Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Memória da Pós-Graduação Linhas de Pesquisa Sistema de Avaliação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS III Relações Nominais ANO BASE: 2009 PROGRAMA: 33002010022P-3 CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (MICROBIOLOGIA) - USP Linha de Pesquisa Projeto Isolado Descrição: Linha de Pesquisa de Projetos Isolados Área de Concentração: Linha de Pesquisa Bactérias de interesse médico e veterinário Descrição: Esta linha de pesquisa estuda a interação entre bactérias patogênicas e hospedeiros, englobando identificação, detecção, epidemiologia e caracterização dos fatores de virulência destas bactérias. Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: . Amostras de Shiga-toxins Escherichia coli ( STEC ) isoladas em São Paulo, de bovinos, suínos, humanos e alimentos de origem animal, utilizando a Separação Imuno-Magnética. Fatores de Virulência e freqüência dos sorotipos O111:H-, O118:H16 e O157:H7 . Analise proteômica de adesinas de Escherichia coli enteropatogênica atípica Situação Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Caracterização fenotípica e genotípica de alguns fatores de virulência e suceptibilidade a antimicrobianos de espécies do grupo Bacteroides fragilis . Citotoxicidade, aderência e invasão de cepas de Aggregatibacter actinomycetemcomitans isolados de pacientes portadores e não portadores de doença periodontal . Detecção simultânea de DNA de Brucella spp e Leptospira spp em amostras clínicas de abortamentos bovinos através da reação em cadeia pela polimerase (multiplex-PCR) . Escherichia coli enteropatogênica atípica (EPEC atípicas) Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Estudo da frequência e caracterização genotípica e fenotípica de amostras de Em Andamento Escherichia coli produtoras da Toxina de Shiga (STEC eae- e eae+) isoladas de ovinos no Estado de São Paulo e sua import. como agnetes de enfermidades diarreiogênicas em humanos . Estudos dos fatores de virulência em amostras de Escherichia coli enteropatogênica Em Andamento (EPEC), isoladas de gatos com e sem diarréia no Brasil. . Resistência e tipagem bacteriana Em Andamento Projeto de Pesquisa . Tipificação genomica de Mycoplasma gallisepticum por meio de PCR com primers arbitrários e da eletroforese de campo pulsado Projeto de Pesquisa Chronos 1 de 6 Em Andamento Projeto de Pesquisa Projeto de Pesquisa 09/04/10 às 16:47 Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Memória da Pós-Graduação Linhas de Pesquisa Sistema de Avaliação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS III Relações Nominais ANO BASE: 2009 PROGRAMA: 33002010022P-3 CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (MICROBIOLOGIA) - USP Linha de Pesquisa Biotecnologia Descrição: Estudo da capacidade de utilização do potencial de microrganismos com finalidade biotecnológica, de genes envolvidos e análise de condições ideais de produção, da ocorrência de biofilmes bacterianos em plantas industriais e métodos de controle. Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: . Biosensores luminescentes e polímeros adesivos não específicos Situação Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa . Biossíntese e controle da composição de polímeros bacterianos biodegradáveis híbridos, contendo monômeros de cadeias carbônicas curtas e médias . Caracterização da via biossintética do agente antitumoral retamicina produzido por Streptomyces olindensis e obtençã de híbridos por biossintese combinatória. . Construção de bibliotecas metagenômicas do solo da Mata Atlântica e isolamento de produtos bioativos . Desenvolvimento de novas tecnologias para remediação de solos e aquíferos contaminados com hidrocarbonetos solúveis . Efeito de plantas medicinais brasileiras na expressão e atividade da Glutationa-S-tranferase em hepatócitos e células leucêmicas . Manipulação genética de Streptomyces avermitilis para a produção de novos compostos policetônicos e melhoramento de sua produção por via fermentativa. . Obtenção de fosfato para uso agrícola a partir de águas residuárias Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Partículas biomiméticas para aplicação em biomedicina Em Andamento Projeto de Pesquisa Linha de Pesquisa Desenvolvimento de vacinas e terapia gênica Descrição: Esta linha de pesquisa estuda a utilização de diferentes estratégias vacinais, utilização de adjuvantes, identificação de imunógenos, e desenvolvimento de vetores para terapia gênica. Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: . Construção de vetores adenovirais ou baseados em Epstein-Barr para terapia gênica do câncer. . Potencialização de agentes quimioterápicos através de siRNA para silenciamento de processos de reparo de DNA. . Reparo de DNA e suas consequências biológicas. Situação Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Vacinas contra paracoccidioidomicose: modelo experimental utilizando camundongos Balb/c protegidos por vetores de expressão contendo sequências para P10, HSP60 e IL-12 Em Andamento Projeto de Pesquisa Chronos 2 de 6 09/04/10 às 16:47 Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Memória da Pós-Graduação Linhas de Pesquisa Sistema de Avaliação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS III Relações Nominais ANO BASE: 2009 PROGRAMA: 33002010022P-3 CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (MICROBIOLOGIA) - USP Linha de Pesquisa Diagnóstico, epidemiologia e caracterização molecular de vírus Descrição: Esta linha de pesquisa estuda os principais vírus humanos e animais circulantes no Brasil. Os aspectos estudados são o isolamento, identificação, detecção, evolução, métodos diagnósticos, epidemiologia e caracterização da interação com o hospedeiro. Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: Situação . Caracterização genômica de vírus neurotrópicos e adenovirus humanos e interação Em Andamento com a célula hospedeiro . Caracterização molecular de patógenos virais de importância em saúde pública Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa . Caracterização sorológica e molecular de rotavírus de humanos e de animais: identificação, genotipagem e sequenciamento genômico de vírus Norwalk-like em amostras fecais de crianças com gastroenterite . Correlação entre a resposta imune e a excreção viral em crianças vacinadas contra o sarampo. . Detecção do Herpesvirus bovino tipo 1 (BHV-1) e parvovírus suíno através da reação em cadeia pela polimerase (PCR) . Diagnóstico molecular de doenças aviárias Concluído Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto sem natureza definida . Diversidade e filogenia de vírus Em Andamento Projeto de Pesquisa . Estudo da Infectividade, Transmissibilidade, Estado de Portador (Reservatório) e da Em Andamento Resposta Imune Humoral de Pombos (Columba livia) Submetidos à Infecção Experimental Frente ao Vírus da Doença de Newcastle . Estudo dos receptores celulares para adenovírus entérico sorotipo 41. Em Andamento Projeto de Pesquisa . Estudo filogenético de adenovírus das espécies B e C, isolados de casos de Em Andamento Infecção Respiratória Aguda, em São Paulo, de 1995 a 2005 . Expressão de peptídeos de HRSV e HIV para estudos de imunização e moleculares Em Andamento Projeto de Pesquisa . Produção de pseudo-partículas do hantavírus Araraquara, em sistemas eucariotos. Projeto de Pesquisa Chronos 3 de 6 Em Andamento Projeto de Pesquisa Projeto de Pesquisa Projeto de Pesquisa 09/04/10 às 16:47 Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Memória da Pós-Graduação Linhas de Pesquisa Sistema de Avaliação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS III Relações Nominais ANO BASE: 2009 PROGRAMA: 33002010022P-3 CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (MICROBIOLOGIA) - USP Linha de Pesquisa Fisiologia e biologia molecular de microrganismos Descrição: Estudo da fisiologia metabolismo e genética de bactérias e fungos, englobando a caracterização da resposta a estresses, mecanismos de regulação gênica, reparo de DNA, biogênese de organelas, fixação de nitrogênio, transporte e obtenção de energia. Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: . Análise estrutural de proteínas de natureza microbiana Situação Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa . Bactérias fixadoras de nitrogênio e associadas a húmus: caracterização e aplicações biotecnológicos . Biogênese mitocondrial Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Caracterização de Componenetes do Envoltório Celular de Xanthomonas citri e Analise funcional do transportador de oligopeptídeos. . Caracterização de genes envolvidos na resposta a estresses em Caulobacter crescentus . Caracterização de genes pertencentes ao regulon PHO e resistência geral ao estresse em Chromobacterium violaceum . Desenvolvimento de novas estratégias vacinais contra patógenos bacterianos. Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Estudo da regulação de sistemas de resposta a metais na alfa-proteobactéria Caulobacter crescentus . Estudo de componentes do envoltório celular de bactérias Gram-negativas Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Excreção de aminoácidos e de substâncias reguladoars do crescimento vegetal por Em Andamento bactérias endofíticas diazotróficas isoladas de cana-de-açúcar . O fator sigmaS da RNA polimerase em linhagens de Escherichia coli diarreiogênicas Em Andamento Projeto de Pesquisa . O sistema Pst de transporte de fosfato e o regulon PHO. Mecanismo de regulação transcricional e seu papel na adesão de Escherichia coli . Projeto Genoma Schistosoma mansoni Em Andamento Projeto de Pesquisa Concluído Projeto de Pesquisa . Respostas celulares a lesões no genoma Em Andamento Projeto de Pesquisa . Stablishment of conditions for the disruption of genes potentially involved in Xylella fastidiosa pathogenesis . Utilização