P1 – 2 vagas – António Luís
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TEMAS PARA PROJECTO E PESQUISA – Licenciatura em Biologia 2007-2008 P1 – 2 vagas – António Luís A Natureza das/nas Cidades A diversidade faunística em espaço urbano. Avaliação do estado da arte e estudo do caso específico do Pardal-doméstico (Passer domesticus). P2 – 1 vaga – Carlos Fonseca Contribuição para o estudo das aves do Buçaco P3 – 1 vaga – Carlos Fonseca Contribuição para o estudo dos mamíferos do Buçaco P4 – 1 vaga – Carlos Fonseca Estudo de hábitos alimentares de coruja-das-torre P5 – 1 vaga – Carlos Miguez Estudo da variação do número de cromossomas em Nucella lapillus ao longo da costa Portuguesa e a sua possível relação com o hidrodinamismo. Tem sido descrita a ocorrência de uma variação acentuada do número de cromossomas em Nucella lapillus para alguns locais da costa Atlântica a norte de Portugal. Neste trabalho pretende-se estudar a ocorrência deste fenómeno na costa Portuguesa (entre Vila Praia de Âncora e Lagos) e relacioná-lo com diversos factores ambientais. P6 – 1 vaga – Carlos Miguez Estudo da idade e do crescimento do mexilhão Mytilus galloprovincialis ao longo da costa Portuguesa. Pretende-se determinar a idade e a taxa de crescimento de Mytilus galloprovincialis ao longo da costa Portuguesa (entre Vila Praia de Âncora e Faro) e relacionar a sua possível variação com a latitude. Este trabalho consiste na medição dos anéis anuais de crescimento presentes na superfície externa das conchas e nos micro-anéis de crescimento analisados com base na técnica da película de acetato. Será feito um ensaio da aplicação dos resultados ao nível da gestão dos recursos haliêuticos e da monitorização de contaminantes. P7 – 1 vaga - Marina Cunha e Ana Hilário Uma nova espécie da família Ampharetidae – morfologia e reprodução. Uma nova espécie da família Ampharetidae (Annelida: Polychaete: Terebellida) foi recentemente encontrada no vulcão de lama “Captain Arutyunov” (1400 m) no Golfo de Cadiz. Este trabalho irá dedicar-se ao estudo desta espécie, incluído a sua morfologia e aspectos da biologia reproductiva. Serão utilizandos métodos de ilustração científica em câmara clara e métodos histológicos. P8 – 2 vagas – Salomé Almeida Os nanotecnólogos da natureza: à descoberta dos segredos das diatomáceas Diatomáceas são algas unicelulares com frústulas ricamente ornamentadas que desde a invenção do microscópio óptico tem fascinado amadores e biólogos. Mais recentemente, também os nanotecnólogos, tem sido atraídos esperando perceber como são “fabricadas” as estruturas em miniatura actualmente ainda fora do alcance dos cientistas de materiais. P9 - – 1 vagas – Salomé Almeida As diatomáceas na medicina legal As diatomáceas possuem um conjunto de características, (ampla ocorrência geográfica, sensibilidade à qualidade da água, boa preservação das frústulas, fácil detecção, e ocorrência em grandes números, condição essencial para uma boa interpretação estatística dos resultados) que tornam estes organismos eucarióticos fotossintéticos como um importante instrumento na medicina legal. A utilização mais frequente das diatomáceas na medicina legal é no diagnóstico de morte por afogamento. Uma forma de determinar se uma pessoa morreu por afogamento ou se já estava morta antes de entrar/ser atirada na/à água é por análise e comparação das diatomáceas do meio aquático em que foi encontrado o corpo com aquelas que foram encontradas em diversos órgãos (pulmões, rins, medula óssea, etc). Se as amostras forem semelhantes então a pessoa estava viva quando entrou na água, caso contrário já estaria morto e devem procurar-se outras causas de morte. P10 – 4 vagas – Salomé Almeida e António Calado Formas teratológicas em algas de água doce Entre os protistas fotossintéticos com morfologia normalmente regular surgem por vezes indivíduos com aspecto notavelmente alterado. Essas modificações são frequentemente associáveis a condições extremas em alguns parâmetros ambientais. Um exemplo da ocorrência de formas teratológicas é a presença de diatomáceas fortemente deformadas em águas que sofrem a influência de escorrências de antigas minas, ricas em metais pesados. Quais os mecanismos de actuação dos agentes promotores de teratologias, qual o grau de permanência das deformações, qual a viabilidade dos organismos afectados e qual a participação de alterações genéticas no desenvolvimento de deformações são algumas das questões que este tema levanta. P11 – 2 vagas – Salomé Almeida Aplicação da Directiva Quadro da Água em Portugal – aferição de metodologias A implementação da Directiva Quadro da Água na União Europeia obriga à determinação do estado ecológico das águas através do estudo de diversos elementos