Manual do IARA

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IARA
Interface de Acesso RÁpido a Registros de Espécies
Versão 1.0
MANUAL DO USUÁRIO
Paulo Inácio Prado
Robson Tavares Nonato
Núcleo de e Estudos e Pesquisas Ambientais - Universidade Estadual de Campinas
Caixa Postal 6166, Cidade Universitária Zeferino Vaz, Campinas, SP, Brasil, CEP 13084971
Paulo Inácio Prado & Robson Tavares Nonato 4/12/2003
IARA versão beta
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IARA
 2003 Paulo Inácio Prado e Robson Tavares Nonato
BCC
 2003 Instituto de Estudos Sócio-Ambientais do Sul da Bahia e Conservation
International do Brasil
Documentação Beta
Este manual e o programa IARA estão em contínuo aperfeiçoamento. Dúvidas e problemas
podem ser enviados a [email protected] e/ou [email protected]
Citação
Para o programa IARA:
Prado, P.I. & Nonato, R.T. 2003. IARA - Interface de Acesso Rápido a Registros de
Espécies. Versão 1.0. Núcleo de Estudos e Pesquisas Ambientais, Unicamp, Campinas.
Para a BCC:
Conservation International do Brasil e Instituto de Estudos e Pesquisas Sócio-Ambientais
do Sul da Bahia 2003. BCC – Base de Dados Corredor Central da Mata Atlântica. Versão
2.0. In: Prado P.I., Landau E.C., Moura R.T., Pinto L.P.S., Fonseca G.A.B., Alger K.
(orgs.) 2002. Corredor de Biodiversidade na Mata Atlântica do Sul da Bahia. Publicação
em CD-ROM, IESB / CI / CABS/ UFMG/ UNICAMP, Ilhéus.
Depósito legal na Biblioteca Nacional, conforme Decreto 1825 de 20/12/1907.
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SUMÁRIO
CRÉDITOS............................................................................................................................. 1
TERMOS DE USO E ADVERTÊNCIAS.............................................................................. 2
INTRODUÇÃO...................................................................................................................... 4
O que o IARA é .................................................................................................................. 4
O que o IARA não é ........................................................................................................... 4
INSTALAÇÃO....................................................................................................................... 5
A BASE CORREDOR CENTRAL........................................................................................ 5
JANELA PRINCIPAL E TELAS DE EXIBIÇÃO DOS DADOS ........................................ 6
CONSULTAS......................................................................................................................... 8
Busca global ....................................................................................................................... 8
Consulta por campos .......................................................................................................... 9
Visualizando o resultado de uma consulta ....................................................................... 10
Salvando uma consulta e Abrindo uma consulta salva..................................................... 10
EXPORTANDO OS RESULTADOS DE UMA CONSULTA ........................................... 10
BIBLIOGRAFIA .................................................................................................................. 12
APÊNDICE I ........................................................................................................................ 13
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CRÉDITOS
As versões da IARA e da Base de Dados Corredor Central (BCC) apresentadas neste manual são
produtos do Projeto de pesquisa é um produto do projeto "Abordagens ecológicas e instrumentos
econômicos para o estabelecimento do Corredor Central da Mata Atlântica: uma estratégia para
reverter a fragmentação florestal na Mata Atlântica do sul da Bahia", que foi financiado pelo
Ministério do Meio Ambiente (MMA), através do Projeto de Conservação e Utilização
Sustentável da Diversidade Biológica Brasileira (PROBIO), com apoio do Fundo Global para o
Meio Ambiente (GEF) e Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
(CNPq). Contamos ainda com o suporte financeiro do Centro para Pesquisa Aplicada à
Biodiversidade (CABS) da Conservation International, e do Grupo de Pesquisa de
Desenvolvimento do Banco Mundial (DECRG). Nossos agradecimentos a estas instituições, e
também à Agência Norte-Americana para o Desenvolvimento Internacional (USAID), Fundação
Ford, ao Programa Piloto para a Conservação das Florestas Tropicais, à Ford Motor Company, à
Superintendência de Desenvolvimento Florestal e Unidades de Conservação da Bahia (SFC), ao
Instituto Brasileiro de Meio Ambiente e Recursos Renováveis (IBAMA), à Aliança para a
Conservação da Mata Atlântica, ao Centro de Pesquisas do Cacau (CEPLAC), ao Jardim
Botânico de Nova Iorque, à Universidade da Califórnia/Santa Bárbara (UCSB), e à Universidade
Estadual de Santa Cruz (UESC), e aos proprietários das áreas pesquisadas, pelo generoso apoio
dado à pesquisa do Corredor Central da Mata Atlântica. Para uma descrição completa do projeto
e seus resultados, veja Prado et al. (2003a).
