programa do curso

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CURSO DE CURTA DURAÇÂO
Introdução à bioinformática e genômica aplicada ao estudo de
parasitoses tropicais
Introdução e justificativa
As doenças parasitárias causadas por helmintos e protozoários são as principais causas de
doença humana e de extrema pobreza nos trópicos onde afectam bilhões de pessoas,
resultando em milhões de óbitos e infligindo lesões debilitantes crônicas, tais como cegueira e
desfiguração.
As inúmeras tentativas de desenvolver e aplicar vacinas e fármacos eficazes contra parasitos
tropicais têm sido largamente frustradas por contrariedades econômicas, sociais e
experimentais, tais como dificuldades no seu cultivo in vitro ou in vivo, a sua complexidade
multicelular e/ou do ciclo biológico e a sua notável variabilidade antigênica e genética. No
intuito de responder a estes desafios, vários consórcios internacionais empreenderam esforços
expressivos no decorrer dos últimos anos, para gerar vastas quantidades de dados de
sequência de DNA da maior parte destes parasitos, bem como dos seus vetores. Como
resultado, os genomas dos principais agentes etiológicos das mais graves parasitoses
humanas tropicais, tais como Plasmódio, Leishmania, Tripanossoma, Onchocerca e
Schistossoma, encontram-se já completamente sequenciados ou em fase de conclusão. Esta
informação veio abrir oportunidades sem precedentes para acelerar processos de descoberta
de novos fármacos, desenvolvimento de vacinas, compreensão das cascatas de eventos que
contribuem para patologia e proteção, estudos de biologia de populações e descoberta de biomarcadores. Assim, nesta nova etapa do conhecimento científico, comumente designada de
“era pós-genômica”, a utilização destes excepcionais recursos para o delineamento de novas
estratégias de prevenção e/ou erradicação anti-parasitária apresenta-se como um fator
praticamente incontornável.
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Objetivos
Geral
Proporcionar aos discentes os conhecimentos básicos teóricos e práticos para a manipulação
das bases de dados dos genomas das principais parasitoses humanas tropicais com vista ao
delineamento de investigação baseada em hipóteses. Fornecer conceitos genéticos,
genômicos e moleculares associados ao estudo sobre o ciclo, diagnóstico, tratamento e
epidemiologia de parasitoses tropicais, usando um modelo experimental de malária.
Específicos
No final do curso os discentes deverão ter adquirido as seguintes competências:
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Conhecimento sobre o acesso a bases de dados de genomas de parasitos e vetores
tropicais e a sua manipulação in silico.
Manipulação in silico de sequências de DNA e de proteínas, incluindo ferramentas de
alinhamento, variação alélica e detecção de mutações.
Manipulação in silico de sequencias genômicas, incluindo procuras BLAST e
interpretação e manuseamento de mapas genômicos.
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Conhecimento e aplicação dos conceitos fundamentais de mapeamento genético in
silico usando dados de Linkage e sintenia genética, para identificação de biomarcadores envolvidos em processos de patogênese, imunologia e resistência a
fármacos.
Aquisição de conceitos gerais teóricos sobre genética de populações de parasitos e
vetores e respectivas técnicas computacionais de análise.
Conhecimento e aplicação de ferramentas bioinformáticas para inferir relações
filogenéticas e evolutivas.
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Conteúdo Programático
Bases de dados de genomas de vetores e parasitos tropicais, alinhamento de sequências,
detecção de mutações e análise de restrição, desenho de oligonucleotídeos in silico e
estratégias de sequenciamento de DNA, predição de estruturas proteicas, linkage genética,
mapeamento genético, sintenia genética, filogenia e evolução.
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Destinatários
O curso será direcionado a estudantes e/ou profissionais na área das Ciências da Saúde
humana e animal que pretendam desenvolver trabalhos na área da genética e parasitologia
molecular.
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Coordenador
Pedro Cravo
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Docentes
Prof Dr. Pedro Cravo (IPTSP/ Universidade Federal de Goiás/ Goiânia, Brasil)
Prof Dr. João Pinto (Centro de Malária e Doenças Tropicais/Instituto de Higiene e Medicina
Tropical/Universidade Nova de Lisboa, Lisboa, Portugal)
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Pré-requisitos
Os candidatos deverão preferencialmente já possuir alguns conhecimentos básicos sobre
genética, parasitologia e biologia molecular.
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Vagas
16
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Critério de selecção
Os candidatos serão seleccionados com base na avaliação do CV Lattes/CNPq e carta
expondo as razões pelas quais o curso é relevante para a sua formação e/ou carreira.
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Duração do curso
40 horas / 5 dias
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Horário
9.00 h – 17.00h
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Métodos de ensino/aprendizagem
O curso consistirá de uma a duas aulas diárias de 45 minutos cada, sobre os diferentes
conceitos e métodos a utilizar, seguidas de seis a sete horas de trabalho prático.
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Método de avaliação
A avaliação consistirá na análise e resolução de um exercício prático e um teste teórico de 20
questões de escolha múltipla. Serão aprovados os estudantes que obtiverem uma média final
igual ou superior a 50%.
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Língua de ensino
Português e Inglês (publicações e material de estudo)
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Assiduidade
Presença obrigatória às aulas teóricas e práticas.
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Tipo(s) de Diploma(s)
Certificado
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Candidaturas
Cada candidato deverá submeter o seu CV Lattes/CNPq e carta de motivação expondo as
razões pelas quais o curso é relevante para a sua carreira, para [email protected]
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Suporte bibliográfico
Livros:
Dombrowski SM and Maglott D. Using the Map Viewer to Explore Genomes. in The NCBI Handbook. 2003. Disponível
em: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Books
Gruber A, Durham AM, Huynh C, del Portillo HA. Bioinformatics in tropical disease research: a practical and case-study
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Marr JJ, Timothy WN, Komuniecki R. Molecular Medical Parasitology. Google Books. 2003. Disponível em:
http://books.google.pt/books?id=KjSCOT_cUXQC&printsec=frontcover#PPP1,M1
Artigos:
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