gloria Regina; ORTEGA, José Miguel. Automated selection of Schistosoma mansoni clones for
full-length sequencing: importance of the alignment start position in the prediction of completeness. In: II
ICOBICOBI, 2004, Angra dosReis. livro de resumos. 2004. v. 1, p. 1-1.
4
CAMPOS, Alessandra Conceição Faria; CAMPOS, Sergio V A; FRANCO, Gloria Regina; ORTEGA, José
Miguel. Automated Selection of Schistosoma mansoni Clones for Full-length Sequencing: Tests do
Algorithm and Inspection of Putative Kosak Consensus. In: XXIVª REUNIÃO ANUAL DA SBBQ, 2004,
Caxambu. Livro de resumos. São Paulo: SBBq, 2004. v. 1, p. 1-1.
5
BARBOSA, D V C; TORRES, João A; CAMPOS, Sergiov A; ORTEGA, José Miguel. Contribution of
Aminoacid Insertions and Deletions to Proteobacteria-b and Proteobacteria-d-e Molecular Evolution. In:
XXXIII REUNIÃO ANUAL DA SBBQ, 2004, Caxambu. Livro de resumos. São Paulo: Sociedade
Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004. v. 1, p. 1-1.
6
OLIVEIRA, Adriana; PEIXOTO, Fabiano Cruz; PROSDOCIMI, Francisco; CARVALHO, Osvaldo;
ORTEGA, José Miguel. modEST: A simulator of cDNA library production and EST sequencing. In: II
ICOBICOBI, 2004, Angra dos Reis. livro de resumos. 2004. v. 1, p. 1-1.
5
7
ORTEGA, José Miguel; QUEIROZ, Erica Maria de; SANTOS, Renata. Pesquisa e desenvolvimento de
tecnologias de seleção aplicadas ao sistema de duplo-híbrido em leveduras. In: 50°CONGRESSO
NACIONAL DE GENÉTICA, 2004, livro de resumos. Digito S/C Ltda, 2004. v. 1.
8
NOBRE, Cristiane Nery; BRAGA, Antonio P; ORTEGA, José Miguel. Prediction of Transcription Initiation
Site Using Artificial Neural Networks, Nearest Neighbor and Bagging Classifiers. In: II ICOBICOBI, 2004,
Angra dos Reis. livro de resumos. 2004. v. 1, p. 1-1.
9
MUDADO, Maurício de Alvarenga; BRAVO NETO, Estevam; ORTEGA, José Miguel. TESTS OF
AUTOMATIC ANNOTATION USING KOG PROTEINS AND ESTs FROM FOUR METAZOAN
ORGANISMS. In: II ICOBICOBI, 2004, Angra dos Reis. livro de resumos. 2004. v. 1, p. 1-1.
10
QUEIROZ, Erica; ORTEGA, José Miguel; GONÇALVES, Vanessa Faria. Duas novas formas de detecção
de ligação de proteínas híbridas contendo o domínio de ligação a DNA de GAL4 ao promotor de gene
repórter em sistemas de duplo-híbrido em leveduras. In: 49º CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA,
2003, Águas de Lindóia. CD de resumos. Digito S/C Ltda, 2003. v. 1, p. 1-1.
11
GONÇALVES, Vanessa Faria; QUEIROZ, Erica; CRUZ, Rosana C; RODRIGUEZ, Mônica B.; ORTEGA,
José Miguel. Ensaio simples de interação proteína-proteína em sistema de duplo-híbrido envolvendo
ativação de gene repórter HIS3 e crescimento diferencial de leveduras em cultura líquida. In: 49º
CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 2003, Águas de Lindóia. CD de resumos. Digito S/C
Ltda, 2003. v. 1, p. 1-1.
12
STARLING, Alessandra Lopes; ORTEGA, José Miguel; RODRIGUEZ, Mônica B. A new reporter gene for
the yeast reverse two-hybrid system In: XXII Reunião de Genética de Microrganismos, 2000, Viçosa. In:
XXII REUNIÃO DE GENÉTICA DE MICRORGANISMOS, 2000, Viçosa. Resumos da XXII Reunião de
Genética de Microrganismos. 2001. v. 2000, p. 59-59.