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TERMOS DE USO E ADVERTÊNCIAS
1. A BCC e o IARA são instrumentos para promover o livre acesso à informação sobre
biodiversidade, para fins de pesquisa, educação, conservação, e desenvolvimento
sustentável. Não devem ser usados para fins que estejam em conflito com esses princípios
básicos.
2. O programa IARA 1.0 e a Base Corredor Central (BCC) 1.0 são de domínio público
(“Freeware”) e podem ser usados e distribuídos livremente, desde que citadas
corretamente suas autorias, e desde que não se omitam ou modifiquem sua documentação
ou qualquer de seus arquivos componentes.
3. Os dados da BCC são públicos, mas sua propriedade intelectual pertence aos seus autores.
Seu uso implica no reconhecimento e citação desta autoria, que consta no campo "fonte",
da BCC. Também se exige que seja expresso claramente que os dados foram obtidos da
BCC, citando-lhe corretamente a autoria. Sugere-se que isto seja feito nos seguintes
termos: "os registros de ocorrência de espécies são de autoria de [relação das fontes,
formato autor/ano OU nome da instituição, no caso de espécime de coleção científica],
obtidos por meio da Base de Dados Corredor Central (CI do Brasil & IESB, 2003)".
4. A BCC é destinada a uso final. Seus dados não podem ser redistribuídos, integral ou
parcialmente. O uso da BCC para fins comerciais não é desejável, e só poderá ser feito
com a anuência dos detentores de seus direitos autorais.
5. O programa IARA 1.0 foi criado especificamente para consultas à BCC, e, portanto, não
pode ser usado com outras bases de dados sem modificações. IARA 1.0 e BCC 1.0 são
distribuídos como um recurso público, e não têm qualquer garantia, expressa ou implícita,
incluindo as comerciais e de desempenho esperado para uma finalidade específica.
6. Os dados contidos na BCC passaram por alguns procedimentos simples de validação, mas
sua qualidade e acurácia é variável, e depende de sua fonte. Recomenda-se aos usuários
recorrer às fontes originais e aos seus autores para avaliar se lhe são adequados. Entre
outros aspectos, a consulta a especialistas e/ou autores é essencial para garantir a acurácia
da identificação e nomenclatura taxonômica, e das coordenadas das localidades de
registro.
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7. Registros de espécies, como os contidos na BCC, fornecem apenas a informação positiva
de ocorrência. A inexistência de registros em um local não implica que a espécie não
ocorra lá.
8. Portanto, não há garantia de que os dados estejam acurados, atualizados ou completos
para todos os fins, cabendo ao usuário fazer esta avaliação, e se responsabilizar por ela.
Os autores, titulares dos direitos autorais, e instituições envolvidas, na produção dos
dados e dos programas não se responsabilizam legalmente por quaisquer danos ou
prejuízos decorrentes do uso do programa IARA ou da base de dados BCC.
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INTRODUÇÃO
IARA (Interface de Acesso RÁpido a registros de espécies) é um aplicativo para selecionar
registros de ocorrências de espécies por meio de consultas, visualizar estes registros, e exportálos para uso em outros programas.
Sua versão atual foi desenvolvida em Visual Basic (©Microsoft Inc.), exclusivamente para
consulta aos registros da Base Corredor Central (BCC). Planejam-se novas versões em linguagem
independente de plataforma, e que possam ser usadas com qualquer base de dados. A meta do
projeto IARA é desenvolver um aplicativo rápido e simples de uso livre, para a distribuição de
bases de registros geo-referenciados de ocorrência de espécies.
Este manual orienta a instalação e uso do programa IARA 1.0 para consultar os dados da BCC,
com os quais é distribuído.
