Localização genética Síntese Processamento Função das moléculas de RNA (tRNA, rRNA, snRNAs e snoRNAs) Localização e função das diferentes moléculas de RNA Organização genética dos genes dos tRNAs (E. coli) • Nos operões para os tRNAs, também há informação para genes estruturais Ex. operão tyrU tRNA tRNA tRNA tRNA EFEF-Tu • Genes para os tRNAs também podem existir no mesmo transcrito de genes para rRNAs ex: operão rrn t1 t2 P1P2 16S rRNA tRNA 23S rRNA 5S rRNA tRNA Notas: - Processamento de tRNAs nas bactérias e eucariotas é diferente - tRNAs eucarióticos possuem intrões, mas splicing é diferente do dos genes nucleares. Processamento da molécula de tRNA No processamento de um precurssor dimérico de duas moléculas de tRNA, intervêm: - endorribonucleases (ex. RNase P) - exorribonucleases (ex. RNase D) - transferase tRNA nucleotidil (transfere trinucleótido CCA) Molécula de tRNA 80 ribonucleótidos Bases Raras (ex.) Inosina 5,6-diidrouridina (DHU) Aminoacilação do tRNA A aminoacilação do tRNA pela aminoacil de tRNA sintetase ocorre entre o grupo carboxilo COOH do aa e o grupo 3’- ou 2’-OH do nucleótido terminal (adenosina) Função da molécula de tRNA tRNAs isoaceitadores diferentes tRNAs com diferentes anticodões, mas que carregam o mesmo aa, logo reconhecidos pela aminoacil tRNA sintetase 61 codões, logo deveriam existir 61 tRNAs diferentes…, mas não é a realidade… Normal codon-anticodon interaction Codon-anticodon pairings allowed by the wobble rules Wobble • Capacidade de um anticodão reconhecer mais do que um codão (mas não necessariamente todos) de um outro aminoácido (aa), devido a um emparelhamento não standard na posição wobble (3ª base do codão). Possibilidade de síntese de proteína com alterações na sequência de aa • Mas, devido ao código genético degenerado, muitas vezes esta flexibilidade não implica que se insira outro aa diferente (ex tRNA (UAU) de Ile (AUA)que emparelha com codão de Met (AUG). • O número de diferentes tRNAs varia de espécie para espécie. Em bactérias existem 30 a 40 tRNAs, em animais e palntas cerca de 50 tRNAs, podendo emparelhar com os 61 diferentes codões. Wobble allows one tRNA to recognize two codons Exemplo de wobble Diferentes tRNAs que servem vários codões para a serina tRNA ANTICODÃO CODÃO tRNA1 3’-AGI-5’ + wobble 5’-UCC-3’ 5’-UCC-3’ tRNA2 3’-AGG-5’ + wobble 5’-UCA-3’ 5’-UCG-3’ tRNA3 3’-UCG-5’ + wobble 5’-AGC-3’ 5’-AGU-3’ RNA ribossomal (rRNA) Constituintes dos ribossomas Organização dos genes Síntese e processamento Composição dos ribossomas em células eucarióticas e procarióticas Proteins and RNA molecules compose the two subunits of a ribosome Organização genética dos genes dos rRNAs, em procariotas Nos operões com informação para os rRNAs também há informação para alguns tRNAs 7 stable RNA operons (rrn) in E. coli Each operon contains genes for: - 23S rRNA (rrl), - 16S rRNA (rrs), - 5SRNA (rrf) and - tRNAs The functional cistron-like RNA sequences are separated from each other by spacer regions and are transcribed as one RNA, which is processed by RNAse III that cleaves at specific sites to produce intermediates of rRNAs and tRNAs rRNA genes organization in eukaryotic cells: tandem repeats transcribed by RNA polymerase I RNA polymerase I Modificação química Processamento nucleolítico Praticamente metade do rRNA precursor é desprezado e degradado no núcleo Modificações dos precurssores de rRNA, pelos guide RNAs (snoRNAs) Isomerização Metilação . Os snoRNAS ligam-se a proteínas formando complexos designados snoRNPs. . As actividades de modificação podem ser realizadas pelas proteínas ou pelos snoRNAS. . Identificaram-se snoRNAs nos intrões de genes que codificam proteínas ribossomais