FRANCLIM RICARDO DA SILVA RIBEIRO – Curriculum Vitae – Porto, 20 de Agosto de 2007 DADOS PESSOAIS Nome completo: Franclim Ricardo da Silva Ribeiro Data de nascimento: 14.12.1979 Naturalidade: Paranhos, Porto Nacionalidade: Portuguesa Estado civil: Solteiro Endereço: Rua Adélia Ferreira Santos Carvalho, nº 18, 2º Frente 4470-130 MAIA Telefone/Telemóvel: (351) 229484945 / (351) 917921341 Correio electrónico: [email protected] Endereço profissional: Serviço de Genética, Instituto Português de Oncologia do Porto Rua Dr. António Bernardino de Almeida, 4200-072 Porto, Portugal Telefone / Fax: (351) 225084000 / (351) 225084016 HABILITAÇÕES ACADÉMICAS 1997 Ensino secundário, Escola Secundária da Maia (Classificação final: 19) 2001 Licenciatura em Biologia pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (Classificação final: 16). 2001 Certificado de Inglês Avançado, Universidade de Cambridge (Grade A). 2006 Doutoramento em Ciências Biomédicas (Genética Humana) pelo Instituto de Ciências Biomédicas de Abel Salazar - Universidade do Porto. DOMÍNIO DE ESPECIALIZAÇÃO/ÁREA DE ACTIVIDADE Genética do cancro; Técnicas de citogenética convencional e citogenética molecular em oncologia. ACTUAIS INTERESSES DE INVESTIGAÇÃO Identificação de marcadores genéticos com valor diagnóstico e/ou prognóstico em doentes com carcinoma da próstata, recorrendo a técnicas de citogenética molecular e de genética molecular de alta resolução (microarrays genómicos e de expressão). 1/5 EXPERIÊNCIA PROFISSIONAL Jan-Jun 2001 Estágio de Licenciatura ao abrigo do programa ERASMUS, no Departamento de Genética do Institute for Cancer Research and Treatment de Turim, Itália (Classificação final: 19 valores). 2002-2006 Doutorando no Serviço de Genética do IPO-Porto e no Institute for Cancer Research, Oslo, Noruega. Título da tese: “Diagnostic and prognostic value of molecular cytogenetic analysis of ultrasound-guided prostate needle biopsies from prostate cancer suspects.” Jan-Jun 2007 Investigador no Department of Cancer Prevention, Institute for Cancer Research, Oslo, Noruega. Título do projecto: “Genomic master-keys in cancer”. Julho 2007- Bolseiro de Pós-Doutoramento no Serviço de Genética do IPO-Porto e no Institute for Cancer Research, Oslo, Noruega. Título do projecto: “Microarray analyses of prostate cancer: integrating genome-wide DNA copy number changes and RNA expression levels to uncover molecular markers of disease progression”. ACTIVIDADE DOCENTE Colabora desde 2004 na docência de módulos de Programas de Mestrado realizados anualmente nas instalações do IPO-Porto, nomeadamente: Módulo de Citogenética Molecular do Mestrado em Medicina e Oncologia Molecular da Faculdade de Medicina da Universidade do Porto Módulo de Biopatologia do Mestrado em Oncologia do Instituto de Ciências Biomédicas de Abel Salazar, Universidade do Porto ACTIVIDADE CIENTÍFICA PROJECTOS DE INVESTIGAÇÃO Participa/participou na elaboração e execução dos seguintes projectos de investigação: 2002-2005 POCTI/CBO/38853/2001: Diagnostic and prognostic value of cytogenetic and molecular genetic analyses of sextant biopsies from prostate cancer suspects. Financiado pela Fundação para a Ciência e Tecnologia. 2005-2007 POCTI/SAU-OBS/58357/2004: Identification of target genes in regions of recurrent genomic deletions or amplifications common to breast and prostate cancer. Financiado pela Fundação para a Ciência e Tecnologia. 