Aula 2 - UFRGS

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Laboratório: ICBS- sala 315
(aulas, métodos, artigos, referências, material didático)
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Prof. Paulo Roehe
Taxonomia
• Visa classificar em grupos de acordo com
propriedades físicas e químicas comuns
• Vírus no mesmo grupo frequentemente tem
propriedades biológicas semelhantes:
– Replicação
– Doença não! (cuidado!)
– Transmissão
Classificação definida pelo:
Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus
(ICTV)
ICTVdB - The Universal Virus Database
(acesso fácil na Internet)
International Committee on
Taxonomy of Viruses
Classificação viral
Estrutura (morfologia):





Forma
Tamanho
Simetria
Envelope
Estrutura do genoma
Propriedades físicas :
 Sensibilidade a agentes físicos e químicos
Relações antigênicas
Propriedades biológicas




Estratégias de replicação
Gama de hospedeiros
Modo de transmissão
Patogenicidade
Taxonomia
Ordem: ... virales
Família ... viridae
Subfamília ... virinae
Espécie/Gênero: ... virus
Ordens
Seis ordens estabelecidas até o presente (ICTV):
Caudovirales bacteriófagos com cauda
Herpesvirales vírus herpes de eucariotos
Mononegavirales RNA não segmentado polaridade negativa - plantas e animais .
Nidovirales RNA polaridade positiva de vertebrados.
Picornavirales pequenos vírus RNA que infectam plantas, insetos e animais.
Tymovirales RNA de fita simples; infectam plantas.
Vírus com genoma RNA de fita simples
não segmentados, polaridade positiva:
Arteriviridae
Astroviridae
Caliciviridae
Coronaviridae
Flaviviridae
Hepeviridae
Picornaviridae
Togaviridae
Grupo IV: RNA (+) fs
Ordem: Nidovirales
Família: ARTERIVIRIDAE
Vírus da arterite equina
Vírus da PRRS
Vírus elevador da
lactato dehidrogenase
Astrovírus
• Família Astroviridae
• 28-35 nm, aparência de estrêla com 5 - 6 pontas
• RNA fs+ ~7 kb, poli-A em 3’ , sem cap em 5’
• 3 ORFs (overlap 70 nt entre ORF1a (protease) e ORF1b (RdRP)
• Dois gêneros:
» Mamastrovirus: gatos, suinos, ovelhas, etc
» Aviastrovirus: aves
Família ASTROVIRIDAE
Gênero: Astrovírus
- RNA fs, nús 20-30 nm
- encontrados em fezes
- associados a diarréias
Família Caliciviridae
•
•
•
•
•
RNA fita simples, nús, polaridade positiva
Gêneros:
Sapovírus
Norovírus
São as mais importantes causas de gastroenterite
viral em humanos.
• Geralmente causam gastroenterites leves
em animais jovens de várias espécies.
Ordem Nidovirales
Família Coronaviridae
- Pleomórficos, envelopados
- peplômeros espaçados
- RNA fs positiva (+)
Gêneros: Coronavírus; Torovírus
Coronavírus humano (resfriados)
Bronquite Infecciosa das Aves
Peritonite Infecciosa dos felinos
Bronquite infecciosa das galinhas
FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE
- Flavi = amarelo
- globulares (50 nm)
- RNA fs positiva
- nucleocapsídeo icosaédrico
- envelopados
-Gêneros:
Flavivírus Febre Amarela, Dengue 1,2,3,4, Zika
Pestivírus Peste Suína
Clássica,
BVD, BDO
Hepacivirus: Hepatite C (!!!)
Vírus Zika
Hepeviridae
•
•
•
•
Gênero Hepevírus=> Vírus da hepatite E
- RNA, não envelopado, fs, +, 7200 nt,
- Com cap, poliadenilado
Genoma: 5´ UTR- três ORFs - 3´UTR
Família Picornaviridae
- Pico = pequeno
- simetria icosaédrica (20-30 nm)
- RNA (+) fs, não envelopados
- Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A)
Enterovírus (Polio, Coxsackie, Entero)
Rinovírus (resfriados)
Aftovírus (Febre Aftosa)
-
Vacina Sabin
Vírus da Febre Aftosa
Vírus do vale Seneca
(Senecavírus)
- Doença emergente em suínos !!!
Família Togaviridae
- Grupo IV : RNA fs (+)
- envelopados
- pleomórficos (70 nm)
- RNA fs positiva
-Gêneros: Alfavirus (n= 27): infectam várias espécies
- Causam diversas arboviroses:
- Ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana,
- Ex: Chikungunya
Rubivirus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!)
Vírus com genoma RNA de fita simples
não segmentado, com polaridade negativa
Filoviridae
Paramixoviridae
Rhabdoviridae
Família Filoviridae
