Virologia

SIPA - Sistema de Informação Pedagógica e Avaliação
Versão 3.0 - Universidade do Algarve
Ficha de Unidade Curricular
Virologia (1488C1221)
Ficha submetida em 18/06/2013
Ano Lectivo: 2012/2013
Curso: 1488 - Ciências Farmacêuticas (mestrado Integrado)
Ano Curricular: 4
Área CNAEF: 4.2.9 - Ciências da Vida - outros
Área Científica: 13.1 - Biology
ECTS: 6
Horas de Contacto: 15.00 P ; 30.00 T ; 15.00 TP
Período de Lecionação: 2º semestre
Idioma de Lecionação:
Horas de Trabalho: 168
Resumo Descritivo
Disciplina de virologia geral com especial ênfase nos vírus de mamíferos, nos processos
moleculares de interacção com o organismo ao nível cellular, nas metodologias de diagnóstico molecular e na utilização de virus como vectores.
As aulas laboratoriais exemplificam diversas técnicas que se utilizam em virologia animal mas efectuadas com
bacteriófagos ou com vírus de plantas por questões de segurança
Objetivos de Aprendizagem (conhecimentos, aptidões e competências a desenvolver)
Percepção da variabilidade, ubiquidade e diversidade dos vírus.
Conhecimento da estrutura e taxonomia dos vírus e dos processos moleculares através dos
quais interactuam com o organismo humano ao nível celular, individual e de da população.
Percepção das características particulares da evolução viral. Relação entre vírus e oncogénese.
Conhecimento da metodologia de estudo, análise e diagnóstico de vírus.
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Conteúdos Programáticos
1. Introdução.
Descoberta dos vírus como agentes infecciosos. Conceito(s) de vírus (actualidade). Métodos biológicos, físicos e
bioquímicos usados no estudo de vírus. Métodos de quantificação e diagnóstico. Diagnóstico molecular.
2. Panorâmica dos vírus existentes e sua taxonomia.
Introdução à diversidade viral. Características úteis na taxonomia viral. Classificação de Baltimore. O sistema de
classificação do ICTV. O conceito de espécie em virologia.
Organismos sub-virais
3. A Partícula viral.
Funções e estrutura da cápside viral. Importancia da simetria na constituição de cápsides simples. Tipos e princípios de
simetria - Helicoidal e Icosaédrica.
Descrição da estrutura de vírus complexos e simples. Arranjo do genoma dentro da cápside.
4. O genoma viral .
Comparação da complexidade de genomas virais e genomas de organismos celulares. Tipos de ácidos nucleicos que
constituem os genomas virais. Variação genómica e causas. Fidelidade da replicação. Conceito de quasi-species.
Filodinâmica
5. Processo infeccioso ao nível celular.
Iniciação – Papel dos receptores. Processos de entrada e desencapsidação.
Breve referencia as estratégias de expressão e replicação do genoma.
Efeiros citopáticos (CPEs)
Processos de montagem e encapsidação do genoma.
Libertação das partículas virais por por lise e "budding".
Processos de expressão e replicação viral de virus com diferentes tipos de genoma.
6 – Vírus de genoma de RNA sem actividade de transcrição reversa
Aspectos comuns da expressão e replicação de RNA em eucariotas e procariotas.
Actividades enzimáticas e constituição de replicases.
Estratégias de expressão e replicação de virus de classe IV.
Picornaviridae – ciclo de poliovirus e Togaviridae – ciclo de sindbis virus
Estratégias de expressão e replicação de vírus de classe V
Orthomixoviridae – ciclo de influenza A. Papel da replicação nuclear. Antigénic drift e antigenic shifte e relação com
epidemias e pandemias.
Estratégia de expressão de replicação e virus de classe III
Reoviridae.
7 – Virus de genoma de DNA sem actividade de transcrição reversa
Separação da replicação e transcrição. Aspectos comuns e problemas da replicação viral com genomas de DNA.
Mecanismos alternativos à replicação linear.
Estratégias de replicação e expressão de virus de classe I
Virus de genomas pequenos.
Poliomaviridae. Ciclo de SV 40. Bases da transformação celular por interferencia do antigénio T com p53 e pRB.
Papilomaviridae. Ciclo de HPV. Integração genómica e transformação celular estavel. Virus do papiloma e cancro..
Aspectos comuns da transformação celular por virus de DNA
Virus de genoma grande.
Herpesviridae. Estratégia dos Herpesviridae. Ciclo de HSV-1. Latencia.
Baculoviridae.
Estratégias de replicação e expressão de virus de classe II
Parvoviridae. à espera da fase S
Vectores virais baseados em Adeno, Parvo e Herpes virus
8 – Vírus de RNA com actividade de transcrição reversa
Virus e outros agentes retróides. Human endogenous retrovirus.
Estratégias de replicação e expressão de virus de classe VI.
Retroviridae.Retrovirus simples e complexos. Estrutura do genoma.. Transcrição reversa. Integração genómica.
Expressão e padrões de splicing.
-Retrovirus “benignos”. Origem de HERVs?
-Retrovirus oncogénicos. Transformação por inserçao ou por acção de oncogenes virais. Processos de captura de
oncogenes celulares.
-Retrovírus citopáticos.
Lentivirus – HIV-1 e HIV 2. SIDA. Origem de HIV
Vectores virais baseados em retro e lenti virus
9 – Interacção virus hospedeiro
- Bioquimica da interacção ao nivel celular. Mecanismos de defesa inatos – Apoptose e RNAi. Papel da RNAi na defesa
antiviral em células de mamiferos. Capacidade supressora de apoptose e de silenciamento génico por virus.