O que o IARA é
Uma interface para visualizar rapidamente os registros de espécies da BCC 2.0, selecionar
sub-conjuntos deles através de consultas SQL (Structured Query Language), e exportá-los em um
arquivo ASCII, para ser usado em outros aplicativos.
O principal objetivo do IARA é garantir o acesso aos registros da BCC sem a necessidade
de outros programas.
O que o IARA não é
O IARA não é um aplicativo de processamento ou análise de registros de espécies, como
são, por exemplo, gerenciadores de base de dados, planilhas eletrônicas, programas estatísticos,
ou sistemas de informação geográfica. As duas únicas operações que o IARA realiza são a
consulta e a exportação dos dados.
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INSTALAÇÃO
Execute o programa setup, que copiará os arquivos necessários em um diretório para o IARA que
você indicar (o default é c:/arquivos de programas/BCC). Caso surja alguma mensagem de erro
durante a instalação, por favor anote-a e reporte-a aos autores. Neste caso, tente ignorar a
mensagem, e verifique se a instalação prossegue.
A BASE CORREDOR CENTRAL
Nesta versão, a IARA permite a consulta à BASE CORREDOR CENTRAL (BCC).
A BCC é uma base de dados relacional para os registros de ocorrência de espécies na área do
Corredor Central da Mata Atlântica. Na atual versão (v.2.0), a BCC contém mais de 32.000
registros de plantas, anfíbios, aves e mamíferos, obtidos pelos inventários de campo e pesquisa de
dados secundários do Projeto Corredor Central (Prado et al. 2003a), para a área do Corredor
Central na Bahia (Figura 1).
Figura 1 – Área do Corredor Central da Mata Atlântica (verde), e a parte da Bahia nele incluída (vermelho). A atual
versão da BCC, distribuída com a IARA, contém registros de espécies desta região da Bahia.
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Uma caracterização e análises detalhadas do dados contidos na BCC 1.0 estão em Cordeiro
(2003), Jardim (2003), Moura (2003), Prado et al. (2003b), e Silvano & Pimenta (2003).
Uma tabela simples (“flat table”) foi obtida da BCC, com todos os campos necessários para a
análise dos registros. Esta tabela, em formato Access 97 (PROBIO.MDB), é copiada para o
diretório do IARA, quando este é instalado.
O Apêndice I relaciona e define os campos da BCC que podem ser consultados por meio do
IARA, e que formam a tabela PROBIO.MDB. Cada registro de espécie corresponde a uma linha
da tabela.
JANELA PRINCIPAL E TELAS DE EXIBIÇÃO DOS DADOS
O IARA possui três telas de exibição dos dados, exibidas simultaneamente (Fig. 2):
•
A tela RESULTADOS DA CONSULTA mostra uma planilha com os registros
selecionados em uma consulta (ver item sobre consultas, abaixo). Com as barras de
rolagem, as setas de direção no teclado, e o ponteiro do mouse é possível mover o cursor
pela planilha. Também é possível mudar a largura das colunas da planilha.
A linha na qual está o cursor é o registro ativo da planilha. Este é o registro exibido nas
outra duas telas. A medida que o cursor é movido entre as linhas, um novo registro tornase ativo, e as outras telas são atualizadas. Na atual versão do IARA, não é possível
realizar nenhuma outra operação com os dados da planilha, além desta visualização.
Também não é possível redimensionar a planilha.
•
A tela REGISTRO ATIVO mostra todos os campos do registro da planilha no qual está o
cursor (registro ativo).
•
A tela LOCALIZAÇÃO indica a posição da localidade do registro ativo na malha
municipal da área de estudo. Isto é feito plotando-se as coordenadas geográficas do
registro em um plano cartesiano que tem uma figura da malha municipal, posicionada no
mesmo sistema de coordenadas. Por isso, a tela LOCALIZAÇÃO é para uma visualização
rápida da posição da localidade, e não é uma representação cartográfica acurada.
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Ao iniciar-se o programa IARA, todos os dados são exibidos na tela RESULTADOS DA
CONSULTA, até que seja feita a primeira consulta. A partir de então, esta tela exibirá apenas os
registros resultantes da consulta.
Figura 2 - Janela principal do IARA e suas três telas de exibição.