2007-2009 PTDC/SAU-OBD/70543/2006: Caracterização de genes de fusão envolvendo a família de factores de transcrição ETS e do seu valor diagnóstico e prognóstico no cancro da próstata. Financiado pela Fundação para a Ciência e Tecnologia. 2/5 ACTIVIDADE DE REVISÃO DE TRABALHOS CIENT ÍFICOS A convite dos respectivos editores, realizou revisão de artigos científicos (“peer-review”) para as seguintes revistas internacionais: Nucleic Acids Research BMC Cancer Membro do painel de avaliação de projectos de Investigação: Por convite do “Biomedical and Therapeutic Research Committee” do Ministério da Saúde da Escócia, desempenhou as funções de avaliador de projecto de investigação na área da Oncologia no ano de 2006. TESES 2006 “Diagnostic and prognostic value of molecular cytogenetic analysis of ultrasound-guided prostate needle biopsies from prostate cancer suspects”. Dissertação de Doutoramento em Ciências Biomédicas (Genética Humana), defendida no ICBAS-UP em Novembro de 2006. CAPÍTULOS DE LIVROS 2006 Ribeiro FR, Skotheim RI, Henrique R, Teixeira MR. Array-based comparative genomic hybridization in prostate cancer: research and clinical applications. In: Methods of Cancer Diagnosis, Therapy and Prognosis. Hayat MA (editor), Springer Publishers, USA, 2006, in press. PUBLICAÇÕES INTERNACIONAIS 1. Teixeira MR, Ribeiro FR, Cerveira N, Torres L, Amaro T, Henrique R, Lopes C. Karyotypic divergence and convergence in two synchronous lung metastases of a clear cell sarcoma of tendons and aponeuroses with t(12;22)(q13;q12) and type 1 EWS/ATF1. Cancer Genet Cytogenet 2003;145:121. 2. Jerónimo C, Henrique R, Hoque MO, Ribeiro FR, Oliveira J, Fonseca D, Teixeira MR, Lopes C, Sidransky D. Quantitative RARβ2 hypermethylation: a promising prostate cancer marker. Clin Cancer Res 2004;10:4010. 3. Teixeira MR, Ribeiro FR, Wæhre H, Stenwig AE, Giercksky KE, Heim S, Lothe RA. Genomic analysis of prostate carcinoma specimens obtained via ultrasound-guided needle biopsy may be of use in preoperative decision-making. Cancer 2004;101:1786. 4. Teixeira MR, Ribeiro FR, Torres L, Pandis N, Andersen JA, Lothe RA, Heim S. Assessment of clonal relationship of ipsilateral and bilateral breast carcinomas by comparative genomic hybridization and hierarchical clustering. Br J Cancer 2004; 91:775-782. 5. Jerónimo C, Henrique R, Hoque MO, Mambo E, Ribeiro FR, Varzim G, Oliveira J, Teixeira MR, Lopes C, Sidransky D. Quantitative methylation profiling of prostate cancer correlates with clinicopathological parameters. Clin Cancer Res 2004;10:8472. 6. Cerveira N, Torres L, Ribeiro FR, Pinto A, Ferreira AM, Lopes C, Teixeira MR. Multimodal genetic diagnosis of the solid variant of alveolar rhabdomyosarcoma. Cancer Genet Cytogenet 2005;163:138. 7. Diep CB, Kleivi K, Ribeiro FR, Teixeira MR, Lindgjaerde OC, Lothe RA. The order of genetic events associated with colorectal cancer progression inferred from meta-analysis of copy number changes. Genes Chrom Cancer 2006;45:31. 3/5 8. Ribeiro FR, Diep CB, Jerónimo C, Henrique R, Lopes C, Eknæs M, Lingjærde OC, Lothe RA, Teixeira MR. Statistical dissection of genetic pathways involved in prostate carcinogenesis. Genes Chrom Cancer 2006;45:154. 9. Henrique R, Jerónimo C, Teixeira MR, Hoque MO, Carvalho A, Pais I, Ribeiro FR, Oliveira J, Lopes C, Sidransky D. Epigenetic heterogeneity of high-grade prostatic intraepithelial neoplasia: clues for clonal progression in prostate carcinogenesis. Mol Cancer Res 2006;4:1. 