biológicos, onde se inclui o perifíton, a par com a determinação de parâmetros hidromorfológicos e físico-químicos. Em Portugal é necessário aferir metodologias para uma utilização mais adequada das comunidades de diatomáceas para determinação do estado ecológico das formações aquáticas superficiais. P12 – 2 vagas – Salomé Almeida e Etelvina Figueira Mecanismos bioquímicos de tolerância a metais pesados em protistas fotossintéticos Os metais pesados contaminam o meio ambiente provocando alterações nas comunidades de protistas fotossintéticos, sobrevivendo os mais tolerantes. Esta tolerância é conferida, pelo menos parcialmente, por diversos mecanismos bioquímicos, uns de defesa primária como sejam agentes quelantes extra e intracelulares (mucopolissacarídeos, fitoquelatinas ou ácidos orgânicos) outros de defesa secundária (moléculas e enzimas antioxidantes). O estudo destes mecanismos permite compreender melhor as alterações e adaptações das comunidades sujeitas a este tipo de stresse P13 – 6 vagas – José Eduardo Rebelo Os peixes: biologia e pescas Sob este tema poderão realizar trabalhos sobre: - biologia de espécies comercias, nomeadamente sobre: - idade dos peixes - os hábitos alimentares - biometria das espécies - análise de populações de pescado - estudo estatístico das capturas - os peixes da Ria de Aveiro - ensaios sobre diversidade e abundância P14 – 3 vagas – Etelvina Figueira Análise dos mecanismos de resposta molecular a diferentes tipos de stresses abióticos Enquadramento do trabalho Os sapais encontram-se entre os ecossistemas mais produtivos do mundo, suportando um número elevado de espécies vegetais e animais. Os efeitos adversos da poluição por metais nestes ambientes têm repercussões ao longo da cadeia alimentar de todo o ecossistema. As actividades industriais e agrícolas têm provocado danos ao nível dos estuários, podendo levar a um declínio da vegetação e à erosão das zonas de sapal. Assim, é urgente a biorremediação destes ecossistemas. As espécies normalmente usadas para fitorremediação não conseguem subsistir nas condições adversas das zonas de sapal. Como tal, o potencial de descontaminação destes ecossistemas usando espécies endémicas é fundamental. Objectivos: O trabalho proposto tem como principal objectivo o estudo da contaminação de uma área específica do sapal da Ria de Aveiro, o largo do Laranjo, sujeito a uma elevada contaminação por mercúrio. Irão ser efectuadas saídas de campo para recolha de amostras de plantas e sedimentos. No laboratório proceder-se-á ao processamento dessas mesmas amostras. Serão ainda analisados os mecanismos subjacentes à tolerância das plantas a mercúrio, tais como sequestração por tióis, acidos orgânicos e péptidos. Os protocolos utilizados vão envolver processos cromatográficos como HPLC, exclusão molecular e electroforese capilar, quantificação de actividades enzimáticas e avaliação de danos celulares induzidos por stresse oxidativo. O trabalho também englobará a aquisição e aplicação de conhecimentos de outras técnicas e áreas laboratoriais, nomeadamente culturas microbiológicas e de tecidos vegetais e ainda protocolos de biologia molecular para avaliação de características genéticas e proteicas presumivelmente envolvidas nos mecanismos de sinalização e de tolerância a metais pesados e outros stresses abióticos. P15 – 2 vagas – Maria Marina Cunha Comunidades bentónicas de foraminíferos do canhão de Setúbal (3200 m e 4200 m). O aluno fará uma recolha bibliografica inicial sobre as comunidades bentónicas de canhões, com enfase nos foramíniferos. O trabalho de laboratório involverá a criavagem (> 300 μm), tingimento (Rosa de Benguela) e triagem de sedimentos de duas profundidades do Canhão de Setúbal (3200 m e 4200 m), de 0 a 5 cm no sedimento. A triagem será feita na totalidade para macrofauna (>300 m) e meiofauna (150 – 300 μm) com posterior identificação dos foraminíferos até espécie quando possível. As amostras foram colhidas abordo o navio de investigação Inglês Cjarles Darwin cruzeiro no. 179 em 2006 no canhão de Setúbal e estão conservadas em Formol tamponado com Borax. Este trabalho está inserido dentro do projecto HERMES dentro do work package (WP) 5 que se refere aos canhões. Apenas um aluno de licenciatura trabalhará sob a orientação da Prof. Marina Cunha e da Ana Aranda da Silva (Investigadora de posdoc da Universidade de Aveiro). As amostras disponíveis provém do Cruzeiro CD179 abordo Charles Darwin colhidas em 2006 no canhão de Setúbal: 1) CD 179 56804#6 3260 m Core 2 2) CD179 56837#7 4213 m Core 11 As amostras estão preservadas em Formol tamponado com Borax em garrafas de plástico Nalgene de 500 ml nas seguintes camadas: 0-0.5 cm, 0.5-1 cm, 1-1.5 cm, 1.5-2 cm, 2-3 cm, 3-4 cm e 4-5 cm. P16 – 1 vaga – Fernando Gonçalves e Ruth Pereira Pesquisa de ergosterol e de biomarcadores microbianos (FAME) em amostras de solos P17 – 1 vaga – Fernando Gonçalves e Ruth Pereira Influência da contaminação com metais na decomposição da folhosa pela comunidade microbiana. P18 – 1 vaga – Maria Lourdes Pereira Estudos de regeneração da espermatogénese em ratinhos submetidos a metais pesados: abordagem histológica e histoquímica. P19 – 1 vaga – Maria Lourdes Pereira Estudos de hepatoprotecção em ratinhos com extractos de plantas. Nestes trabalhos serão administrados diversos compostos com potenciais efeitos hepatoprotectores a ratinhos, previamente submetidos a agentes que afectam os hepatócitos, no sentido de estudar possível regeneração dos mesmos. Serão utilizadas técnicas histológicas e bioquímicas. P20 – 1 vaga – Victor Quintino e Ana Rodrigues Estudo da população de Diopatra neapolitana (anelídeo, poliqueta) na Ria de Aveiro: determinação de relações alométricas. Descrição: Caracterizar a estrutura dimensional da população de Diopatra neapolitana de modo a obter relações alométricas e a estimar parâmetros de crescimento. P21 – 1 vaga – Victor Quintino e Ana Rodrigues Estudo da população de Diopatra neapolitana (anelídeo, poliqueta) na Ria de Aveiro: análise da maturação sexual Descrição: Estudo do desenvolvimento dos gâmetas femininos e masculinos na população, ao longo do tempo e determinação dos meses mais importantes para a reprodução desta espécie. P22 – 1 vaga – Victor Quintino e Ana Rodrigues Análise da relação entre o ambiente físico e a distribuição de macroinvertebrados numa região da plataforma continental Portuguesa Descrição: O estudo será desenvolvido numa região da plataforma continental, sujeita à descarga de um efluente orgânico e onde o ambiente abiótico tem variações muito bem definidas. Os objectivos são, por um lado, relacionar o ambiente físico e a fauna existente, e por outro evidenciar gradientes naturais e antropogénicos. O aluno (a) começará o estudo com um cruzeiro para recolha de amostras (2-3 dias) no navio oceanográfico “Noruega” P23 – 1 vaga – Victor Quintino e Ana Rodrigues Padrões de recrutamento de macrofauna bentónica na Ria de Aveiro Descrição: O estudo tem como base amostras já disponíveis e recolhidas na Ria de Aveiro em duas áreas colonizadas por Zostera. Os objectivos são o estudo do efeito da vegetação sobre o recrutamento de macroinvertebrados. As amostras são provenientes de duas áreas, uma no canal de Mira e outra no canal de Ovar em diferentes alturas do ano. P24 – 1 vaga – Victor Quintino e Ana Rodrigues Ecotoxicologia de sedimentos marinhos Descrição: Avaliação da toxicidade associada a sedimentos marinhos em zonas de descarga de efluentes orgânicos, utilizando o anfípode Corophium multisetosum (anfípode) como espécie teste O aluno (a) começará o estudo com um cruzeiro para recolha de amostras biológicas e de sedimento (2-3 dias) no navio oceanográfico “Noruega” P25 – 1 vaga – Henrique Queiroga Fluxo de carbono em sistemas estuarinos: actividade locomotora de gastrópodes herbívoros na presença de microfitobentos. Este tema será desenvolvido no âmbito do projecto BenthicLink, e pretende compreender em que medida a presença de sedimento rico em microfitobentos afecta a actividade endógena e a quantidade de movimento de gastrópodes herbívoros do género Hydrobia. As experiências serão realizadas em microcosmos laboratoriais, com a utilização de equipamento de aquisição e tratamento de imagens electrónicas. P26 – 1 vaga – Henrique Queiroga Ecologia larvar e conectividade de populações do Lagostim da Noruega: reacções comportamentais das larvas a factores ambientais Este tema será desenvolvido no âmbito do projecto LobAssess, e pretende descrever as reacções tácticas e cinéticas das larvas em função da gravidade, luz e pressão hidrostática, de modo a poder prever a sua distribuição em condições naturais. As experiências serão realizadas em microcosmos laboratoriais, com a utilização de equipamento de aquisição e tratamento de imagens electrónicas. P27 – 1 vaga – Henrique Queiroga Plasticidade fenotípica e adaptação em juvenis de caranguejo: influência de pistas químicas dos predadores no crescimento e alometria em Carcinus maenas. Este tema será desenvolvido no âmbito de um projecto de doutoramento, e pretende compreender se a presença de pistas químicas produzidas por adultos da mesma espécie induz modificações nas taxas de crescimento e na morfologia. Estas questões serão abordadas com juvenis cultivados em condições laboratoriais com a utilização de técnicas de morfometria geométrica. P28 – 2 vagas – Henrique Queiroga Mariscagem artesanal e gestão de ecossistemas: avaliação da produção de espécies seleccionadas na Ria de Aveiro e