DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS DA SAÚDE Universidade Católica Portuguesa | Viseu Instituto de Ciências da Saúde LICENCIATURA UNIDADE CURRICULAR Ciências Biomédicas Biologia Molecular ANO/SEMESTRE ANO LECTIVO 1 º Ano/1.º Semestre 2012/2013 ECTS DA UNIDADE HORAS DE CONTACTO 3,5 14T 24 TP RESPONSÁVEL da UNIDADE Maria José Correia CONTEÚDOS PROGRAMÁTICOS A. DNA a molécula que armazena informação Capítulo I. Estrutura do DNA a. A dupla hélice de DNA b. A proposta de Watson & Crick B. Fluxo da informação do DNA à Proteína Capítulo II. A relação entre genes e proteínas c. O fluxo de Informação genética na célula Capítulo III. Transcrição a. Aspectos gerais da transcrição i. Características gerais das RNA polimerases ii. Reacções de adição de nucleótidos b. O processo da transcrição – aspectos gerais i. Em procariotas ii. Em eucariotas Capítulo IV. Síntese e processamento do RNA ribossomal e de transferência a. Síntese e processamento dos percursores de rRNA b. Síntese e processamento do 5S rRNA c. RNA de transferência Capítulo V. Síntese e processamento do RNA mensageiro. a. Maquinaria celular necessária à transcrição de mRNA b. Intrões c. O processamento do mRNA eucariota d. Implicações evolutivas dos intrões e splicing Capítulo VI. RNAs não codificantes e de interferência a. Micro RNAs e a descoberta de novas formas de regulação Capítulo VII. O código genético a. Propriedades do código genético Capítulo VIII. Descodificando os codões o tRNA em acção. a. Estrutura do tRNA Capítulo IX. Tradução da informação genética. a. Iniciação b. Alongamento c. Termino d. Controlo de qualidade na tradução C. Regulação da expressão genética em eucariotas Capítulo X. O núcleo eucariota e o controlo da expressão genética a. O núcleo eucariota b. Comossomas e cromatina c. Epigenética d. Organização do núcleo Capítulo XI. Contolo a nível da transcrição a. Factores de transcrição na regulação da expressão genética b. A estrutura dos factores de transcrição c. Locais na cadeia de ADN com propriedades reguladoras da transcrição d. Activação da transcrição: Enhancers, promotores e co-activadores e. Repressão da transcrição Capítulo XII. Controlo a nível do processamento Capítulo XIII. Controlo a nível da tradução a. Localização citoplásmioca do mRNA b. Controlo da tradução do mRNA c. Controlo da estabilidade do mRNA Capítulo XIV. Controlo a nível pós-tradução a. Estabilidade das proteínas b. D. Técnicas de Biologia Molecular em Ciências da Saúde Capítulo XV. Técnicas básicas para o estudo de ácidos nucleicos. a. Isolamento b. Separação c. Visualização Capítulo XVI. Biotecnologia aplicada às Ciências da Saúde a. Microarrays aplicados às Ciências da Saúde. OBJECTIVOS DA UNIDADE CURRICULAR E COMPETÊNCIAS A ADQUIRIR Os objectivos gerais desta área disciplinar são fornecer aos alunos as ferramentas necessárias à compreensão dos mecanismos e estruturas celulares envolvidos na expressão genética. Nesta unidade é apresentada ao aluno a forma como as células lêem o genoma e de como se chega do gene à proteína. Concretamente é esperado que os alunos desenvolvam as competências abaixo enumeradas: Descreve a estrutura do DNA e as descobertas que permitiram esse conhecimento. Estabelece a relação entre genes e polipéptidos. Descreve o fluxo de informação através da célula identificando os componentes envolvidos. Indica as diferenças entre transcrição entre procariotas e eucariotas. Descreve os processos pelos quais o rRNA, tRNA e mRNA são processados para as formas maturas. Descreve as propriedades do código genético. Define o papel dos tRNAs na descodificação do código genético. Descreve sucintamente as várias etapas da tradução: carregamento do tRNA, iniciação, alongamneto e terminação. Descreve o controlo da expressão genética em procariotas usando os operões lac e trp como exemplos. Distingue entre os conceitos de controlo da expressão genética positivo e negativo. Reconhece a importância dos factores de transcrição para o controlo da expressão genética nos eucariotas. Descreve as características comuns da estrutura dos factores de transcrição, em especial as zonas ligadoras de DNA. Discute as várias estratégias major e minor usadas em eucariotas para regular a expressão genética. Explica o que se conhece sobre a influência da metilação de DNA na expressão genética eucariota. Discute os vários métodos usados para purificar e visualizar os ácidos nucleicos e como as características destas moléculas que afectam o processo de purificação. BIBLIOGRAFIA PRINCIPAL Karp, Gerald (2010) Cell Biology, 6th Edition, International Student Version 6th edition John Wiley & Sons (Ltd). ISBN 978-0-470-50576-2. Carlos Azevedo; Claudio E. Sunkel Biologia Celular e Molecular (5.