10. Ribeiro FR, Jerónimo C, Henrique R, Fonseca D, Oliveira J, Lothe RA, Teixeira MR. 8q gain is an independent predictor of poor survival in diagnostic needle biopsies from prostate cancer suspects. Clin Cancer Res 2006;12:3961. 11. Cerveira N, Ribeiro FR, Peixoto A, Costa V, Henrique R, Jerónimo C, Teixeira MR. TMPRSS2ERG gene fusion causing ERG overexpression precedes chromosome copy number changes in prostate carcinomas and paired HGPIN lesions. Neoplasia 2006;8:826. 12. Tsarouha H, Kyriazoglou AI, Ribeiro FR, Teixeira MR, Agnantis N, Pandis N. Chromosome banding analysis and molecular cytogenetic investigations of an epithelioid hemangioendothelioma. Cancer Genet Cytogenet 2006;169:164. 13. Henrique R, Costa V, Cerveira N, Carvalho AL, Hoque MO, Ribeiro FR, Oliveira J, Teixeira MR, Sidransky D, Jeronimo C. Hypermetilation of Cyclin D2 is associated with loss of expression and tumor development in prostate cancer. J Mol Med 2006;84:911. 14. Ribeiro FR, Henrique R, Hektoen M, Berg M, Jerónimo C, Teixeira MR, Lothe RA. Comparison of chromosomal and array-based comparative genomic hybridization for the detection of genomic imbalances in primary prostate carcinomas. Mol Cancer 2006;5:33. 15. Ribeiro FR. Diagnostic and prognostic value of molecular cytogenetic analyses of sextant biopsies from prostate cancer suspects. Crit Rev Oncog 2006;12:303. 16. Torres L, Ribeiro FR, Pandis N, Andersen JA, Heim S, Teixeira MR. Intratumor genomic heterogeneity in breast cancer with clonal divergence between primary carcinomas and lymph node metastases. Breast Cancer Res Treat 2007;102:143. 17. Pinto M, Soares MJ, Cerveira N, Henrique R, Ribeiro FR, Oliveira J, Jerónimo C, Teixeira MR. Expression changes of the MAD mitotic checkpoint gene family in renal cell carcinomas characterized by numerical chromosome changes. Virchows Arch 2007;450:379. 18. Costa VL, Henrique R, Ribeiro FR, Pinto M, Oliveira J, Lobo F, Teixeira MR, Jeronimo C. Quantitative promoter methylation analysis of multiple cancer-related genes in renal cell tumors. BMC Cancer 2007;7:133. 19. Ribeiro FR, Henrique R, Martins AT, Jerónimo C, Teixeira MR. Relative copy number gain of MYC in diagnostic needle biopsies is an independent prognostic factor in prostate cancer patients. Eur Urol 2007;52:116. COMUNICAÇÕES ORAIS EM CONFERENCIAS INTERNACIONAIS 1. Jerónimo C, Henrique R, Hoque MO, Mambo E, Ribeiro FR, Varzim G, Oliveira J, Teixeira M R, Lopes C, Sidransky D. Perfil epigenético do carcinoma da próstata usando métodos quantitativos. 8ª Reunião da Sociedade Portuguesa de Genética Humana. Porto, 17-19 Novembro 2004. 2. Ribeiro FR, Jerónimo C, Henrique R, Lopes C, Eknaes M, Diep CB, Lothe RA, Teixeira MR. Genome analysis of screen detected prostate carcinomas and benign prostatic hyperplasias: CGH correlates with histopathological parameters and biological behaviour. 9th European Workshop on Cytogenetics and Molecular Genetics of Human Solid Tumors. Brno, 16-19 Setembro 2004. 3. Ribeiro FR. Diagnostic and prognostic value of molecular cytogenetic analysis of sextant biopsies from prostate cancer suspects. 1as Jornadas Científicas do Centro de Investigação do IPO-Porto, 20 Dezembro 2004. 4. Ribeiro FR, Jerónimo C, Henrique R, Lothe RA, Teixeira MR. DNA copy number profile in prostate cancer using chromosomal and array-based CGH. Committee on Solid Tumors, COST B19 meeting. Nice, France, 2005. 