- Mecanismos de defesa de origem extracelular. Tipos de Interferão. Indução do interferão. Estado de defesa antiviral.
Mecanismos de degradação de RNA e de bloqueio de tradução. Relação do interferão com o sistema imune. Supressão
das acções defensivas por vírus.
Métodos de Ensino, incluindo de Avaliação
Aulas teóricas apoiadas por meios audiovisuais cujo conteúdo é antecipadamente fornecido aos
alunos.
Aulas teórico-práticas em que são apresentadas questões que os alunos devem resolver na aula
ou em casa, a que se segue uma discussão das soluções.
Aulas práticas laboratoriais.
dois testes facultativos ao longo do semestre. Dispensa de exame final com média de 10 nos testes, nota superior a 8 em ambos os testes.
É obrigatória a presença em 75 % das aulas práticas
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Conteúdos Programáticos Desenvolvidos
1. Introdução.
Descoberta dos vírus como agentes infecciosos. Conceito(s) de vírus (actualidade). Métodos biológicos, físicos e
bioquímicos usados no estudo de vírus. Métodos de quantificação e diagnóstico. Diagnóstico molecular.
2. Panorâmica dos vírus existentes e sua taxonomia.
Introdução à diversidade viral. Características úteis na taxonomia viral. Classificação de Baltimore. O sistema de
classificação do ICTV. O conceito de espécie em virologia.
Organismos sub-virais
3. A Partícula viral.
Funções e estrutura da cápside viral. Importancia da simetria na constituição de cápsides simples. Tipos e princípios de
simetria - Helicoidal e Icosaédrica.
Descrição da estrutura de vírus complexos e simples. Arranjo do genoma dentro da cápside.
4. O genoma viral .
Comparação da complexidade de genomas virais e genomas de organismos celulares. Tipos de ácidos nucleicos que
constituem os genomas virais. Variação genómica e causas. Fidelidade da replicação. Conceito de quasi-species.
Filodinâmica
5. Processo infeccioso ao nível celular.
Iniciação – Papel dos receptores. Processos de entrada e desencapsidação.
Breve referencia as estratégias de expressão e replicação do genoma.
Efeiros citopáticos (CPEs)
Processos de montagem e encapsidação do genoma.
Libertação das partículas virais por por lise e "budding".
Processos de expressão e replicação viral de virus com diferentes tipos de genoma.
6 – Vírus de genoma de RNA sem actividade de transcrição reversa
Aspectos comuns da expressão e replicação de RNA em eucariotas e procariotas.
Actividades enzimáticas e constituição de replicases.
Estratégias de expressão e replicação de virus de classe IV.
Picornaviridae – ciclo de poliovirus e Togaviridae – ciclo de sindbis virus
Estratégias de expressão e replicação de vírus de classe V
Orthomixoviridae – ciclo de influenza A. Papel da replicação nuclear. Antigénic drift e antigenic shifte e relação com
epidemias e pandemias.
Estratégia de expressão de replicação e virus de classe III
Reoviridae.
7 – Virus de genoma de DNA sem actividade de transcrição reversa
Separação da replicação e transcrição. Aspectos comuns e problemas da replicação viral com genomas de DNA.
Mecanismos alternativos à replicação linear.
Estratégias de replicação e expressão de virus de classe I
Virus de genomas pequenos.
Poliomaviridae. Ciclo de SV 40. Bases da transformação celular por interferencia do antigénio T com p53 e pRB.
Papilomaviridae. Ciclo de HPV. Integração genómica e transformação celular estavel. Virus do papiloma e cancro..
Aspectos comuns da transformação celular por virus de DNA
Virus de genoma grande.
Herpesviridae. Estratégia dos Herpesviridae. Ciclo de HSV-1. Latencia.
Baculoviridae.
Estratégias de replicação e expressão de virus de classe II
Parvoviridae. à espera da fase S
Vectores virais baseados em Adeno, Parvo e Herpes virus
8 – Vírus de RNA com actividade de transcrição reversa
Virus e outros agentes retróides. Human endogenous retrovirus.
Estratégias de replicação e expressão de virus de classe VI.
Retroviridae.Retrovirus simples e complexos. Estrutura do genoma.. Transcrição reversa. Integração genómica.
Expressão e padrões de splicing.
-Retrovirus “benignos”. Origem de HERVs?
-Retrovirus oncogénicos. Transformação por inserçao ou por acção de oncogenes virais. Processos de captura de
oncogenes celulares.
-Retrovírus citopáticos.
Lentivirus – HIV-1 e HIV 2. SIDA. Origem de HIV
Vectores virais baseados em retro e lenti virus
9 – Interacção virus hospedeiro
- Bioquimica da interacção ao nivel celular. Mecanismos de defesa inatos – Apoptose e RNAi. Papel da RNAi na defesa
antiviral em células de mamiferos. Capacidade supressora de apoptose e de silenciamento génico por virus.
- Mecanismos de defesa de origem extracelular. Tipos de Interferão. Indução do interferão. Estado de defesa antiviral.
Mecanismos de degradação de RNA e de bloqueio de tradução. Relação do interferão com o sistema imune. Supressão
das acções defensivas por vírus.
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Bibliografia
apresentações das aulas fornecidas antecipadamente.
Diversos artigos disponibilizados nas aulas teórico-práticas
Livro:
Carter & Sauders. 2007. Virology. Principles and aplications. Wiley.
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