Algoritmos de processamento digital de imagem para a contagem de colónias de bactérias Orientador: Colaborador: Augusto Silva ([email protected]) José Vieira ([email protected]) Licenciatura: LEET Nº alunos: 1 Enquadramento A contagem de colónias de bactérias é uma tarefa monótona e repetitiva que consome muito tempo aos biólogos. Hoje em dia existem sistemas comerciais que auxiliam nesta tarefa sem no entanto extremamente caros estando portanto fora das capacidades de grande parte dos laboratórios. Além disso, estes programas possuem muitas vezes uma interface com o utilizador que não se revela a mais adequada, levando a que mesmo os biólogos com acesso a programas de contagem prefiram realizar o trabalho manualmente. Objectivos Pretende-se neste projecto desenvolver algoritmos de processamento de imagem para a contagem de colónias de bactérias. Todos os algoritmos serão desenvolvidos em Matlab sendo posteriormente as tarefas mais pesadas do ponto de vista computacional passadas para linguagem C. Tarefas 1. Levantamento dos programas de contagem de bactérias existentes no mercado. 2. Desenvolvimento dos algoritmos de contagem de bactérias em Matlab. 3. Passagem das partes mais pesadas do código para C. 4. Validação dos algoritmos por comparação com contagens realizadas por peritos. Meios O aluno disporá de um PC com o Matlab instalado.