MANUAL DE PRÁTICAS EM FITOBACTERIOLOGIA

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MANUAL
ANUALDE
DEPP
RÁTICAS
EM
M
RÁTICAS
EM
ITOBACTERIOLOGIA
FFITOBACTERIOLOGIA
Coordenação:
Rosa de Lima Ramos Mariano
Elineide Barbosa de Souza
Universidade Federal Rural de Pernambuco
Recife - Brasil
2016
MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO E DO DESPORTO
UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO
Reitora: Profa. Maria José de Sena
Vice-Reitor: Prof. Marcelo Brito Carneiro Leão
Pró-Reitor de Pesquisa e Pós-Graduação: Profa. Maria Madalena Pessoa Guerra
Coordenador dos Cursos de Pós-Graduação: Prof. Mario de Andrade Lira Junior
Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Fitossanidade: Prof. Sami Jorge
Michereff
© 2016 by Rosa de Lima Ramos Mariano
Direitos de edição reservados aos autores
Capa: Formação de biofilme por Xanthomonas campestris pv. viticola (foto Myrzania de
Lira Guerra)
Criação da Capa: Rosa de Lima Ramos Mariano
Editoração Eletrônica: Nelson Bernardi Lima
PEDIDOS PARA
Rosa Mariano
Universidade Federal Rural de Pernambuco
Av. Dom Manoel de Medeiros, S/N - Dois Irmãos
52171-900 Recife, PE Brasil
e-mail: [email protected]
Ficha Catalográfica: Setor de Processos Técnicos da Biblioteca Central - UFRPE
M291
Manual de práticas em fitobacteriologia / Rosa de Lima Ramos
Mariano, Elineide Barbosa de Souza, coord. – Recife :
EDUFRPE, 2016.
234 p. : il.
ISBN 978-85-7946-257-3
Inclui referências e índice remissivo.
1. Fitobacteriologia 2. Práticas de laboratório 3. Métodos
4. Isolamento 5. Inoculação 6. Identificação 7. Controle
Biológico 8. Promoção de crescimento I. Mariano, Rosa de
Lima Ramos, Coord.. II. Souza, Elineide Barbosa de, coord.
CDD 632
Aos mestres e alunos de Fitobacteriologia
de todos os tempos, nosso reconhecimento e
nossa homenagem
APRESENTAÇÃO
PRESENTAÇÃODADA
EDIÇÃO
3ª 3ª
EDIÇÃO
A 3ª Edição do Manual de Práticas em Fitobacteriologia, que agora
apresentamos, foi totalmente revisada e ampliada com quatro capítulos,
que trazem temas atuais, dentre os quais, Biofilme e Quorum sensing.
O nosso objetivo continua sendo atender alunos de graduação e pósgraduação, técnicos e pesquisadores nas áreas de bactérias fitopatogênicas
e biocontrole de doenças de plantas. Métodos simples e eficientes poderão
ser facilmente executados, seguindo-se os protocolos e esquemas
detalhados, disponibilizados neste Manual.
Esta 3ª edição será traduzida para o espanhol e, portanto, esperamos
que sua utilização seja expandida no Brasil e América Latina.
Nossos agradecimentos sinceros aos autores que escreveram os
capítulos, estendendo-se a todos que utilizam o livro, sugeriram as
modificações, fizeram as atualizações e escreveram os novos capítulos
desta edição.
Agradecemos,
principalmente,
aos
grandes
Mestres
em
Fitobacteriologia, responsáveis pela nossa formação, Dr. Charles Robbs, Dr.
Osamu Kimura, Dr. Reginaldo Romeiro, Dr. States McCarter e Dr. Armando
Takatsu.
Rosa L.R. Mariano
Elineide B. Souza
Coordenadoras
UMÁRIO
SSUMÁRIO
1. Métodos de coloração de bactérias fitopatogênicas
Rosa L.R. Mariano, Sayonara M.P. Assis e Kátia C.S. Felix
2. Testes rápidos de detecção de bactérias fitopatogênicas
Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza e Adriano M.F. Silva
3. Isolamento de bactérias fitopatogênicas
Elineide B. Souza, Rosa L.R. Mariano e Kátia C.S. Felix
4. Preservação de bactérias fitopatogênicas
Elineide B. Souza, Rosa L.R. Mariano, Kátia C.S. Felix, Nelson B.
Lima e Jéssica R. da Silva
5. Quantificação de inóculo de bactérias fitopatogênicas
Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza e Marco A.S. Gama
6. Inoculação de bactérias fitopatogênicas
Sayonara M.P. Assis, Rosa L.R. Mariano e Greecy M.R. Albuquerque
7. Reação de hipersensibilidade em bactérias fitopatogênicas
Rosa L.R. Mariano e Elias I. Silva
8. Testes fisiológicos, nutricionais e bioquímicos para
identificação e caracterização de bactérias fitopatogênicas
Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza, Sayonara M.P. Assis, Andréa
M.A. Gomes e Myrzânia L. Guerra
9. Atividade nucleadora de gelo em bactérias fitopatogênicas
Rosa L.R. Mariano
10. Produtos biológicos, químicos e alternativos para controle de
bactérias fitopatogênicas
Elineide B. Souza, Sayonara M.P. Assis, Andréa M.A. Gomes,
Meridiana A.G. Lima, Ana Rosa Peixoto, Leonardo S. Cavalcanti e
Nelson B. Lima
11. Isolamento de bactérias para testes de antagonismo
Rosa L.R. Mariano, Sami J. Michereff, Elineide B. Souza, Sayonara
M. P. Assis, Andréa M.A. Gomes e Edilaine A. Melo
9
21
25
37
51
57
75
79
129
133
139
12. Antagonismo de bactérias a fitopatógenos
Rosa L.R. Mariano, Andréa M.A. Gomes, Sami J. Michereff,
Sayonara M.P. Assis, Elineide B. Souza e Claudeana S. Conceição
13. Promoção de crescimento de plantas por bactérias
Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza, Sayonara M.P. Assis, Andréa
M.A. Gomes e Greecy M.R. Albuquerque
14. Mecanismos de ação de bactérias antagonistas
Rosa L.R. Mariano, Sayonara M.P. Assis, Elineide B. Souza, Andréa
M.A. Gomes, Jéssica R. Silva e Francisco C.Q. Carvalho
15. Detecção de bacteriófagos
Rosa L.R. Mariano e Myrzânia L. Guerra
16. Técnicas moleculares I – Detecção e identificação de bactérias
fitopatogênicas
Marco A.S. Gama e Vitorina N. Covello
17. Técnicas Moleculares II – Estudos de diversidade de bactérias
fitopatogênicas
Nelson B. Lima, Adriano M.F. Silva e Marco A.S. Gama
18. Formação de biofilme in vitro por bactérias fitopatogênicas
Myrzânia L. Guerra e Elineide B. Souza
19. Quorum sensing em bactérias fitopatogênicas e quorum
quenching como mecanismo de controle
Indira Molo-Alvarado, Rosa L.R. Mariano e Elineide B. Souza
20. Detecção de bactérias fitopatogênicas em sementes
Indira Molo-Alvarado, Rosa L.R. Mariano e Elineide B. Souza
Índice Remissivo
147
155
161
177
183
199
205
211
217
227
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