4/5 5. Ribeiro FR, Jerónimo C, Henrique R, Fonseca D, Oliveira J, Lothe RA, Teixeira MR. Genome profiling of needle biopsies from prostate cancer suspects. 5th European Cytogenetics Conference. Madrid, 4-7 Junho 2005. 6. Cerveira N, Ribeiro FR, Peixoto A, Henrique R, Costa V, Jerónimo C, Teixeira MR. TMPRSS2ERG gene fusion and ERG overexpression in prostate carcinomas and paired high-grade prostatic intraepithelial neoplasias. 10th European Workshop of Molecular Cytogenetics in Human Solid Tumors. La Grande Motte, 8-11 Junho 2006. 7. Henrique R, Jerónimo C, Teixeira MR, Hoque MO, Carvalho AL, Pais I, Ribeiro FR, Oliveira J, Lopes C, Sidransky D. Heterogeneidade epigenética em lesões de PIN (prostatic intraepithelial neoplasia): evidência de progressão clonal na carcinogénese prostática. Jornadas do Departamento de Oncologia Médica. Espinho, 11-13 Janeiro 2006. 1º Prémio das comunicações orais. COMUNICAÇÕES EM PAINEL (POSTERS) 1. Ribeiro FR, Jerónimo C, Henrique R, Lopes C, Teixeira MR. Análise por hibridação comparativa do genoma de 51 carcinomas e 30 hiperplasias benignas da próstata: associação entre o padrão de alterações genéticas e parâmetros histopatológicos. 7ª Reunião da Sociedade Portuguesa de Genética Humana. Lisboa, 26-28 Novembro 2003. 2. Teixeira MR, Ribeiro FR, Cerveira N, Torres L, Amaro T, Henrique R, Lopes C. Evolução clonal em duas metástases pulmonares de um sarcoma de células claras com t(12;22)(q13;q12) e gene de fusão EWS/ATF1. 7ª Reunião da Sociedade Portuguesa de Genética Humana. Lisboa, 26-28 Novembro 2003. 3. Jerónimo C, Henrique R, Hoque MO, Ribeiro FR, Oliveira J, Fonseca D, Teixeira MR, Lopes C, Sidransky D. Quantitative RAR-beta2 hypermethylation: a promising prostate cancer marker. 95th American Association for Cancer Research Meeting. Orlando, Março, 2004. 4. Teixeira MR, Ribeiro FR, Torres L, Pandis N, Andersen JA, Lothe RA, Heim S. Assessment of clonal relationships in ipsilateral and bilateral multiple breast carcinomas by comparative genomic hybridisation and hierarchical clustering analysis. 9th European Workshop on Cytogenetics and Molecular Genetics of Human Solid Tumors. Brno, 16-19 Setembro 2004. 5. Cerveira N, Torres T, Ribeiro FR, Lopes C, Teixeira MR. Diagnóstico genético da variante sólida do rabdomiossarcoma alveolar. 8ª Reunião da Sociedade Portuguesa de Genética Humana. Porto, 17-19 Novembro 2004. 6. Torres L, Ribeiro FR, Anderssen JA, Pandis N, Heim S, Teixeira MR. Divergent clonal evolution in breast carcinomas and respective lymph node metástases. 5th European Cytogenetics Conference. Madrid, 4-7 Junho 2005. BOLSAS/PRÉMIOS 2002-2005 Bolsa de doutoramento SFRH/BD/7067/2001, atribuída pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia. 2005 1ª Menção Honrosa – Prémio LabMed de Medicina Laboratorial, pelo trabalho: “8q gain is an independent predictor of poor survival in diagnostic needle biopsies from prostate cancer suspects”, pelos autores Ribeiro FR, Jerónimo C, Henrique R, Fonseca D, Oliveira J, Lothe RA and Teixeira MR. 2006 Bolsa de Investigação da Liga Portuguesa Contra o Cancro (Núcleo Regional do Norte). 2007-2009 Bolsa de Pós-Doutoramento SFRH/BPD/26492/2006, atribuída pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia. Título do projecto: “Microarray analyses of prostate cancer: integrating genome-wide DNA copy number changes and RNA expression levels to uncover molecular markers of disease progression”. 5/5