medidas de conservação. Este projecto pretende aplicar técnicas padronizadas de avaliação da produção da mariscagem artesanal em algumas espécies de poliquetas e bivalves da Ria de Aveiro. Os objectivos são: conhecer as variações interanuais da produção, avaliar os impactos na conservação dos recursos e estimar o valor económico da actividade. P29 – 2 vagas – Mário Verde Pereira Cianobactérias: dinâmica de populações P30 – 2 vagas – Mário Verde Pereira Avaliação ecotoxicológica de fármacos P31 – 2 vagas – Mário Verde Pereira Ecologia de microalgas P32 – 2 vagas – Mário Verde Pereira Fitoplâncton e cadeias tróficas P33 – 1 vaga – João Serôdio Ciclo do carbono em estuários: estudo da produção de exopolissacáridos por biofilmes de microalgas bênticas Um dos destinos do carbono fixado pelas comunidades de microalgas em ambientes intertidais estuarinos consiste na produção de exopolissacáridos (EPS). Estes compostos representam uma importante fonte de carbono para outros níveis tróficos e promovem a bio-estabilização de sedimentos. O trabalho proposto consiste no estudo da produção de EPS por biofilmes de microalgas, da sua regulação por factores ambientais, e avaliação da sua variabilidade espaciotemporal num ecossistema estuarino. P34 – 1 vaga – João Serôdio Biodiversidade em habitats estuarinos: identificação e quantificação de cianobactérias em sedimentos intertidais por métodos de detecção remota A elevada produtividade primária dos estuários deve-se, em grande medida, à actividade fotossintética do microfitobentos, comunidades de microalgas bênticas. Estas são caracterizadas por uma elevada biodiversidade, cujo estudo implica tradicionalmente a utilização de técnicas destrutivas. O trabalho centra-se no desenvolvimento de métodos ópticos para a discriminação e quantificação não-destrutivas da biomassa de cianobactérias em sedimentos estuarinos, baseados em espectrorradiometria e em fluorometria de pulso modulado. P35 – 2 vagas – António José Calado Alimentação heterotrófica (fagotrofia, etc.) em dinoflagelados Os dinoflagelados (Dinophyceae) são protistas predominantemente unicelulares com uma diversidade invulgarmente grande, quer em termos de estruturas celulares, quer em termos de habitat, quer ainda em termos de tipos nutricionais. Muitas espécies de dinoflagelados são desprovidas de pigmentos fotossintéticos, sendo, por isso, obrigatoriamente heterotróficas; outras são foto-autotróficas, e algumas combinam os dois modos de nutrição, recebendo a designação de mixotróficas. Entre os dinoflagelados de vida livre (não parasíticos) reconhecemse três mecanismos distintos de ingestão de alimento, que foram descritos com algum pormenor em várias espécies. Algumas espécies de dinoflagelados heterotróficos, representando os diferentes modos de ingestão, são frequentes na região de Aveiro, em água doce ou em meio marinho. Qual a eficiência destes modos nutricionais, que presas são adequadas para permitir o crescimento populacional dos predadores e qual o impacto da predação por dinoflagelados nas populações das presas são algumas das questões que este tema levanta. P36 – 3 vagas – António José Calado Fitoplancton costeiro com especial atenção às espécies nocivas As alterações globais fazem-se sentir na composição das comunidades aquáticas, onde se assiste a modificações na distribuição dos organismos. Algumas das espécies que colonizam novas áreas são causadoras de problemas pelo que importa seguir a evolução das comunidades costeiras. P37 – 2 vagas – António José Calado Estudos em biogeografia de Chrysophyceae, em especial espécies com revestimento silicioso Revisão da situação actual, passados que são uma dúzia de anos desde os estudos de distribuição destes organismos na região centro de Portugal. Os revestimentos siliciosos são estudados fundamentalmente em microscopia electrónica e constituem objectos microscópicos com elevado grau de esteticidade. A utilização na avaliação ecológica de ambientes actuais e passados confere especial interesse a estas estruturas. P38 – 3 vagas – Paulo Silveira e Rosa Pinho A flora do distrito de Aveiro Usando como base o espólio do Herbário da Universidade de Aveiro pretende-se elaborar um catálogo da flora vascular que ocorre neste distrito. Os dados obtidos serão analisados do ponto de vista da diversidade taxonómica, fitogeográfica e de formas biológicas com vista a publicação em revista da especialidade. P39 – 2 vagas – Paulo Silveira Contribuição para o conhecimento da biossistemática do género Calendula L (Compositae). Este projecto tem como objectivo clarificar o estatuto taxonómico dos taxa que integram este género através de estudo biométrico e análise multivariada e estatística dos resultados obtidos. P40 – 2 vagas – Paulo