de co-culturas para o estudo das interações entre células de cana-de-açúcar com bactérias endofíticas fixadoras de nitrogênio isoladas de cana-de-açúcar Concluído Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Chronos 4 de 6 Projeto de Pesquisa 09/04/10 às 16:47 Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Memória da Pós-Graduação Linhas de Pesquisa Sistema de Avaliação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS III Relações Nominais ANO BASE: 2009 PROGRAMA: 33002010022P-3 CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (MICROBIOLOGIA) - USP Linha de Pesquisa Fungos patogênicos Descrição: Esta linha de pesquisa estuda os principais fungos patogênicos, com atividade alergênica e toxig~enica, englobando isolamento, identificação, detecção, epidemiologia e caracterização dos fatores de virulência Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: . Aspectos fenotípicos, genotípicos e fatores de virulência de dermatófitos isolados de humanos, animais e do ambiente de Rondonia e de outras regiões do Brasil . Candidíase vulvovaginal primária e recorrente, sorotipagem, polimorfismo molecular, avaliação clínica, isolamento e perfil antifúngico de amostras isoladas e determinação da sensibilidade a drogas antifúngicas . Distribuição de fungos e de micotoxinas em amostras de amendoim do plantio à colheita . Distribuição de fungos e de micotoxinas em grãos de milho recém-colhidos e estudo da variabilidade genética das cepas de Aspergillus flavus e Fusarium verticicclioides isoladas . Fungos em bibliotecas. Freqüência e desenvolvimento de teste para avaliação de resistência de papéis à biodeterioração e a sensibilidade in vitro a antifúngicos e genótipos de C. neoformans . Mecanismo de ação dos anticorpos na paracoccidioidomicose Situação Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Sensibilidade aos novos e usuais antifúngicos de amostras hospitalares de leveduras por diferentes técnicas laboratoriais: caracterização genotipica das amostras e associação dos resultados . Variabilidade fenotípica e genotípica de Cryptococcus neoformans na cidade de Monte Negro, Rondonia Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Linha de Pesquisa Microbiologia ambiental e ecologia Descrição: Estudo da biodiversidade taxonômica e funcional de Archaea, Bacteria e Vírus no ambiente, sua resposta a impactos ambientais, caracterização fenotípica e molecular das espécies, circulação destes no ambiente e gerenciamento de riscos microbiológicos. Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: . Avaliação do risco microbiológico da água de lastro, eficiência da troca de água de lastro e diagnóstico da qualidade da água dos portos . Detecção rápida de parvovírus e coronavírus caninos em amostras de fezes diarréicas por duplex-PCR . Diversidade de bactérias associadas a degradação de compostos Situação Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Ecologia, Patogenicidade e Epidemiologia Molecular de Escherichia coli, Salmonella Em Andamento spp e Vibrio cholerae isolados de ambientes aquáticos e de amostras de humanos sadios, na cidade de Montenegro, Rondônia . Epidemiologia molecular de cepas latinoamericanas de Vibrio cholerae 01 Em Andamento Projeto de Pesquisa . Estudo ciológico da fibropapilomatose de tartarugas marinhas da espécie C. mydas. Em Andamento I. Vírus . Estudo dos sistemas naturais e artificiais de cargas poluidoras para a Em Andamento sustentabilidade deos recursos hídricos do baixo ribeira e Iguape . Identificação dos grupos de vírus da Hepatite A e dos subgêneros de adenovírus Em Andamento presentes em águas de esgoto e de superfície. Projeto de Pesquisa Chronos 5 de 6 Projeto de Pesquisa Projeto de Pesquisa Projeto de Pesquisa 09/04/10 às 16:47 Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Memória da Pós-Graduação Linhas de Pesquisa Sistema de Avaliação CIÊNCIAS BIOLÓGICAS III Relações Nominais ANO BASE: 2009 PROGRAMA: 33002010022P-3 CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (MICROBIOLOGIA) - USP Linha de Pesquisa Microbiologia Oral Descrição: Esta linha de pesquisa estuda a interação entre patógenos orais e hospedeiros, englobando identificação, detecção, epidemiologia e caracterização da formação de biofilme e dos fatores de virulência destas bactérias. Área de Concentração: MICROBIOLOGIA Projetos de Pesquisa: . Análise da microbiota oral por ferramentas de metagenômica Situação Em Andamento Natureza Projeto de Pesquisa . Fatores de virulência de A. actinomycetemcomitans: participação na doença, regulação da expressão, diversidade e resposta imune. . Fatores de virulência de organismos orais Em Andamento Projeto de Pesquisa Em Andamento Projeto de Pesquisa . Possíveis patógenos endodônticos em canais radiculares: prevalência, fatores de virulência, caracterização genotípica e susceptibilidade à drogas antimicrobianas Em Andamento Projeto de Pesquisa Chronos 6 de 6 09/04/10 às 16:47