ª Edição) Lidel. I.S.B.N 978-972-757-692-0 Harvey, R.A. Ferrier, D.R. Lippincott's Illustrated Reviews: Biochemistry. 5th edition. Wolters Kluwer, Lippincott William & Wilkins. Artigos incluidos na pasta UBA III – BM (pasta da intranet relativa à área disciplinar Biologia Molecular). METODOLOGIA DE ENSINO (AVALIAÇÃO INCLUÍDA) A área disciplinar está organizada em 3 tipos de aulas: teóricas, teórico-práticas e laboratoriais. Nas aulas teóricas são apresentados os conteúdos descritos neste programa, que são posteriormente discutidos em aulas TP em que os alunos têm a oportunidade de esclarecer dúvidas e aprofundar o seu estudo. Durante estas aulas TP será ainda feita a avaliação dos conhecimentos adquiridos. As aulas laboratoriais são a oportunidade de ver aplicados na prática conceitos e técnicas descritos nas aulas teóricas. A avaliação desta área disciplinar será feita por frequência (durante o semestre), por exame (após o término das aulas do semestre) ou por exame de recurso (durante a época designada no fim do ano lectivo). A avaliação nas duas primeiras situações consiste numa componente teórica (com o peso de 60% na classificação final e nota mínima de 9,5 valores) realizada uma única vez (frequência final ou exame final) e numa componente de avaliação contínua em que é avaliada a prestação e trabalho dos alunos ao longo do semestre (com o peso de 40% na classificação final). A componente de avaliação contínua por sua vez, consiste na avaliação obtida nas aulas TP (75%) e nas aulas laboratoriais (25%). A avaliação em exame de recurso é paga e consiste numa prova escrita versando todos os conteúdos leccionados nas aulas teóricas e laboratoriais de Biologia Molecular. Para aprovação a classificação mínima é de 10 valores na prova escrita. Os alunos com classificações da prova escrita entre 8,0 e 9,5 valores podem submeter-se a uma prova oral. No caso de haver realização de prova oral a classificação da prova oral constituirá 30% da classificação final conjugada com a classificação da prova escrita. CALENDARIZAÇÃO DAS ACTIVIDADES PARA 2012-2013 Tabela I – Distribuição dos conteúdos das aulas por semanas lectivas. Teóricas (T), Teórico-Práticas (TP). As aulas laboratoriais estão assinaladas a azul e requerem a utilização de bata. SECÇÕES TEMÁTICAS T (h ) DATA T P (h ) DATA A A n o d u o E u u F u n o n d o Á N u o A... IIIn ntttrrro od du uçççããão oE Essstttrrru utttu urrraaa F Fu un nccciiio on naaalll d do osss Á Áccc... N Nu ucccllleeeiiiccco osss Apresentação e Motivação 0,5 2 Out Capítulo I. Estrutura do DNA 0,5 2 Out Capítulo II. A relação entre genes e proteínas 0,5 2 Out Capítulo III. Transcrição – conceitos gerais 0,5 2 Out Capítulo IV. Síntese e processamento do RNA ribossomal e de transferência 1 11 Out Capítulo V. Síntese e processamento do RNA mensageiro. 1 18 Out Capítulo VI. RNAs não codificantes e de interferência 1 25 Out Capítulo VII. O código genético 0,5 8 Nov Capítulo VIII. Descodificando os codões o tRNA em acção. 0,5 8 Nov 1 15 Nov B B D o g n p o n B... D Do og geeen neee ààà p prrro ottteeeííín naaa Capítulo IX. Tradução da informação genética. 18 Out 25 Out 8 8 Nov 15 Nov 22 Nov C C R g u o d p o g n m u o C... R Reeeg gu ulllaaaçççããão od daaa eeexxxp prrreeessssssããão og geeen nééétttiiicccaaa eeem m eeeu ucccaaarrriiio otttaaasss Capítulo X. O núcleo eucariota e o controlo da expressão genética. 1 22 Nov 29 Nov Capítulo XI. Contolo a nível da transcrição 1 29 Nov 6 Dez Capítulo XII. Controlo a nível do processamento 1 6 Dez Capítulo XIII. Controlo a nível da tradução 1 13 Dez 10 Jan Capítulo XIV. Controlo após a tradução 1 3Jan 17 Jan D D T n d B o o g M o u m C n d S ú d D... T Tééécccn niiicccaaasss d deee B Biiio olllo og giiiaaa M Mo ollleeecccu ulllaaarrr eeem mC Ciiiêêên nccciiiaaasss d daaa S Saaaú úd deee Capítulo XV. Técnicas básicas para o estudo de ácidos 1 10 Jan nucleicos. Capítulo XVI. Biotecnologia Aplicada às Ciências da Saúde 1 17 Jan 8 13 Dez 6 27 Set e 11 Out. 2 Tabela II - Distribuição dos conteúdos das aulas Laboratoriais por semanas lectivas. Estas aulas requerem a utilização de batas. CONTEÚDOS L (h ) DATA 2 27 Set 2 11 Out Introdução às técnicas básicas para o estudo dos ácidos nucleicos. Digestão de DNA genómico com enzimas de restrição. Separação dos fragmentos de DNA em gel de agarose e interpretação dos resultados. Ficha de Avaliação relativa às aulas anteriores.