Silveira e Helena Silva Os Pteridófitos de Timor –Leste Com este projecto pretende-se elaborar uma listagem dos Pteridófitos que ocorrem em TimorLeste, que será uma ferramenta importante para a conservação dos recursos deste país. A informação necessária resultará de fontes bibliográficas e espécimes de herbários nacionais e internacionais, incluindo as colecções do herbário da Universidade de Aveiro. P41 – 1 vaga – Paulo Silveira e Helena Silva As Euphorbiáceas de Timor –Leste Com este projecto pretende-se elaborar uma listagem das Euphorbiáceas que ocorrem em Timor-Leste, que será uma ferramenta importante para a conservação e gestão dos recursos deste país. A informação necessária resultará de fontes bibliográficas e espécimes de herbários nacionais e internacionais, incluindo as colecções do herbário da Universidade de Aveiro. P42 – 1 vaga – Paulo Silveira Conclusão da checklist da flora portuguesa Com este projecto pretende-se concluir uma listagem dos nomes científicos das plantas vasculares que ocorrem na flora portuguesa. Para além de a última que existe estar já muito desactualizada pretende-se disponibilizar esta útil ferramenta na Internet facilitando assim muito o trabalho de investigadores e técnicos da área, por exemplo na informatização de herbários e estudos de fitodiversidade e ambiente. P43 – 1 vaga – Cláudia Oliveira / António Correia Plasmid mediated horizontal gene transfer in bacterioneuston: Contributions for the mobilome P44 – 1 vaga – Isabel Henriques / António Correia Bacterioneuston vs. bacterioplankton: simply neighbors or close relatives? P45 – 1 vaga - Isabel Henriques / António Correia Molecular diversity of Aeromonas sp. in an estuarine environment: applicability of culturebased and culture-independent molecular techniques. P46 – 1 vaga – Cristina Sarmento / António Correia Pesquisa de enzimas extracelulares em Botryosphaeria spp. P47 – 1 vaga – Artur Alves / António Correia Clonagem e caracterização de genes de sintetase da quitina em Botryosphaeria spp. P48 – 1 vaga – Artur Alves / António Correia Caracterização de fungos fitopatogénicos do género Phomopsis P49 – 2 vagas – António Correia Empreendedorismo e Microbiologia - novos negócios? P50 – 2 vagas – António Correia Doenças microbianas emergentes - novos perigos? P51 – 2 vagas – António Correia Que há na Internet sobre genomas microbianos? P52 – 2 vagas – António Correia Microbiologia do ar: problemas actuais e métodos de estudo P53 – 1 vaga – Alexandra Moura / António Correia Characterisation of integrons from wastewaters P54 – 1 vaga – Daniela Figueiredo / António Correia Molecular characterization of bacterial diversity in waterbodies from central Portugal P55 – 1 vaga – António Correia Molecular diversity of E. coli: hospital and waters P56 – 2 vagas – António Correia Go ask Alice – o que tinham os cogumelos do País das Maravilhas? P57 – 2 vagas – António Correia A Microbiologia explicada às crianças (e a engenheiros, advogados, etc.) P58 – 2 vagas – António Correia Microbiologia e ciências forenses - o fungo estava no sapato do criminoso? P59 – 3 vagas – Paula Gonçalves Citotoxicidade e modelos para o seu estudo A avaliação da toxicidade de compostos é imprescindível em muitos domínios da actividade industrial. Compostos com interesse práticos são normalmente submetidos a várias modificações para alterar a biodisponibilidade, diminuir a toxicidade e aumentar a eficácia. Neste processo moroso, é necessário avaliar a sua toxicidade em "tubo de ensaio", em modelos celulares e em modelos animais. É oferecida a oportunidade de executar várias técnicas usadas em bioquímica e de realizar ensaios de citotoxicidade com recurso a diversos modelos biológicos. P60 – 1 vaga – Helena Silva Contribuição para a elaboração de um herbário digital de Timor-Leste O objectivo deste projecto/pesquisa será contribuir para a elaboração de uma base de dados, que terá por base fundamental a colecção de plantas de herbário, e a informação de campo recolhida (ecologia, distribuição, fotos dos espécimes no campo, dados etnobotânicos) por uma equipa de investigação do Dep. de Biologia da Universidade de Aveiro em território timorense (20042005). É aconselhável que os candidatos possuam alguns conhecimentos no domínio do tratamento de imagem digital (ex: Photoshop). P61 – 2 vagas – Helena Silva Estudo da acção das tintas antivegetativas com biocidas organometálicos e metálicos em plantas de sapal (Ria de Aveiro) O uso de tributilestanho (TBT) e trifenilestanho (TPT) em tintas antivegetativas criou um grave problema de poluição à escala mundial. Consequentemente, a Organização Marítima Internacional (IMO) baniu a aplicação de tintas antivegetativas com organoestânicos em todo o tipo de embarcações a partir