LICENCIATURA EM MEDICINA PROGRAMA DA DISCIPLINA DE MICROBIOLOGIA Ano lectivo de 2006 / 2007 OBJECTIVOS PEDAGÓGICOS Compreender os fundamentos dos mecanismos de patogenicidade e virulência microbiana e o seu envolvimento em Patologia Humana. Compreender os fundamentos das técnicas/metodologias diagnósticas em Microbiologia Saber formular correctamente os pedidos de exames microbiológicos. Saber interpretar criticamente os resultados fornecidos pelo Laboratório de Microbiologia. ÂMBITO DO CURSO 1. BACTERIOLOGIA Morfologia e ultrastrutura bacterianas. Crescimento e morte bacterianas. Metabolismo e genética bacterianas. Mecanismos de patogenicidade bacteriana e defesas do hospedeiro. Estudo dos vários géneros bacterianos com interesse em Patologia Humana. 2. MICOLOGIA Morfologia, reprodução, cultura e taxinomia dos fungos. Estudo dos principais fungos patogénicos para o Homem. 3. PARASITOLOGIA Morfologia, ciclo de vida e acções patogénicas dos principais protozoários e metazoários parasitas do Homem. 4. VIROLOGIA Características físico-químicas e estudo biológico dos vírus. Estudo dos principais vírus patogénicos para o Homem. 1 PLANO DE ESTUDOS De acordo com o tipo de matéria a ensinar haverá aulas teóricas (T) e aulas práticas (P). As aulas T, em número de duas por semana, terão a duração de 60 minutos e serão dirigidas à totalidade dos alunos. Em função do tema abordado, assumirão frequentemente características de seminário. As aulas P, em número de uma por semana, terão a duração de 120 minutos e serão dirigidas a um grupo de alunos orientados por um docente e têm como finalidade familiarizar os alunos com os métodos e técnicas diagnósticas da Microbiologia Médica. Frequentemente, nas aulas práticas serão discutidos assuntos que, dado o seu carácter teórico-prático, não serão abordados nas aulas T. SUMÁRIOS DE AULAS TEÓRICAS T1 Introdução ao estudo da Microbiologia. Âmbito e programa da disciplina. Aspectos históricos; importância actual. Classificação dos seres vivos. Bactérias, fungos, parasitas e vírus. Bacteriologia T2 T3 T4 T5 T6 T7 T8 T9 T10 T11 T12 T13 T14 T15 Anatomia bacteriana: Aspectos ultrastruturais e bioquímicos dos vários componentes da célula bacteriana. Cápsula, camada mucóide ou glicocálice. Parede celular: mucopeptídeo e componentes especiais nas bactérias Gram positivo e Gram negativo. Degradação da parede celular: protoplastos, esferoplastos e formas L. Membrana citoplasmática: ultrastrutura e composição bioquímica. Compartimento intracelular. Flagelos. Fímbrias. Esporo bacteriano. Metabolismo energético e assimilação bacteriana. Análise cinética do crescimento e morte dos microrganismos. Genética bacteriana. Material genético bacteriano: estrutura e replicação. Alterações do genoma. Mutação. Recombinação. Transformação, transdução, conjugação. Transferência de plasmídeos e transposição. Engenharia genética. Género Staphylococcus. Microrganismos relacionados. Género Streptococcus. Género Enterococcus. Géneros Corynebacterium, Bacillus, Listeria, Erysipelothrix. Género Gardnerella. Família Neisseriaceae. Géneros Neisseria, Eikenella, Kingella. Género Bordetella. Família Enterobacteriaceae. Mecanismos de patogenicidade. Aspectos mais relevantes em patologia humana. Principais Géneros. Escherichia. Shigella. Salmonella. Klebsiella. Proteus. Morganella. Yersinia. Enterobacter. Citrobacter. Serratia. Bacilos Gram negativos não enterobacteriaceas. Pseudomonadaceae. Pseudomonas e Acinetobacter. Género Moraxella. Género Vibrio. Género Aeromonas. Género Campylobacter. Género Helicobacter. Género Brucella. Género Francisella. Familia Pasteurellaceae: Géneros Haemophilus, Actinobacillus, Pasteurella. Bactérias anaeróbias. Aspectos gerais das infecções por bactérias anaeróbias. Diagnóstico laboratorial das infecções por bactérias anaeróbias. Principais bactérias anaeróbias Gram negativo e Gram positivo. Género Mycobacterium. Género Nocardia. Género Actinomyces. Família Legionellaceae. 