13
TOLENTINO, Marcos Tito; ORTEGA, José Miguel. Construção de um site para um modeloma de
proteínas do Schistosoma mansoni. In: 47° CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 2001, Águas de
Lindóia. CD de resumos do 47° Congresso Nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade
Brasileira de Genética, 2001. v. 1, p. 1-1.
14
MALTA, Frederico S V; SAMPAIO, K H; NERY, Flávia Cristina; ORTEGA, José Miguel; RODRIGUEZ,
Mônica B. Falso-positivo no sistema de duplo-híbrido associado à isca e ao domínio de ativação. In: 47°
CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 2001, Águas de Lindóia. CD de resumos do 47° Congresso
Nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2001. v. 1, p. 1-1.
15
THOMPSON, Mayerson; ANDRADE, Viviane; LEITE, Maria de Fátima; ORTEGA, José Miguel. Fatores
Intracelulares que regulam a expressão da família Tead de fatores de transcrição em células de hamster.
In: 47° CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 2001, Águas de Lindóia. CD de resumos do 47°
Congresso Nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2001. v. 1,
p. 1-1.
16
NERY, Flávia Cristina; ORTEGA, José Miguel; RODRIGUEZ, Mônica B. Interaction in vivo between
synthetic single chain antibodies (SScFv) and p53 using the yeast two-hybrid system. In: 47°
CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 2001, Águas de Lindóia. CD de resumos do 47° Congresso
Nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2001. v. 1, p. 1-1.
17
NERY, Flávia Cristina; ORTEGA, José Miguel; RODRIGUEZ, Mônica B. Isolation of specific single-chain
antibodies against p53 from a fully synthetic library using two-hybrid system. In: XXTH INTERNATIONAL
CONFERENCE ON YEAST GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, 2001, Praga. Yeast.
Chichester, UK: John Wiley & Sons, 2001. v. 18, p. 299-299.
6
18
RODRIGUES, Luciana Bastos; GONÇALVES, Vanessa Faria; MACEDO, Fernanda Quaresma; ORTEGA,
José Miguel. mTead1 protein domains have intrinsic activity modulated by neighbor domains. In: 47°
CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 2001, Águas de Lindóia. CD de resumos do 47° Congresso
Nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2001. v. 1, p. 1-1.
19
SANTOS, Fabrício dos; ORTEGA, José Miguel. Prodap (Processamento de Dados de Pesquisa e de
Pós-graduação), um website onde pós-graduandos publicam homepages sobre seu tema de pesquisa. In:
47° CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 2001, Águas de Lindóia. CD de resumos do 47°
Congresso Nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2001. v. 1,
p. 1-1.
20
SANTOS, Carla Renata dos; ORTEGA, José Miguel. Clonagem de fragmentos derivados do fator de
transcrição TEAD-1 para fins de estudos estruturais. In: 45º CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA,
1999, Gramado. Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Editora da Sociedade Brasileira de
Genética, 1999. v. 22, p. 267-267.
21
SILVA, Breno Mello; ORTEGA, José Miguel; NERY, Flávia Cristina; DILLON, Patrick; RODRIGUEZ,
Mônica B. Clonagem e expressão de anticorpos sintéticos de cadeia única (SScFvs) em bactérias. In: 45º
CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 1999, Gramado. Genetics and Molecular Biology.
Ribeirão Preto: Editora da Sociedade Brasileira de Genética, 1999. v. 22, p. 273-273.
22
ORTEGA, José Miguel; PRADO, Vânia Ferreira. CONSTRUCTION OF A WW SITE FOR THE
W
TEACHING OF BIOCHEMISTRY: SHOWING HOW TO FISH. In: XXVIII REUNIÃO
ANUAL DA
SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 1999, Caxambu. Programas
e Resumos da XXVIII Reunião Anual. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia
Molecular, 1999. p. 83-83.