de 2003 e proíbe a sua utilização a partir de 2008. Como resultado, o TBT e o TPT estão actualmente a ser substituídos por outros biocidas, com destaque para os compostos à base de cobre e de zinco. O principal objectivo deste estudo é o de avaliar o risco ecológico associado ao aumento da contaminação ambiental por cobre e zinco, e comparar este risco com o associado à contaminação por organoestânicos. A avaliação dos efeitos potenciais da contaminação por TBT, TPT, cobre e zinco em plantas de sapal será feita através de ensaios toxicológicos laboratoriais. P62 – 1 vaga - Ângela Cunha Eficiência de crescimento, produção primária e respiração do bacterioneuston estuarino (Ria de Aveiro) A micro-camada superficial (1-1000µm) que corresponde à interface entre a coluna de água e a atmosfera. As comunidades bacterianas da microcamada superficial constituem o bacterioneuston que é normalmente caracterizado por apresentar taxas de actividade bacteriana superiores às comunidades da água subjacente (bacterioplâncton). Objectivos: Comparar as taxas de produção primária e respiração na micro-camada superficial e na água subjacente em longo de um gradiente estuarino. Avaliar a contribuição do bacterioneuston para a remineralização da matéria orgânica ou para a sua recondução através das cadeias tróficas através de estimativas da eficiência de crescimento. Descrição do trabalho Colheita de amostras na coluna de água ao longo de um gradiente estuarino na Ria de Aveiro. Cálculo da produção primária e respiração em condições simuladas através da variação da concentração de oxigénio e da incorporação de 14C-bicarbonato. Determinação da actividade heterotrófica através da incorporação e respiração de monómeros marcados (14C). P63 – 1 vaga - Ângela Cunha Aplicação de fotossensibilizadores porfirínicos na inactivação de fungos A terapia fotodinâmica antimicrobiana utiliza substância foto-reactivas (fotossensibilizadores) para destruir microrganismos. Os fotossensibilizadores são tipicamente compostos que quando irradiados com luz de comprimento de onda adequado, na presença de oxigénio molecular, libertam espécies reactivas de oxigénio, designadamente oxigénio singuleto, que interage com a matéria orgânica e destrói células de microrganismos. Esta técnica tem sido aplicada com sucesso na inactivação de vírus, bactérias, protozoários e fungos. Objectivos: O objectivo do trabalho é testar a eficácia de fotossensibilizadores porfirínicos na inactivação de fungos no sentido de avaliar o seu potencial para o controle de agentes fitopatogénicos. Descrição do trabalho Preparação e manutenção de culturas puras de alguns fungos associados a doenças em árvores. Optimização das montagens experimentais e condições de irradiação. Realização de ensaios de irradiação na presença de diferentes tipos e concentrações de fotossensibilizadores e estimativa das taxas de inactivação in vitro. P64 – 1 vaga – Adelaide Almeida Uso de bacteriófagos como antibacterianos em pisciculturas. Objectivo: Avaliar o uso de bacteriófagos para tratamento de infecções bacterianas em peixes. Descrição do trabalho: Recolha de amostras em diferentes pisciculturas. Isolamento das principais bactérias patogénicas e dos fagos respectivos Ensaios de infecção cruzada entre fagos e bactérias. P65 – 1 vaga – Adelaide Almeida Efeito da transformação fotoquímica sobre a actividade bacteriana no sistema estuarino da Ria de Aveiro. Objectivo: Determinar o efeito relativo da transformação fotoquímica da matéria orgânica sobre a actividade do bacterioplâncton. Descrição do trabalho Incubação de amostras irradiadas e não irradiadas no laboratório e colheita de subamostras ao longo do tempo para: Caracterização quantitativa e qualitativa da matéria orgânica Determinação da concentração de TOC e DOC Determinação do número total de bactérias Determinação da actividade heterotrófica: Determinação do número de bactérias viáveis P66 – 1 vaga – Adelaide Almeida Estudo do mecanismo de inactivação viral por composto porfirínicos utilizados no tratamento de águas residuais Objectivos: Determinar o mecanismo de inactivação de bactérias por compostos porfirínicos. Descrição do trabalho: Montagem de microscosmos em condições de irradiação constante a partir de suspensões de fagos. Aplicação de diferentes concentrações de porfirinas livres e imobilizadas em partículas sólidas. Aplicação de diferentes inibidores das reacções tipo I e tipo II. Quantificação da concentração de fagos pela técnica de sementeira por dupla camada nos microcosmos teste e controle (controle irradiado e não irradiado). P67 – 2 vagas - Helena Silva e Artur Alves Efeito de extractos de plantas em fungos patogénicos Existe um interesse crescente no uso de metabolitos secundários