ISOLAMENTO DE BACTÉRIAS ENDOFÍTICAS E EPIFÍTICAS ASSOCIADAS À CANA-DEAÇÚCAR Michelangelo de Oliveira Silva1, Fernando José Freire2, Júlia Kuklinsky-Sobral3, Mario de Andrade Lira Júnior4, Diogo Paes da Costa5, Marisângela Viana Barbosa5, Maria Camila de Barros Silva5 & Pedro Avelino Maia de Andrade5 Introdução Os microrganismos associados aos vegetais representam uma fonte de inestimável valor para ser explorada quanto ao uso aplicado em culturas de importância econômica. Os diversos tipos de interação com as plantas hospedeiras e a facilidade de obtenção, por meio de isolamento em meio de cultura, fazem desse grupo de organismos uma promissora fonte de novos produtos biotecnológicos [1]. Neste aspecto, as bactérias endofíticas possuem uma íntima relação com seus hospedeiros por meio de processos co-evolutivos e podem ter influência na fisiologia das plantas por mecanismos ainda não completamente esclarecidos. Além disso, sua habilidade de sobreviver dentro de tecidos vegetais com pouca ou nenhuma competição microbiana, faz delas candidatas potenciais a aplicações biotecnológicas [2]. Essas bactérias endofíticas podem ser usadas como promotores de crescimento vegetal, produzindo fitohormônios, fixando N2 ou por outros mecanismos que possam contribuir para o desenvolvimento do seu hospedeiro [3, 4]. Portanto, este trabalho tem como objetivo estudar a comunidade bacteriana cultivável associada a variedades de cana-de-açúcar cultivadas no Nordeste, por meio de isolamento total. Material e métodos A. Material vegetal Bactérias endofíticas, de folha e raiz, e bactérias do rizoplano foram isoladas de três variedades comerciais (RB 867515, RB 92579 e RB 863129) de cana-deaçúcar (Saccharum spp.), cultivadas na Estação Experimental de Cana-de-Açúcar de Carpina/PE (EECAC) da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE). As amostras vegetais, quatro plantas de cada variedade, foram coletadas entre quatro e cinco meses de cultivo, sendo identificadas e levadas ao Laboratório de Genética e Biotecnologia Microbiana (LGBM) da Unidade Acadêmica de Garanhuns (UAG/UFRPE), para processamento das análises. B. Isolamento de Bactérias Associadas à Cana-deAçúcar Após a coleta, as amostras vegetais foram lavadas em água corrente e separadas em folha e raiz. Para o isolamento de bactérias do rizoplano e endofíticas da folha e da raiz, foi realizado protocolo de acordo com Kuklinsky-Sobral et al. e Mendes et al. [3, 5]. Como modificações, foi utilizado o meio TSA 10% (Tripcase Soy Agar), suplementado com o fungicida Cercobyn 700 (50 µg/ml), incubadas a 28°C e avaliadas após 3, 8 e 14 dias. A população bacteriana por grama de tecido vegetal fresco (UFC/g TVF) foi estimada pela contagem de colônias cultivadas em meio TSA 10%. Colônias características de cada tipo morfológico foram repicadas das placas de isolamento, purificadas e mantidas em TSA 10% líquido suplementado com 20% de glicerol a -20oC para a formação e organização de uma coleção de culturas bacterianas associadas a variedades de cana-de-açúcar cultivadas no Nordeste. Resultados e Discussão A densidade populacional da comunidade bacteriana endofítica, de folha e raiz, e do rizoplano de três variedades de cana-de-açúcar (RB 92579, RB 867515 e RB 863129), cultivadas no Nordeste, foi determinada durante os primeiros quatro meses de desenvolvimento da cana-planta crescidas em solo, na safra de 2008/09. Foi observado uma variação de 103 a 108 UFC/g de TVF na densidade populacional total da comunidade bacteriana associadas à cana-de-açúcar, como observado por outros autores em estudos com bactérias associadas a diferentes plantas hospedeiras [3, 6 e 7]. ________________ 1 Doutorando do PPG em Ciência do Solo, Universidade Federal Rural de Pernambuco. Rua Dom Manoel de Medeiros, s/n, Dois Irmãos, Recife, PE, CEP 52171-900. E-mail: [email protected] 2. Professor Adjunto do Departamento de Agronomia, Universidade Federal Rural de Pernambuco. Rua Dom Manuel de Medeiros, Dois Irmãos, Recife, PE, CEP 52171-900. 3. Professora Adjunta da Unidade Acadêmica de Garanhuns, Universidade Federal Rural de Pernambuco. Av. Bom Pastor, s/n, Boa Vista, Garanhuns, PE, CEP 55296-901. 4. Professor Adjunto do Departamento de Agronomia, Universidade Federal Rural de Pernambuco. Rua Dom Manuel de Medeiros, s/n, Dois Irmãos, Recife, PE, CEP 52171-900. 