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ESTRUTURA GENÉTICA POPULACIONAL E SUA RELAÇÂO
COM A EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO EM
LINHAGENS DE MILHO TROPICAL
Roberto
1
Fritsche-Neto ;
2
Sant’Ana ;
Gustavo César
Pedro Patric Pinho
3
4
Italo Stefanine Correia Granato ; Aluízio Borém
2
Morais ;
•1Professor no Departamento de Genética da ESALQ/USP. Piracicaba, SP, Brasil. E-mail: [email protected]
•2Doutorando no Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento da UFV. Viçosa, MG, Brasil.
•3Doutorando no Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas da USALQ/USP. Piracicaba, SP, Brasil.
•4Professor no Departamento de Fitotecnia da UFV. Viçosa, MG, Brasil.
INTRODUÇÃO
• A seleção visando a eficiência no uso de nitrogênio (EUN)
em milho requer disponibilidade de variabilidade genética
• É necessário ter conhecimento da organização desta
variabilidade em função da estruturação da população
OBJETIVO
• Caracterizar e analisar a estrutura genética populacional e a
relação desta com a variação fenotípica para EUN em
linhagens de milho tropical
MATERIAL E MÉTODOS
• 62 linhagens foram fenotipadas quanto à EUN, em baixa
disponibilidade de N no solo (60kg.ha-1)
Figura 1. Relações de parentesco genético entre 62 linhagens de milho tropical.
Os círculos pretos, cinza e brancos indicam as linhagens dos grupos fenotípicos
AE (Alta EUN), IE (Intermediária EUN) e BE (Baixa EUN), respectivamente.
• Anhumas-SP (22º84’30’’S, 48º02’20’’W), safrinha de 2013
• Delineamento de látice simples, com duas repetições
• Os dados fenotípicos foram submetidos a analise de
variância e as médias agrupadas via Skott & Knott
• As linhagens foram genotipadas com 768 marcadores
SNPs, por meio da plataforma Illumina GoldenGate
• Controle de qualidade dos SNPs - Call Rate (>0,85) e
Minnor Allele Frequency (< 0,05)
Figura 2. Atribuição de cada uma das 62 linhagens a cada grupo genotípico
(cores) para número de grupos (K) iguais a 4.
• A estruturação genética foi feita via inferência Bayesiana
• A diversidade genética foi estimada via índice de Roger’s
• O dendrograma foi gerado pelo método UPGMA
• A relação entre a estrutura da população e a EUN foi dada
pela coincidência desta com o agrupamento fenotípico
RESULTADOS E DISCUSSÃO
• Houve diferença significativa para o efeito de linhagens e
estas formaram três grupos quanto a EUN
• Alta, intermediária e baixa EUN, com 11, 30 e 21 linhagens
em cada grupo, respectivamente
• 539 SNP’s foram considerados informativos
• Na estruturação houve três picos de ΔK (critério de Evanno)
• Os números de grupos (K) mais prováveis foram 2, 4 e 8
Figura 3. Soma dos coeficientes de atribuição das linhagens de cada grupo
fenotípico (AE, IE e BE), considerando K = 4.
CONCLUSÕES
• A estruturação genética mais provável da população é K = 4
• Houve forte relação entre o desempenho fenotípico quanto a EUN e a
estruturação genética das linhagens
• Entretanto, é possível identificar genitores geneticamente divergentes, mas
superiores fenotipicamente quanto a EUN.