2 Género Treponema. Género Borrelia. Género Leptospira. T16 Géneros Rickettsia e Orientia. Géneros Ehrlichia, Anaplasma, Coxiella. T17 Molicutes. Géneros Mycoplasma, Ureaplasma. Família Chlamydiaceae: Géneros Chlamydia e Chlamydophila. T18 Interacção parasita-hospedeiro. Populações microbianas autóctones do organismo humano. Mecanismos de patogenicidade. Virulência microbiana. T19 Interacção parasita-hospedeiro. Defesas específicas e inespecíficas. Mecanismos de defesa humoral e celular. Vacinas antimicrobianas. T20 Métodos de esterilização e desinfecção. T21 Infecção relacionada com os cuidados de saúde. Micologia T22 Introdução à Micologia. Estrutura, metabolismo, crescimento e mecanismos de reprodução dos fungos. Mecanismos de patogenicidade. Classificação das micoses. T23 Agentes de micoses superficiais e cutâneas. Ptiríase (tinea) versicolor. Dermatofitoses. T24 Agentes de micoses subcutâneas. T25 Agentes de micoses sistémicas. Histoplasmose, blastomicose, coccidioidomicose. Criptococose. T26 Agentes de micoses sistémicas. Candidose. Aspergilose. Pneumocistose. T27 Fungos emergentes. Micotoxicoses. Parasitologia T28 T29 T30 T31 T32 T33 T34 Introdução geral à Parasitologia. Taxinomia e nomenclatura dos parasitas. Protozoários patogénicos para o Homem. Protozoários do tubo digestivo: Entamoeba histolytica. Entamoeba coli. Balantidium coli. Giardia lamblia. Trichomonas hominis. Protozoários uro-genitais: Trichomonas vaginalis. Protozoários do sangue e tecidos: Tripanossoma. Leishmania. Protozoários do sangue e tecidos: Plasmodium. Babesia. Outros Protozoários: Toxoplasma gondii. Isospora belli. Criptosporidium. Microsporidia. Metazoários patogénicos para o Homem. Helmintas e helmintíases. Filo Platelmintas. Classe Trematodos. Família Fasciolidae. Família Schistosomatidae. Classe Cestodos. Famílias Taenidae, Hymenolepididae, Dilepididae, Diphyllobothriidae. Filo Nematelmintas Nematelmintas intestinais: Ascaris lumbricoides .Enterobius vermicularis. Trichuris trichiura. Ancylostoma duodenale. Necator americanus. Strongyloides stercoralis. Outros Nematelmintas: Trichinella spiralis. Filarias. Dracunculus medinensis. Manifestações parasitárias "anómalas". Larva migrans. Ectoparasitoses: escabiose, pediculoses. Virologia T35 Introdução. Propriedades gerais dos vírus. Classificação dos vírus. Diagnóstico laboratorial das viroses. T36 Principais vírus DNA. T37 Principais vírus RNA. T38 Principais vírus RNA. T39 Retrovírus. Doença humana devida a priões. 3 Temas de integração T40 Microbiologia oral. Regulação do ecossistema oral. Patologia microbiana oral. T41 Antimicrobianos. Alvos e mecanismos de resistência. T42 Microbiologia da água, ar e meio ambiente. Segurança alimentar. T43 Exposição ocupacional a agentes microbianos. Riscos infecciosos decorrentes. T44 Diagnóstico microbiológico laboratorial e correlação clínica. SUMÁRIOS DE AULAS PRÁTICAS P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12 P13 P14 P15 P16 P17 Introdução à prática laboratorial em Microbiologia. Normas de segurança laboratorial. Normas genéricas sobre a colheita, transporte, processamento inicial e armazenamento de amostras biológicas. Exame directo de produtos biológicos. Diferentes processos e técnicas de microscopia. Morfologia dos microrganismos ao microscópio óptico. Exames a fresco e após coloração: coloração Gram, coloração Ziehl-Neelsen, outras colorações Cultura de microrganismos – necessidades nutritivas. Meios de cultura: composição, preparação, armazenamento, utilização. Técnicas de sementeira. Métodos de identificação e caracterização: principais provas bioquímicas; sistemas automatizados. Outros métodos de identificação e caracterização de isolados: métodos imunológicos e de biologia molecular. Provas de susceptibilidade aos antimicrobianos. Diferentes metodologias. Outros métodos de diagnóstico directo: detecção de toxinas; pesquisa de antigénios; biologia molecular. Diagnóstico indirecto: vantagens e dificuldades. Cocos Gram positivo: Micrococacceae. Streptococcaceae. Cocos e cocobacilos Gram negativo. Neisseriacceae. Haemophilus. Bacilos Gram negativo. Bacilos álcool-ácido resistentes. Género Mycobacterium. Diagnóstico microbiológico de infecções respiratórias. Diagnóstico microbiológico em produtos amicrobianos – sangue, LCR e outros líquidos orgânicos. Diagnóstico microbiológico de infecções do tracto urinário. Diagnóstico microbiológico de infecções do tracto genital (Infecções Sexualmente Transmissíveis). Diagnóstico microbiológico de infecções do tracto intestinal. Diagnóstico micológico. Colheita de produtos biológicos; armazenamento e transporte. Processamento de amostras. Exame directo: observação macroscópica e microscópica. Exame cultural. Caracterização macroscópica e microscópica. Identificação e tipagem de isolados. Diagnóstico micológico: fungos tipo levedura. Candida, Cryptococcus. Outros. Diagnóstico micológico: fungos filamentosos. Dermatófitos. Aspergillus, Fusarium, Acremonium. Outros. Exame parasitológico. Colheita de produtos biológicos; armazenamento e transporte. Informação sobre técnicas e metodologias a utilizar nos diferentes produtos biológicos. Exame directo. Outros métodos diagnósticos em parasitologia: pesquisa de antigénios e de anticorpos. Papel dos métodos de biologia molecular. Exame parasitológico de fezes: exame a fresco, com e sem coloração; técnicas de concentração. Exame parasitológico de urina e exsudados: pesquisa de Protozoários e Metazoários. Exame parasitológico de fezes: pesquisa de Protozoários. 4 P18 Exame parasitológico de fezes: pesquisa de Metazoários. P19 Exame parasitológico de sangue e tecidos: pesquisa de Protozoários e de Metazoários. P20 Diagnóstico laboratorial em Virologia. Normas de colheita, transporte e armazenamento de amostras biológicas. Principais metodologias diagnósticas. Exame cultural; shell-vial. Pesquisa de antigénios e de anticorpos. Papel dos métodos de biologia molecular. P21 Análise e discussão de publicações científicas. P22 Formulação de pedidos de exames microbiológicos. Interpretação e discussão de resultados de exames microbiológicos. P23 Segurança laboratorial em Microbiologia. P24 Gestão total de qualidade no laboratório de Microbiologia Clínica. BIBLIOGRAFIA Como textos de estudo de base sugerem-se os seguintes livros: Medical Microbiology, 5ª Ed. Murray, Rosenthal,Kobayashi & Pfaller Mosby, 2005 Medical Microbiology, 23ª Ed. Jawetz, Melnick & Adelberg's Brooks, Butel & Morse Appleton & Lange, 2004 Microbiologia, I II e III Volumes Coordenação Wanda Ferreira e J.C.F.Sousa - Lidel, 1998, 2000, 2002 Microbiology, 5ª Ed. Prescott, Harley & Klein McGraw-Hill, 2002 Diagnostic Microbiology, 11ª Ed. Bailey & Scotts Forbes, Sahm. & Weissfeld, Mosby, 2002 FREQUÊNCIA A obtenção de frequência na disciplina está condicionada à presença do aluno em 2/3 do total de aulas práticas. 5 A frequência obtida dispensa o aluno que tenha transitado de ano sem aprovação em Microbiologia da obrigatoriedade de frequentar as aulas práticas, nos dois anos lectivos imediatamente seguidos àquele em que a obteve. No entanto estes alunos poderão frequentar as aulas práticas mas para isso terão de fazer o pedido por escrito, comprometendo-se à sua frequência. Os alunos que não tenham transitado de ano perdem a frequência, isto é, terão novamente de frequentar as aulas práticas. AVALIAÇÃO De acordo com a legislação em vigor, os alunos poderão optar pela avaliação segundo uma opção A (avaliação por exames intercalares) e uma opção B (avaliação por exame final). A opção A é constituída por duas provas escritas (EE1) e (EE2). O aluno terá de obter uma classificação mínima igual ou superior a 8.50 valores (escala de 0 a 20) em qualquer das provas escritas (EE1, EE2) para poder obter aprovação. A opção B é constituída por uma única prova escrita (EE3). Qualquer das provas escritas EE1, EE2 e EE3 serão constituídas por frases que deverão ser assinaladas como V (verdadeira) ou F (falsa) bem como por questões que envolvam interpretação e aplicação de conhecimentos. Na opção A a classificação final resulta da média aritmética da classificação obtida nas duas provas escritas. Na opção B a classificação final será a obtida na prova escrita (EE3). O exame da época de recurso (EE4) será feito em moldes idênticos aos descritos para a opção B. ENCARREGADO DA REGÊNCIA Doutor Acácio Gonçalves Rodrigues Professor Associado 6