5. Alunos de Graduação em Agronomia da Unidade Acadêmica de Garanhuns, Universidade Federal Rural de Pernambuco. Av. Bom Pastor, s/n, Boa Vista, Garanhuns, PE, CEP 55296-901. Apoio financeiro: CAPES, CNPq e FACEPE. Além disso, foi possível observar uma interação entre os tecidos vegetais e as variedades de cana, em relação a densidade populacional bacteriana. Para os tecidos da folha não houve diferença significativa entre as variedades, porém a variedade RB 863129 foi a que obteve as maiores médias (Figura 1). Em relação aos tecidos de raiz, houve diferença significativa entre as variedades RB 867515 e RB 863129, com esta última apresentando a maior densidade populacional. Para a população de bactérias do rizoplano não houve diferença significativa para as variedades, mas a variedade RB 863129, novamente, foi a que obteve as maiores médias (Figura 1). Na mesma figura, também podemos observar que houve diferença significativa na densidade populacional de bactérias para as variedades entre as regiões da planta, sendo que as maiores densidades populacionais foram encontradas na região do rizoplano nas três variedades estudadas. A colonização preferencial de bactérias endofíticas e epifíticas na região da raiz refletem a presença de altos níveis de nutrientes localizados na rizosfera e rizoplano, os quais podem ser utilizados para o crescimento e metabolismo bacterianos [7 e 8]. O aspecto morfológico considerado foi a coloração da colônia, havendo uma predominância das cores amarela, branca e beje, com 35%, 29% e 20%, respectivamente. Os outros 16% das bactérias avaliadas apresentaram colônias de cor rosa, laranja, alaranjado e esverdeado. As distribuições de cor das colônias bacterianas por variedade de cana-de-açúcar estão apresentadas na Figura 2, sendo possível observar que as colônias de cor amarela, branca e bege foram constantes e representativas nas três variedades de cana avaliadas. Além disso, observa-se que as colônias de cor laranja e esverdeada não foram isoladas apenas da variedade RB 92579 e a de cor alaranjada não foi isolada apenas da variedade RB 867515. Conclusões Na interação bactéria-cana-de-açúcar, a densidade populacional bacteriana foi influenciada pelas variedades de cana avaliadas e pelos tecidos vegetais, com destaque para a variedade RB 863129 que apresentou maior densidade bacteriana. Referências [1] STROBEL, G.; DAISY, B. 2003. Bioprospecting for microbial endophytes and their natural products. Microbiology and Molecular Biology Reviews, 67: 491-502. [2] ALBAREDA, M.; DARDANELLI, M.S.; SOUSA, C.; MEGIAS, M.; TEMPRANO, F. 2006. Factors affecting the attachment of rhizospheric bacteria to bean and soybean roots. FEMS Microbiology, 259:67–73. [3] KUKLINSKY-SOBRAL, J.; ARAÚJO, W.L.; MENDES, R.; GERALDI, I.O.; PIZZIRANI-KLEINER, A.A.; AZEVEDO, J.L. 2004. Isolation and characterization of soybean-associated bacteria and their potential for plant growth promotion. Environmental Microbiology, 6: 1244-1251. [4] SOUZA, R.A.; HUNGRIA, M.; FRANCHINI, J.C.; CHUEIRE, L.M.O.; CAMPO, R.J. 2008. Avaliação qualitativa e quantitativa da microbiota do solo e da fixação biológica do nitrogênio pela soja. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasília, 43: 71-82. [5] MENDES, R.; PIZZIRANI-KLEINER, A.A.; ARAUJO, W.L.; RAAIJMAKERS, J.M. 2007. Diversity of cultivated endophytic bacteria from sugarcane: Genetic and biochemical characterization of Burkholderia cepacia complex isolates. Applied and Environmental Microbiology, 73: 7259-7267. [6] BARRETO, T.R.; SILVA, A.C.M.; SOARES, A.C.F.; SOUZA, J.T. 2008. Population densities and genetic diversity of actinomycetes associated to the rhizosphere of theobroma cacao. Brazilian Journal of Microbiology, 39:464-470. [7] COCKING, E. 2003. Endophytic colonization of plant roots by nitrogen-fixing bacteria. Plant and Soil, 252: 169-175. [8] MEDEIROS, A.F.A.; POLIDORO, J.C.; REIS, V.M. 2006 Nitrogen source effect on Gluconacetobacter diazotrophicus colonization of sugarcane (Saccharum spp.). Plant and Soil, 279:141–152. Figura 1. A) Densidade populacional total da comunidade bacteriana endofítica, da folha e raiz, e do rizoplano de três variedades de cana-de-açúcar: RB 92579, RB 867515 e RB 863129. Médias seguidas de mesma letra minúscula dentro da região, e maiúsculas entre as regiões e dentro de cada variedade, não diferem estatisticamente pelo teste de Tukey a 1% de probabilidade. B) Frequência relativa (%) das características morfológicas (cor da colônia) dos isolados bacterianos endofíticos e do rizoplano de três variedades de cana-de-açúcar: RB 92579, RB 867515 e RB 863129.