MANUAL ANUALDE DEPP RÁTICAS EM M RÁTICAS EM ITOBACTERIOLOGIA FFITOBACTERIOLOGIA Coordenação: Rosa de Lima Ramos Mariano Elineide Barbosa de Souza Universidade Federal Rural de Pernambuco Recife - Brasil 2016 MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO E DO DESPORTO UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO Reitora: Profa. Maria José de Sena Vice-Reitor: Prof. Marcelo Brito Carneiro Leão Pró-Reitor de Pesquisa e Pós-Graduação: Profa. Maria Madalena Pessoa Guerra Coordenador dos Cursos de Pós-Graduação: Prof. Mario de Andrade Lira Junior Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Fitossanidade: Prof. Sami Jorge Michereff © 2016 by Rosa de Lima Ramos Mariano Direitos de edição reservados aos autores Capa: Formação de biofilme por Xanthomonas campestris pv. viticola (foto Myrzania de Lira Guerra) Criação da Capa: Rosa de Lima Ramos Mariano Editoração Eletrônica: Nelson Bernardi Lima PEDIDOS PARA Rosa Mariano Universidade Federal Rural de Pernambuco Av. Dom Manoel de Medeiros, S/N - Dois Irmãos 52171-900 Recife, PE Brasil e-mail: [email protected] Ficha Catalográfica: Setor de Processos Técnicos da Biblioteca Central - UFRPE M291 Manual de práticas em fitobacteriologia / Rosa de Lima Ramos Mariano, Elineide Barbosa de Souza, coord. – Recife : EDUFRPE, 2016. 234 p. : il. ISBN 978-85-7946-257-3 Inclui referências e índice remissivo. 1. Fitobacteriologia 2. Práticas de laboratório 3. Métodos 4. Isolamento 5. Inoculação 6. Identificação 7. Controle Biológico 8. Promoção de crescimento I. Mariano, Rosa de Lima Ramos, Coord.. II. Souza, Elineide Barbosa de, coord. CDD 632 Aos mestres e alunos de Fitobacteriologia de todos os tempos, nosso reconhecimento e nossa homenagem APRESENTAÇÃO PRESENTAÇÃODADA EDIÇÃO 3ª 3ª EDIÇÃO A 3ª Edição do Manual de Práticas em Fitobacteriologia, que agora apresentamos, foi totalmente revisada e ampliada com quatro capítulos, que trazem temas atuais, dentre os quais, Biofilme e Quorum sensing. O nosso objetivo continua sendo atender alunos de graduação e pósgraduação, técnicos e pesquisadores nas áreas de bactérias fitopatogênicas e biocontrole de doenças de plantas. Métodos simples e eficientes poderão ser facilmente executados, seguindo-se os protocolos e esquemas detalhados, disponibilizados neste Manual. Esta 3ª edição será traduzida para o espanhol e, portanto, esperamos que sua utilização seja expandida no Brasil e América Latina. Nossos agradecimentos sinceros aos autores que escreveram os capítulos, estendendo-se a todos que utilizam o livro, sugeriram as modificações, fizeram as atualizações e escreveram os novos capítulos desta edição. Agradecemos, principalmente, aos grandes Mestres em Fitobacteriologia, responsáveis pela nossa formação, Dr. Charles Robbs, Dr. Osamu Kimura, Dr. Reginaldo Romeiro, Dr. States McCarter e Dr. Armando Takatsu. Rosa L.R. Mariano Elineide B. Souza Coordenadoras UMÁRIO SSUMÁRIO 1. Métodos de coloração de bactérias fitopatogênicas Rosa L.R. Mariano, Sayonara M.P. Assis e Kátia C.S. Felix 2. Testes rápidos de detecção de bactérias fitopatogênicas Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza e Adriano M.F. Silva 3. Isolamento de bactérias fitopatogênicas Elineide B. Souza, Rosa L.R. Mariano e Kátia C.S. Felix 4. Preservação de bactérias fitopatogênicas Elineide B. Souza, Rosa L.R. Mariano, Kátia C.S. Felix, Nelson B. Lima e Jéssica R. da Silva 5. Quantificação de inóculo de bactérias fitopatogênicas Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza e Marco A.S. Gama 6. Inoculação de bactérias fitopatogênicas Sayonara M.P. Assis, Rosa L.R. Mariano e Greecy M.R. Albuquerque 7. Reação de hipersensibilidade em bactérias fitopatogênicas Rosa L.R. Mariano e Elias I. Silva 8. Testes fisiológicos, nutricionais e bioquímicos para identificação e caracterização de bactérias fitopatogênicas Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza, Sayonara M.P. Assis, Andréa M.A. Gomes e Myrzânia L. Guerra 9. Atividade nucleadora de gelo em bactérias fitopatogênicas Rosa L.R. Mariano 10. Produtos biológicos, químicos e alternativos para controle de bactérias fitopatogênicas Elineide B. Souza, Sayonara M.P. Assis, Andréa M.A. Gomes, Meridiana A.G. Lima, Ana Rosa Peixoto, Leonardo S. Cavalcanti e Nelson B. Lima 11. Isolamento de bactérias para testes de antagonismo Rosa L.R. Mariano, Sami J. Michereff, Elineide B. Souza, Sayonara M. P. Assis, Andréa M.A. Gomes e Edilaine A. Melo 9 21 25 37 51 57 75 79 129 133 139 12. Antagonismo de bactérias a fitopatógenos Rosa L.R. Mariano, Andréa M.A. Gomes, Sami J. Michereff, Sayonara M.P. Assis, Elineide B. Souza e Claudeana S. Conceição 13. Promoção de crescimento de plantas por bactérias Rosa L.R. Mariano, Elineide B. Souza, Sayonara M.P. Assis, Andréa M.A. Gomes e Greecy M.R. Albuquerque 14. Mecanismos de ação de bactérias antagonistas Rosa L.R. Mariano, Sayonara M.P. Assis, Elineide B. Souza, Andréa M.A. Gomes, Jéssica R. Silva e Francisco C.Q. Carvalho 15. Detecção de bacteriófagos Rosa L.R. Mariano e Myrzânia L. Guerra 16. Técnicas moleculares I – Detecção e identificação de bactérias fitopatogênicas Marco A.S. Gama e Vitorina N. Covello 17. Técnicas Moleculares II – Estudos de diversidade de bactérias fitopatogênicas Nelson B. Lima, Adriano M.F. Silva e Marco A.S. Gama 18. Formação de biofilme in vitro por bactérias fitopatogênicas Myrzânia L. Guerra e Elineide B. Souza 19. Quorum sensing em bactérias fitopatogênicas e quorum quenching como mecanismo de controle Indira Molo-Alvarado, Rosa L.R. Mariano e Elineide B. Souza 20. Detecção de bactérias fitopatogênicas em sementes Indira Molo-Alvarado, Rosa L.R. Mariano e Elineide B. Souza Índice Remissivo 147 155 161 177 183 199 205 211 217 227