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CONSULTAS
Clicando no item CONSULTAS da barra de menu, você terá acesso a dois tipos de consultas à
BCC: busca global e consulta por campos ("Consulta específica"). Estas duas opções estão nas
pastas alternativas que são exibidas na janela de consultas (Figura 3). Para trazer uma das pastas
para frente e torná-la ativa, clique sobre ela.
Figura 3 - Janela de consultas, com a pasta de busca global ativa
Busca global
A busca global selecionará todos os registros que contenham a seqüência de caracteres (“string”)
digitados, em qualquer campo da tabela. Se digitado “lontra”, Por exemplo, serão selecionados os
registros de lontra (campo NOME CIENTÍFICO = "Lontra longicaudis",
e campo NOME
VULGAR = "lontra"), os registros da localidade de Serra das Lontras (campo LOCALIDADE =
"[...] Serra das Lontras"), e os registros do gato-mourisco (campo NOME VULGAR = "[...], gatolontra, [...]").
A busca global não é sensível a maiúsculas e minúsculas.
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Consulta por campos
A consulta por campos seleciona os registros cujos os campos satisfaçam às expressões
digitadas pelo usuário. Estas expressões usam os operadores "igual a" (=), "diferente que" (<>),
"maior que" (>), e "menor que" (>), "maior ou igual que" (>=), "menor ou igual que" (<=). As
expressões podem ser combinadas com os operadores booleanos "e" (AND) e "ou" (OR).
Quando usado em campos de texto (string), o operador IGUAL QUE ("=") seleciona
apenas os campos cujos conteúdos sejam exatamente os mesmos que o digitado na consulta. Para
buscar trechos dentro de um campo, use o operador "CONTÉM".
O operador "OR" tem precedência sobre o operador "AND". Ao pesquisar "Município =
Ilhéus OR Município = Una AND Grupo = aves", por exemplo, serão selecionados todos os
registros do Município de Ilhéus, OU do município de Una que sejam do grupo de aves. Para
selecionar os registros de aves dos municípios de Ilhéus e Una é preciso buscar ""Município =
Ilhéus AND Grupo = aves OR Município = Una AND Grupo = aves" (Fig. 4).
Figura 4 - Pasta de consulta por campos, com exemplo de consulta, usando o operador "igual a" e
os operadores "e" e "ou" para combinar expressões.
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Visualizando o resultado de uma consulta
Os registros selecionados pela busca global ou pela consulta por campos são exibidos na tela
"Resultados da Consulta". O registro ativo é exibido nas outras duas telas do IARA, como
explicado na seção "Telas de Exibição".
Salvando uma consulta e Abrindo uma consulta salva
As expressões de uma consulta podem ser salvas para serem abertas e aplicadas novamente.
Escolha “Salvar Consulta”, no menu ARQUIVO. Será exibida uma caixa de diálogo para que dê
um nome e o diretório do arquivo que será salvo. Este arquivo é gravado em formato texto, e
armazena as expressões da consulta, em sintaxe SQL (Structured Query Language).
Para aplicar uma consulta salva, clique em “Abrir uma consulta existente”, no menu
ARQUIVO, e indique o arquivo de consulta que você deseja usar. Uma janela de texto exibirá o
comando SQL. Para fechá-la, clique em “OK”. A consulta será executada imediatamente.
Figura 5 – Janela de diálogo para abrir uma consulta gravada
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Figura 6 – Caixa que exibe a consulta aberta, em sintaxe SQL
EXPORTANDO OS RESULTADOS DE UMA CONSULTA
Clicando na opção "Exportar resultados" do menu ARQUIVO, você pode exportar os
resultados da última consulta (exibidos na tela "Resultados da Consulta") para um arquivo texto
padrão ASCII, com os campos delimitados por ponto-e-vírgula. Indique o nome e diretório do
arquivo de exportação, e clique no botão "SALVAR".
Figura 7 – Caixa de diálogo para salvar os resultados de uma consulta
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BIBLIOGRAFIA
Cordeiro, P.H.C. 2003. Padrões de distribuição geográfica da avifauna, com ênfase nas espécies
endêmicas e ameaçadas, nos remanescentes de Mata Atlântica no sul da Bahia. In: Prado P.I.,
Landau E.C., Moura R.T., Pinto L.P.S., Fonseca G.A.B., Alger K.N. (orgs.) Corredor de
Biodiversidade da Mata Atlântica do Sul da Bahia. Publicação em CD-ROM, Ilhéus, IESB /
CI / CABS / UFMG / UNICAMP.
