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50º Congresso Brasileiro de Genética
Resumos do 50º Congresso Brasileiro de Genética • 7 a 10 de setembro de 2004
Costão do Santinho • Florianópolis • Santa Catarina • Brasil
www.sbg.org.br - ISBN 85-89109-04-6
e-mail: [email protected]
palavras-chave: genes reguladores, parênquima externo, embrião
Lacerda, TS; Paiva, GR*
Laboratório de Genes e Desenvolvimento. EMBRAPA Recursos Genéticos e Biotecnologia. Parque Estação Biológica – PqEB – Final
W5 – Asa Norte. Caixa Postal 0.2372 CEP: 70770-900 Brasília,DF - Brasil
Caracterização de genes candidatos à
regulação da transcrição no parênquima
externo dos órgãos de estocagem do
embrião de Arabidopsis thaliana
Programas gênicos distintos podem regular a expressão de genes entre camadas do parênquima embrionário
vegetal. Genes (g) candidatos (c) a reguladores (r) do parênquima (p) externo (e) cotiledonar (c) e hipocotilar
(h) do embrião (e) de Arabidopsis thaliana, gcrpechea, foram selecionados no Regulon, por aplicação de Tranesp
e agrupados em duas classes distintas: classe I (3<x<5; 119 genes) e classe II (5<x<10; 3 genes). Os loci
gcrpechea mapearam nos cromossomos Cr.1 (49 genes ; 40% ); Cr.2 (23 genes; 19%); Cr.3 (20 genes; 16%);
Cr.4 (9 genes; 8%) e Cr.5 (21 genes; 17%), e 80% dos genes eram fatores transcricionais de distintas famílias
gênicas (AP2, B3, BZIP, C3H MYB, WRKY, etc), enquanto os demais, envolvidos em outros processos de
reconhecimento do DNA. Os gcrpechea estavam dispostos como 7 clusters homólogos (14,5%; 5 digênicos; 1
trigênico e 1 hexagênicos) e 42 clusters não-homólogos (85,4%; 29 digênicos; 9 trigênicos; 3 tetragênicos e 1
hexagênico). Monogenes gcrpechea (57 genes) distribuíram-se em 24 clusters, 2 dos quais eram clusters monogênicos
homólogos. Testes para comprovar a predição conseqüente do índice Tranesp foram aplicados aos gcrpechea por
detecção de RNAm via mpss (massively parallel signature sequencing, Arabidopsis MPSS libraries) e via microarray
(TAIR-Microarray Elements) ou por peptideogramas produzidos por espectrometria de massa, e confirmaram
a expressão de alguns dos genes selecionados na siliqua, ou na semente ou no embrião. Análises de bancos
de mutantes demonstraram a existência de mutações em 84 gcrpechea, entre os quais 39 eram monogenes. A
caracterização dos 122 gcrpechea permitiu a seleção de 23 genes como candidatos selecionados pelas variáveis:
índice tranesp, padrão de expressão, perfil de família gênica, característica de cluster, disponibilidade de
mutantes, e, quando disponível, fenótipo de mutante. Análise conjunta por Tranesp / Athamap, permitiram
destes 23 genes identificar 3 genes reguladores transcricionais candidatos a ser epistáticos aos genes gcrpechea.
Tomados em conjunto os gcrpechea e os 3 genes candidatos a reguladores dos mesmos, representam modelos
experimentais para o estudo de vias reguladoras da expressão gênica e do desenvolvimento da camada externa
do parênquima do embrião.
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