23
STARLING, Alessandra Lopes; ORTEGA, José Miguel; RODRIGUEZ, Mônica B. EGFP and CAN1+ as
reporter genes to the direct and the reverse two-hybrid systems. In: 45º CONGRESSO NACIONAL DE
GENÉTICA, 1999, Gramado. Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Editora da Sociedade
Brasileira de Genética, 1999. v. 22, p. 272-272.
24
PESSOA, Patrícia I.; FRANCO-VIANNA, Renata; QUEIROZ, Erica; MARINO, Juliana M; SANTOS,
Raquel; SANTÓLIA, Juliana; ORTEGA, José Miguel. Geração de uma biblioteca de mutantes do fator de
transcrição TEAD-1 para estudo de domínios funcionais. In: 45º CONGRESSO NACIONAL DE
GENÉTICA, 1999, Gramado. Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Editora da Sociedade
Brasileira de Genética, 1999. v. 22, p. 314-314.
25
RODRIGUES, Luciana B.; ORTEGA, José Miguel. Repressão e antirepressão entre domínios do fator de
transcrição de camundongo TEAD-1. In: 45º CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 1999, Gramado.
Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Editora da Sociedade brasileira de Genética, 1999.
v. 22, p. 327-327.
26
NERY, Flávia Cristina; SILVA, Breno Mello; ORTEGA, José Miguel; RODRIGUEZ, Mônica B. Selection of
antigen-antibody interaction by yeast two-hybrid system. In: 45º CONGRESSO NACIONAL DE
GENÉTICA, 1999, Gramado. Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Editora da Sociedade
Brasileira de Genética, 1999. v. 22, p. 273.
27
PESSOA, Ygor Maximiliano de Pompein; ORTEGA, José Miguel. Selection of TEAD4 transcription factor
mutants lacking cis-repression activity. In: XXVIII REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE
BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 1999, Caxambu. Programas e Resumos da XXVIII Reunião
Anual. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1999. p. 83-83.
7
28
ORTEGA, José Miguel; RODRIGUES, Luciana B.; PESSOA, Ygor Maximiliano de Pompein; RODRIGUEZ,
Mônica B. TEAD transcription factors' N terminal domain activate transcription in yeast cells when
separated from the cis-repressor TEA domain. In: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 99, 1999,
San Francisco. The FASEB Journal. 1999. v. 13, p. 7-7.
29
MALTA, Frederico S V; ORTEGA, José Miguel; NERY, Flávia Cristina; BARBOSA-JÚNIOR, José;
PRADO, Vânia Ferreira; RODRIGUEZ, Mônica B. Two-hybrid screening artifacts associated with the use
of VAChT C-terminal as bait. In: 45º CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 1999, Gramado.
Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Editora da Sociedade Brasileira de Genética, 1999. v.
22, p. 305-305.
4.1.3 Artigos completos publicados em periódicos
1
PROSDOCIMI, Francisco; ORTEGA, José Miguel. Diet as a pressure on the aminoacid content of
proteomes. Lecture Notes in Computer Science, Germany, v. 3594, p. 153-159, 2005.
2
MUDADO, Maurício de Alvarenga; BRAVO NETO, Estevam; ORTEGA, José Miguel. Tests of automatic
annotation using KOG proteins and ESTs from 4 Eukariotic organisms. Lecture Notes in Computer
Science, v. 3594, p. 141-152, 2005.
3
SANTOS, Francisco Prosdocimi dos; PEIXOTO, Fabiano Cruz; ORTEGA, José Miguel. Evaluation of
window cohabitation of DNA sequencing errors and lowest PHRED quality values. Genetics and
molecular research, Ribeirão Preto SP, v. 3, n. 4, p. 483-492, 2004.
4
FARIACAMPOS, Alessandra Conceição; MUDADO, Maurício de Alvarenga; PEIXOTO, Fabiano Cruz;
BRAVO NETO, Estevam; SANTOS, Francisco Prosdocimi dos; ORTEGA, José Miguel. Ferramentas
Bioinformáticas Aplicadas a Caracterização da Expressão Gênica. Bioscience journal, Uberlândia,
v. Espec, p. 109-117, 2004.
