UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CRUZ Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação Programa de Pós-Graduação em Biologia e Biotecnologia de Microrganismos PROGRAMA DE DISCIPLINA CÓDIGO: DISCIPLINA: PRÉ-REQUISITOS: CARGA HORÁRIA: CRÉDITO: PROFESSORES: ASSINATURAS: EMENTA: OBJETIVOS: METODOLOGIA: AVALIAÇÃO: CONTEÚDO PROGRAMÁTICO: CIB246 GENÉTICA DE MICRORGANISMOS NENHUM TEÓRICA: TEÓRICA: 30 2 PRÁTICA: PRÁTICA: 30 1 TOTAL: TOTAL: 60 3 ANDRÉ RODRIGUES A disciplina de Genética de Micro-organismos (ou Genética Microbiana) abrange os processos de transferência e expressão da informação genética, bem como os mecanismos que geram variabilidade nos microorganismos. Tais mecanismos apresentam profundas implicações no desenvolvimento e evolução de bactérias, fungos e outros micro-organismos. Nesta disciplina, pretende-se abordar os processos moleculares que microorganismos procarióticos e eucarióticos utilizam para garantir a transferência e expressão gênica. Princípios de genômica microbiana e ferramentas de bioinformática também serão abordados na disciplina. Os temas apresentados terão enfoque filogenético de modo a comparar os diversos processos entre os grupos microbianos. Objetivo geral: levar o aluno à compreensão dos processos de transferência e expressão da informação genética em micro-organismos, bem como as aplicações fundamentais que esses conceitos apresentam na prática laboratorial. Objetivos Específicos: 1. Apresentar as principais ferramentas utilizadas em genética microbiana. 2. Discutir aspectos filogenéticos dos processos de transferência e expressão da informação genética. 3. Apresentar as principais ferramentas de bioinformática utilizadas no estudo de genética microbiana. A disciplina compreende aulas teóricas e práticas. 1. Aulas teóricas expositivas versarão sobre os conhecimentos básicos da disciplina. Espera-se criar um ambiente o qual propicie a discussão de conceitos, assim como problemas práticos que os alunos apresentarem. 2. Aulas práticas versarão sobre as ferramentas de bioinformática e filogenia relacionadas à problemas trazidos pelo professor ou pelos próprios alunos. Será cobrada a presença de no mínimo 75%. Além da freqüência, a disciplina inclui três atividades avaliativas (créditos), a saber: 1. Avaliação dissertativa sobre os conteúdos básicos do curso; 2. Discussão de artigos científicos na forma de seminários e; 3. Elaboração de um projeto de pesquisa envolvendo temas escolhidos pelos alunos. Aulas teóricas: 1. DNA, o princípio transformador. Evolução bacteriana. Transformação e conjugação bacteriana. Transdução viral. 2. Estrutura do DNA em micro-organismos. Replicons circulares e estratégias de replicação. 3. O ciclo celular bacteriano. Replicação, segregação cromossômica e plasmidial e divisão celular. Crescimento da célula bacteriana e manutenção da forma celular. 4. Mecanismos de regulação da transcrição gênica em bactérias, fungos e vírus. 5. Tradução e compartimentalização de proteínas em bactérias. Localização sub-celular de proteínas por microscopia de fluorescência 6. Mutações e seus mecanismos. Mutação generalizada e sítio-dirigida. 7. Mecanismo molecular de recombinação e rearranjos genômicos em microrganismos. 8. Recombinação homóloga. Replicação, reparo e recombinação. Replicação e resgate de forquilhas interrompidas. 9. Processos especializados de recombinação. Recombinação sítio-específica em bactérias, fungos e vírus. Manutenção da integridade genômica em bactérias. 10. Transposição, IS e integrons. Resistência a multidrogas 11. Genomas extranucleares. Teoria endossimbionte 12. Genômica: estrutura e organização dos genes. Comparação de genomas. REFERÊNCIAS: Aulas práticas: 1. Alinhamento de sequências de DNA. 2. Identificação de genes desconhecidos: banco de dados do NCBI-GenBank. 3. Algoritmos de reconstrução filogenética: distância, máxima parcimônia, máxima verossimilhança e análise bayesiana. DAY, I. N. M. Molecular Genetic Epidemiology – A Laboratory Perspective. United Kingdom: Southampton University Hospital, 2001. LEWIN, B. Genes VIII. New Jersey: Pearson Prentice Hall, 2004. MADIGAN, M. T.; MARTINKO, J. M.; PARKER, J. Microbiologia de Brock. 10a. ed. Prentice-Hall Inc, 2004. 608 p. MALOY, S. R.; CRONAN, Jr. J. E; FREIFELDER, D. Microbial Genetics. 2nd ed. London: Jones and Bartllet Publishers International, 1994. SNYDER, L.; CHAMPNESS, W. Molecular genetics of bacteria. 1st ed. -Washington, D.C.: American Society for Microbiology,1997. Periódicos para consulta: Annual Review of Microbiology, BMC Microbiology, Cell, Microbiology, Molecular Microbiology, Nature, PNAS, Trends in Genetics, etc.