Moura, R. T. 2003. Distribuição e ocorrência de mamíferos na Mata Atlântica do sul da Bahia .
In: Prado P.I., Landau E.C., Moura R.T., Pinto L.P.S., Fonseca G.A.B., Alger K. (orgs.)
Corredor de Biodiversidade na Mata Atlântica do Sul da Bahia. Publicação em CD-ROM,
IESB / CI / CABS / UFMG / UNICAMP, Ilhéus.
Prado P.I., Landau E.C., Moura R.T., Pinto L.P.S., Fonseca G.A.B., Alger K. (orgs.) 2003.
Corredor de Biodiversidade na Mata Atlântica do Sul da Bahia. Publicação em CD-ROM,
Ilhéus, IESB/CI/CABS/UFMG/UNICAMP.
Prado P.I., Pinto L.P.S., Moura R.T., Carvalho A. M., Thomas W.W., Amorim A. & Aguiar C.
2003. Caracterização dos registros de ocorrência de espécies de plantas e mamíferos no sul da
Bahia. In: Prado P.I., Landau E.C., Moura R.T., Pinto L.P.S., Fonseca G.A.B., Alger K.
(orgs.) Corredor de Biodiversidade na Mata Atlântica do Sul da Bahia. Publicação em CDROM, Ilhéus, IESB/CI/CABS/UFMG/UNICAMP.
Silvano D.L. & Pimenta B.V.S. 2003. Diversidade e distribuição de anfíbios anuros na Mata
Atlântica do sul da Bahia. In: Prado P.I., Landau E.C., Moura R.T., Pinto L.P.S., Fonseca
G.A.B., Alger K. (orgs.) Corredor de Biodiversidade na Mata Atlântica do Sul da Bahia.
Publicação em CD-ROM, IESB / CI / CABS / UFMG / UNICAMP, Ilhéus.
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APÊNDICE I
DESCRIÇÃO DOS CAMPOS DA BCC DISPONÍVEIS PARA CONSULTA
(TABELA PROBIO.MDB)
NOME DO CAMPO
DEFINIÇÃO
Cod_Registro
Código numérico único do registro (chave primária)
Município
Nome do município do registro (Na malha municipal IBGE, 1991)
Localidade
Nome da localidade, conforme informado pelo autor do registro
Lat
Latitude da localidade, em graus decimais, Hemisfério Sul. Precisão
de meio minuto (0,08 graus)
Long
Longitude da localidade, em graus decimais, oeste de Greenwich.
Precisão de meio minuto (0,08 graus).
Grupo
Grupo funcional/taxonômico da espécie registrada
Classe
Classe da espécie registrada
Ordem
Ordem da espécie registrada
Familia
Família da espécie registrada
Gênero
Gênero da espécie registrada
Nome científico
Nome científico da espécie registrada
Nome vulgar
Nome vulgar da espécie registrada
Ano registro
Ano em que o registro foi feito (pode não coincidir com o ano de
sua publicação, que está no campo "fonte")
Tipo registro
Tipo de registro, nas seguintes categorias:
OBSERVAÇÃO: visualização, audição, captura ou coleta em
campo, pelo autor do registro;
ENTREVISTA: relato por terceiros, ao autor do registro, de
ocorrência da espécie em uma localidade;
RESTOS: pele, penas, sementes, e outros partes de um ou mais
indivíduos da espécie, vistos na localidade;
CATIVO: indivíduo cativo ou cultivado na localidade;
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NOME DO CAMPO
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DEFINIÇÃO
INDÍCIO: pegadas, fezes, e outros indícios indiretos de ocorrência
da espécie na localidade;
COLEÇÃO: espécime depositado em coleção científica.
Extinto
Se há evidências de que a espécie esteja atualmente extinta na
localidade (SIM/NÃO/PROVAVELMENTE).
Fonte
Fonte do registro. Referência bibliográfica, caso provenha de uma
publicação; ou instituição de origem (dados adicionais se possível),
se é espécime de coleção científica.
Autoridade
Pesquisador do Projeto Corredor Central que obteve, validou e
inseriu o registro.
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