5
FRANCO, Gloria Regina; SANTOS, Francisco Prosdocimi dos; CAMPOS, Alessandra Conceição Faria;
ORTEGA, José Miguel. Minas Gerais Sequencing Network: the study of the parasite Schistosoma
mansoni transcriptome. Bioscience, Uberlândia, v. Espec, p. 93-100, 2004.
6
SANTOS, Francisco Prosdocimi dos; PEIXOTO, Fabiano Cruz; ORTEGA, José Miguel. DNA Sequences
Base Calling by PHRED: Error Pattern Analysis. Revista Tecnologia da Informação, Brasília, v. 3, n.
2, p. 107-110, 2003.
7
STARLING, Alessandra Lopes; ORTEGA, José Miguel; GOLLOB, Kenneth J.; VICENTE, Elisabete J.;
ANDRADE-NÓBREGA, Gisele M.; RODRIGUEZ, Mônica Bucciarelli. Evaluation of Alternative Reporter
Genes for Yeast Two-Hybrid System. Genetics And Molecular Research, Ribeirão Preto, SP, v. 2, n.
1, 2003.
8
THOMPSON, M; ANDRADE, V A; ANDRADE, S J; PUSL, T; ORTEGA, José Miguel; GOES, A M; LEITE,
M F. Inhibition of the TEF/TEAD transcription factor activity by nuclear calcium and distinct kinase
pathways. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 301, n. 2, p. 267-274, 2003.
9
CAMPOS, Alessandra Conceição Faria; CERQUEIRA, Gustavo Coutinho; ANACLETO, Charles;
CARVALHO, Cláudia Benedetto de; ORTEGA, José Miguel. Mining microorganisms databases in the
quest for new proteins. Genetics and molecular research, Ribeirão Preto, v. 2, n. 1, p. 169-177,
2003.
10
LEITE, Maria de Fátima; HIRATA, K; PUSL, T; BURGSTAHLER, A D; OKAZAKI, K; ORTEGA, José
Miguel; GOES, A M; PRADO, M A; SPRAY, D C; NATHANSON, M H. Molecular basis for pacemaker cells
in epithelia. J Biol Chem, Bethesda, MD, 2002.
8
11
SANTOS, T. M.; AZEVEDO, V.; ORTEGA, José Miguel; RABELO, E.; SABER, M.; FRANCO, G. R.;
PENA, Sérgio Danilo Juno. Analysis of the gene expression profile of Schistosoma mansoni cercariae
using the Expressed Sequence Tag approach. Molecular and Biochemical Parasitology, Holanda, v.
103, n. 1, p. 79-97, 1999.
4.1.4 Capítulos de livros publicados
1
ORTEGA, José Miguel; SANTOS, Fabríco R. Bioinformática. In: BORÉM, Aluízio; GIÚDICE, Marcos Del;
SEDYIAMA, Tuneo. (Org.). Melhoramento Genômico. Viçosa - MG, 2003, v. 1, p. 165-185.
4.3 DEMAIS TRABALHOS
1
ORTEGA, José Miguel.Ano indefinido. (kit de ensino).
5 DADOS COMPLEMENTARES
5.1 ORIENTAÇÕES EM ANDAMENTO
5.1.1 Doutorado
1
SILVA, Adriano Barbosa da. Mecanismos de Resistência A Doenças em Plantas: Oryza sativa como
modelo. Início:2004. Tese (Doutorado em BIOINFORMÁTICA) - Universidade Federal de Minas
Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).
2
MUDADO, Maurício de Alvarenga. Metodologias de análises de expressão gênica em projetos
transcriptoma via EST e anotação reversa utilizando organismos modelo e proteínas KOG.
Início:2003. Tese, Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de
Pessoal de Nível Superior. (Orientador).
6 INDICADORES DE PRODUÇÃO
Produção bibliográfica
Artigos publicados em periódicos - 11
Completos - 11
Trabalhos em eventos - 32
Completos - 3
Resumos - 29
Livros e capítulos - 1
Capítulos de livros publicados - 1
Demais trabalhos
Dados complementares
Orientações em andamento - 2