de plantas como potenciais agentes antimicrobianos devido à sua especificidade, biodegradabilidade e baixa toxicidade. Alguns trabalhos têm mostrado que diversas espécies de plantas possuem propriedades antibacterianas e antifúngicas. Com este trabalho pretende-se estudar o efeito de extractos de plantas no crescimento de fungos patogénicos. P68 – 2 vagas – Fernando Gonçalves e Ruth Pereira Biologia evolucionista: modificações adaptativas de dafnídeos a drogas ou como criar dáfnias altruístas. P69 – 1 vaga – Amadeu Soares e Mónica Amorim Bio-ensaios de toxicologia terrestre padronizados, tendo em vista a avaliação da análise de risco Este plano de trabalho compreende a abordagem dos temas da Toxicologia. Pretende-se que o aluno ganhe conhecimento relativamente aos principais bio-ensaios de toxicologia terrestre padronizados, tendo em vista a avaliação da análise de risco. Serão: 1) Testadas algumas das principais espécies teste do solo, p.e., Eisenia fetida, Enchytraeus albidus e Folsomia candida. 2) Abordados os principais tipos de testes, p.e., A) agudos (mortalidade); B) crónicos (reprodução); C) evitamento; 3) Testados diferentes compostos tóxicos ou fontes de poluição (p.e. metais pesados, pesticidas, resíduos, solventes). Após a realização dos ensaios, segue-se a análise dos resultados e avaliação de risco associado. P70 – 1 vaga – Amadeu Soares e Mónica Amorim Ecotoxicogenómica – toxicidade e genes em Enchytraeus albidus Este plano de trabalho compreende a abordagem dos temas da toxicologia e da genómica. Pretende-se portanto, que o investigador ganhe conhecimento relativamente a alguns bioensaios de toxicologia. Após exposição dos organismos a substâncias tóxicas ou qualquer tipo de factor de stress, na genómica, serão abordados as principais técnicas/passos no processo de obtenção de genes em Enchytraeus albidus induzidos por stress: 1) Extracção de ARNm; 2) Síntese de ADNc; 3) Selecção e teste de “primers”; 4) Impressão de genes em “microarrays”; 5) Técnicas de obtenção de genes “diferentemente expressos”; 6) Identificação através de “BLAST Homology Search”; 7) Análise estatística dos resultados. P71 – 1 vaga – Amadeu Soares Um olhar sobre a Poluição e a Degradação dos Recursos – elaboração de um manual Enquadramento: As questões relacionadas com a poluição do ambiente e a degradação dos recursos naturais são questões fundamentais, que envolvem a Sociedade como um todo e às quais é necessário dar resposta, no sentido de garantir a sustentabilidade e o equilíbrio dos ecossistemas. A Poluição como fenómeno à escala mundial, com repercussões na qualidade do ambiente, foi reconhecida a partir da década de sessenta (séc. XX). A partir daí, uma nova Ciência – a Ecotoxicologia – foi ganhando contornos, acompanhando a progressiva consciencialização sobre a necessidade de um controlo e gestão adequados da Poluição. Descrição do trabalho: Neste projecto pretende-se compilar uma série de recursos bibliográficos sobre o tema da poluição e degradação dos recursos naturais e sobre a Ciência da Ecotoxicologia. A estruturação dos conteúdos teóricos será também articulada com o trabalho experimental que tem vindo a ser desenvolvido nesta área no Departamento de Biologia, trabalho esse que será recolhido fotograficamente pelo aluno. Com o conhecimento obtido pretende-se elaborar um manual sobre os Fundamentos Básicos da Ecotoxicologia, que disponibilize os conceitos teóricos fundamentais desta Ciência e que os concretize com exemplos concretos de trabalhos experimentais (desenvolvidos por vários grupos do Departamento de Biologia da UA). Este trabalho pretende também desenvolver material didáctico que possa servir de apoio no âmbito do ensino experimental das Ciências. Nota: O aluno deverá ser uma pessoa dinâmica e com bons conhecimentos de inglês. Para mais informações contactar: Raquel Agra (http://www.cesam.ua.pt/raquelagra) P72– 1 vaga – Amadeu Soares Diferenças na tolerância a metais no crustáceo Daphnia longispina – efeitos na resposta a outros factores de stress. Enquadramento: Os ecossistemas aquáticos sujeitos a contaminação química (e.g. metais) exercem pressões evolutivas nos organismos, que podem estar na base da aquisição de tolerância aos próprios contaminantes. Essa capacidade das populações de organismos se adaptarem a um ecossistema em mudança é a base da estabilidade do próprio ecossistema. No entanto, o desenvolvimento de tolerância a contaminantes pode trazer custos para os organismos. A diminuição da performance fisiológica e um aumento de sensibilidade a outros factores de stress são exemplos de custos associados ao desenvolvimento da tolerância a contaminantes. Descrição do trabalho: Este trabalho está integrado na área da Ecotoxicologia e surge