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50º Congresso Brasileiro de Genética
Resumos do 50º Congresso Brasileiro de Genética • 7 a 10 de setembro de 2004
Costão do Santinho • Florianópolis • Santa Catarina • Brasil
www.sbg.org.br - ISBN 85-89109-04-6
[email protected]
Palavras-chave: Leishmania chagasi, Bioinformática,
categorização, ESTs, Transcriptoma
Casanova, FM; Queiroz, RA; Kido, EA; Andrade, PP
Departamento de Genética da UFPE
Categorização parcial do banco
de ESTs de Leishmania chagasi
A Leishmania chagasi, pertencente à ordem Kinetoplastida e à família Trypanosomatidae, é o agente etiológico
da leishmaniose visceral na Região Neotropical, infectando o homem e outros mamíferos. No Brasil acomete
cerca de 4.500 pessoas por ano, com grande maioria dos casos sendo observada na região Nordeste. A
terapêutica ainda é bastante precária e não existem vacinas para o homem e para os reservatórios. O estudo do
transcriptoma da L.chagasi pode abreviar a obtenção de novos alvos terapêuticos, contribuindo para o controle
da leishmaniose. Foi descrita a análise de 17.921 reads deste parasita, geradas a partir de uma biblioteca
de cDNA de promastigostas em fase exponencial de crescimento. As seqüências foram avaliadas quanto à
qualidade e agrupadas, nesta segunda clusterização, em 1449 clusters com o auxílio do programa Phred e CAP3,
respectivamente. A comparação destes clusters com as do banco não redundante de seqüências do GenBank
foi feita através da ferramenta BLASTx. Do total de clusters, 273 possíveis produtos gênicos foram anotados
e posteriormente organizados em categorias utilizando-se o banco de COGs (Cluster of Orthologous Groups) para
agrupar os genes de L. chagasi que partilham funções ou domínios comuns e que, por conseqüência, estão
envolvidos em um mesmo processo celular. Do total de clusters anotados, 67 apresentaram funções relacionadas
ao processamento e armazenamento de informações, 81 mostraram-se relacionados aos processos celulares, 86
referentes ao metabolismo e 39 agrupados como pobremente caracterizados. Das categorias funcionais mais
bem representadas, destacaram-se as que são referentes a genes ligados ao processo de tradução, biogênese e
genes ribossomais, (18% dos clusters anotados), genes ligados aos processos de modificação pós-traducional,
chaperoninas e genes de reciclagem (10%) e os genes que participam do metabolismo e transporte de
carboidratos (8%). Desse agrupamento funcional pôde-se observar que, apesar do sequenciamento de ESTs de
L. chagasi ainda estar em andamento, a biblioteca de crescimento exponencial apresenta uma boa distribuição
dos transcritos com maior representatividade dos genes que participam do processo de biogênese e produção
de energia. Essa classificação parcial será fundamental para a compreensão da interação funcional das possíveis
proteínas traduzidas e para maiores estudos sobre a evolução do transcriptoma deste parasita.
Apoio Financeiro: CNPq (Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico). FACEPE (Fundação
de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco)
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