Introdução a Expressão Gênica

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Introdução à expressão gênica
Dalila L. Zanette
Proteínas exercem as funções básicas
Proteínas:
-
Estrutura dos organismos
-
Enzimas que catalisam as reações bioquímicas
-
Hormônios
O DNA codifica as diferentes proteínas
Nucleotídeo – unidade básica do DNA
Nucleotídeo: unidade básica de repetição na fita de DNA
Nucleotídeo : açúcar (desoxirribose) + base nitrogenada
Estrutura do DNA
Os nucleotídeos se ligam uns aos outros – ligação fosfodiéster
Estrutura do DNA :
hélice dupla antiparalela
Estrutura do RNA
Pentose : ribose
No lugar da timina, uracila
RNA mensageiro
sintetizado no núcleo a partir do DNA
TRANSCRIÇÃO
Código genético
Seqüência de 3 nucleotídeos do DNA : códon
A seqüência destes códons no DNA é copiada em RNAm
Codifica um aminoácido, unidade básica da
estrutura das proteínas
A seqüência dos aminoácidos dá origem a diferentes
proteínas
Códons
Dogma central da biologia molecular
Dogma central da biologia molecular
Informação para síntese protéica
Conceito de gene
Um segmento de DNA que tem a informação necessária
para a síntese de uma proteína
Composto por :
-
regiões codificantes – éxons
-
regiões não-codificantes - íntrons
Estrutura do gene
zoom
INTRONS
3`
5`
EXONS
Estrutura do gene
DIVERSIDADE CELULAR
Organismos multicelulares
Síntese e acúmulo de diferentes RNAs e proteínas
A seqüência do DNA não se altera
Apenas em poucos casos ocorrem rearranjos
(diversidade do sistema imunológico, por exemplo)
O que torna uma célula diferente da
outra?
1. Processos comuns a todas as células - proteínas em comum
2. Algumas proteínas são encontradas somente em células altamente
especializadas
3. RNAs mensageiros - qualidade e quantidade
4. Há outras diferenças além do RNA
Ex. fatores pós-transcricionais
Níveis de regulação
Três níveis de regulação
- Antes da transcrição
- Após a transcrição
- Mecanismos epigenéticos
Níveis de regulação
DNA
RNA
Proteína
Antes da transcrição
Ativadores
Repressores
Reforçadores
Elementos isolantes
Regiões reguladoras e regiões promotoras
Início da transcrição: ATIVADORES
Forma mais simples
Ativadores:
Atraem, posicionam e
modificam os fatores de
transcrição e a RNA pol II
Ativadores – dois sítios
Ativadores podem modificar a cromatina
Os fatores de transcrição
podem não conseguir acessar
o promotor
Organização em nucleossomos –
acesso através de modificações
na cromatina
HAT e complexos de remodelagem
Cromatina acetilada – ativa
Cromatina desacetilada - inativa
Repressores
Repressão de grandes regiões - heterocromatina
Repressão local : várias maneiras
1. Competição pela ligação ao DNA
2. Mascarando a superfície de ativação
3. Interação direta com fatores de transcrição
4. Recrutamento de complexos de remodelagem
de cromatina
5. Recrutamento de histona-desacetilases
Controle pós-transcricional
Processamento normal do RNA
SPLICING
retirada dos introns, ficam somente os exons
1
2
3
4
RNA mensageiro sem os introns
Processamento normal do RNA
Capeamento
-
Logo após a transcrição
Ligação efetiva de 7-metilguanosina ao primeiro nucleotídeo 5’ do
transcrito de RNA
FUNÇÕES:
. Proteger transcrito do ataque da exonuclease 5’→3’
. Facilitar transporte para citoplasma
. Facilitar encadeamento
. Papel no encaixe da subunidade 40S dos ribossomos no mRNA
-
Poliadenilação
-
Após o término da transcrição – clivagem terminal do RNA
Adição de cerca de 200 resíduos de adenilato (AMP), logo após a
clivagem do RNA
FUNÇÕES:
. Facilitar transporte para o citoplasma
. Estabilizar o RNAm
. Facilitar a tradução
Splicing alternativo
Combinações diferentes de exons – um gene, várias proteínas
Processamento do RNA
Conceito de gene
Sequência de DNA
transcrita como uma
unidade que gera uma
proteína
Splicing
Alternativo
Sequência de DNA
transcrita como uma
unidade que codifica
um grupo de proteínas
semelhantes (isoformas)
Tipos de splicing alternativo
Mecanismos para a criação de células
especializadas
As diferenças dramáticas que existem entre os diferentes tipos
celulares é produzida por diferenças na expressão gênica
Diversidade de genes
Diversidade de genes – genoma
Splicing alternativo – isoformas
Mutações que alteram a proteína formada
Estudos de expressão gênica
Conjunto de genes expressos vai dizer quais
as proteínas expressas que constituem um
tecido ou que caracterizam uma determinada
situação
Importância dos estudos de expressão
gênica
Técnicas para análise da expressão gênica
PCR em tempo real
Microarrays
SAGE
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