no âmbito das mais recentes linhas de investigação, como sejam a capacidade de previsão de efeitos combinados de agentes de stress e a compreensão dos mecanismos de aquisição de tolerância aos contaminantes. O aluno vai tomar contacto com a manutenção de culturas laboratoriais de Daphnia e com a realização de testes de toxicidade laboratoriais (agudos e crónicos). Partindo de 4 clones de Daphnia longispina com diferentes tolerâncias ao cobre, mantidos em laboratório, o aluno vai poder avaliar os efeitos que essas diferenças na resposta ao cobre têm na resposta a outros factores de stress, como por exemplo a temperatura, a radiação ultravioleta ou a presença de predadores. Para mais informações contactar: Raquel Agra (http://www.cesam.ua.pt/raquelagra) P73-1 vaga – Amadeu Soares e Susana Lureiro Estudo e acompanhamento do ciclo de vida do isópode terrestre Porcellionides pruinosus Objectivo: estudar a reprodução e crescimentos do isópodes terrestre (vulgo bicho da conta) Porcellionides pruinosus. Este trabalho inclui: - manutenção de culturas controladas em laboratório, - seguimento de uma coorte em laboratório, - monografia sobre isópodes terrestres. P74- vaga – Amadeu Soares e Inês Domingues Ensaios ecotoxicológicos com Danio rerio Objectivo: estudo do efeito do crómio na sobrevivência e desenvolvimento do peixe zebra (Danio rerio). Este trabalho inclui: - aprendizagem do ciclo de vida do peixe zebra; - contacto com a produção laboratorial de peixes zebra; obtenção de ovos, juvenis e adultos para testes de toxicidade; - manuseamento de sais de crómio; - execução de testes ecotoxicológicos, nomeadamente: . teste de toxicidade em embriões . teste de toxicidade em adultos . teste de crescimento . etc - tratamento estatístico de dados; - redacção de um artigo científico. P75 – 1 vaga – Amadeu Soares e Rosa Pinho Estudo da flora e vegetação do Campus da UA Enquadramento: O Herbário do Departamento de Biologia tem vindo a fazer estudos da flora em espaços verdes, como sejam arruamentos, parques, jardins, etc. (Parque de Serralves - Porto, Parque do Fontelo – Viseu, Parque Infante D. Pedro – Aveiro). Tendo já publicações feitas na sequência desses trabalhos. O estudo da flora ornamental dos jardins botânicos e outros jardins públicos, tem vindo a ter um crescente interesse, dado que estes são espaços relevantes para a investigação botânica, bem como, com interesse didáctico educacional e ambiental. Objectivos: realização de inventários da flora do Campus e recolha de imagens. Herborização da flora arbórea e arbustiva que passará a fazer parte do espólio do Herbário da Universidade de Aveiro. Elaborar uma base de dados sobre a flora e vegetação do Campus e zona envolvente (Marinha da UA e Esteiro de São Pedro). Nessa base constarão: a identificação dos exemplares, o local de origem, a caracterização, as curiosidades e imagens. O trabalho será realizado com recurso as técnicas de SIG. Será ainda sugerida uma listagem de flora a plantar no Campus da Universidade de Aveiro, com um carácter ambiental e didáctico. P76 – 1 vaga – Amadeu Soares e Rosa Pinho Estudo da flora e vegetação para o plano de requalificação da Mata Nacional do Buçaco (MNB) Enquadramento: O Herbário do Departamento de Biologia tem participado no Projecto “Recuperação e Valorização das Infra-estruturas e Ordenamento e Gestão da Mata Nacional do Buçaco. Tal projecto envolve diferentes entidades, entre elas a Universidade de Aveiro. A Mata Nacional do Buçaco é, indubitavelmente, uma das melhores colecções dendrológicas da Europa. Segundo alguns autores trata-se de um arboreto de “renome mundial” (ALLORGE, 1974) ou ainda “incomparável na Europa (DALGADO, 1976). Este arboreto e o Parque da Pena em Sintra constituem os dois mais ricos conjuntos de plantas lenhosas em Portugal. Além disso a mata do Buçaco possui ainda alguns retalhos da vegetação natural tipo climácica, que representa a floresta primitiva, com idênticas aptidões ecológicas, às que existiam nas montanhas do centro de Portugal. Objectivos: o aluno de projecto irá participar nas seguintes tarefas: realização de inventários da flora existente, tendo como suporte outros inventários já produzidos e saídas de campo para a mata. Herborização da flora arbórea e arbustiva que passará a fazer parte do espólio do Herbário da Universidade de Aveiro, constituindo uma referência em relação a flora da Mata do Buçaco Eleição dos exemplares notáveis, que serão geo-referenciados. Escolha dos percursos com interesse botânico. Elaboração de textos sobre os taxa arbóreos e arbustivos. Elaboração dos conteúdos, da componente florística, para criação do site sobre a Mata P77 – 1 vaga – Amadeu Soares e Luís Souto Aplicação de polimorfismos de DNA no estudo de populações