- filamentosos (80-14 000 nm)
- envelopados
- RNA fs negativa
Marburg
Ebola
Ebola
Família Paramyxoviridae
Duas sub-famílias:
Paramyxovirinae:
Respirovirus: Parainfluenza PI-1, PI-3,
Rubulavirus: PI-2,Cachumba
Morbillivirus: Cinomose,
Sarampo,
Morbilivírus das focas
Pneumovirinae: Pneumovirus: HRSV, BRSV,
Metapneumovirus humano
Metapneumovírus aviário
Henipavirus: Hendra, Nipah
Cinomose
Rinotraqueíte dos perús
Família Rhabdoviridae
• forma de bala
• Simetria helicoidal
• RNA fs negativa
Gêneros:
Lyssavirus:
Raiva, Lagos Bat, Mokola,
Obodhiang, Kotonkan
Vesiculovírus: Estomatite Vesicular
Efemerovirus:
Vírus com genoma RNA de fita simples,
segmentado, polaridade negativa
(Baltimore Grupo V)
Arenaviridae
Bornaviridae
Bunyaviridae
Orthomyxoviridae
Família: Arenaviridae
- Pleomórficos (globulares) 50-300 nm
- Envelopados
- Duas fitas simples de RNA (L e S)
- Contem ribossomos
- Usualmente são vírus latentes de roedores
Gênero Arenavirus
- Coriomeningite linfocítica
- Febre Lassa
- Febres hemorrágicas:
Argentina e Boliviana
LCMV-Lassa virus (Old World) complex:
Gbagroube virus
Ippy virus
Kodoko virus
Lassa virus
Lujo virus
Luna virus
Lunk virus
Lymphocytic choriomeningitis virus
Merino Walk virus
Menekre virus
Mobala virus
Mopeia virus
Tacaribe virus (New World) complex:
Amapari virus
Chapare virus
Flexal virus
Guanarito virus
Junin virus
Latino virus
Machupo virus
Oliveros virus
Paraná virus
Pichinde virus
Pirital virus
Sabiá virus
Tacaribe virus
Tamiami virus
Whitewater Arroyo virus
Arenavírus: genoma de RNA segmentado, polaridade negativa (mas ambisenso!)
Os dois segmentos são denominados “S” (Small) e “L” (Large), Codificam 4 proteínas em
sentido ambisenso, muito particular:
Duas fitas de RNA sentido “ambíguo”, ou seja, parte do RNA codifica uma proteína (2),
outra parte gera uma cópia de sentido positivo (mRNA) para produzir proteína viral.
Família: Bunyaviridae
Ordem: Mononegavirales
- Globulares (100nm)
- Envelopados
- Três segmentos de RNA de fita simples,
polaridade negativa
- Quatro gêneros:
Bunyavirus (18 grupos
antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não
agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba,
Guaroa e muitos outros.
Phlebovirus (8 grupos antigênicos, transmitidos por
Phlebotomum).
Nairovirus
(6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus
transmitidos por carrapatos).
Hantavirus
(pelo menos 6 vírus,
não-arbo,
transmitidos por roedores)
Orthomyxoviridae
- myxo = muco
- pleomórficos
- RNA fs (-)
- nucleocapsídeo helicoidal,
segmentado (C=7; A & B= 8)
- envelopados
- Gênero: Influenza A,B,C
> importante: A
Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado
(Baltimore grupo III)
Birnaviridae
Reoviridae
Família Birnaviridae
- sem envelope, icosaédricos
- RNA bisegmentado
Gêneros: Aquabirnavirus; type species: Infectious pancreatic necrosis virus
Avibirnavirus; type species: Infectious bursal disease virus
Blosnavirus; type species: Blotched snakehead virus
Entomobirnavirus; type species: Drosophila X virus
Família Reoviridae
- dois capsídeos com
simetria icosaédrica (20-30 nm)
- RNA fita dupla
- não envelopados
- Gêneros:
Orthoreovírus
Orbivírus
Rotavírus
Rotavirus
Reoviridae: duas subfamílias:
Sedoreovirinae: contém seis gêneros:
Cardoreovirus
Mimoreovirus
Orbivirus
Phytoreovirus
Rotavirus
Seadornavirus
Spinareovirinae: contém nove gêneros:
Aquareovirus
Coltivirus
Cypovirus
Dinovernavirus
Fijivirus
Idnoreovirus
Mycoreovirus
Orthoreovirus
Oryzavirus
Outro gênero não classificado:
Crabreovirus[9]
Referência sobre reovírus e terapia anti-cancer:
Gene Therapy of Cancer
Methods in Molecular Biology™ Volume 542, 2009, pp 607-634
Oncolytic Viral Therapy Using Reovirus
Chandini Thirukkumaran & Don G. Morris
Vírus RNA (+), com transcriptase reversa
vírus da leucemia felina
Retroviridae
imunodeficiencia humana, bovina,
felina, dos símios
Leucose dos bovinos e das aves
Visna/maedi, Artrite-encefalite caprina
Família Retroviridae
- nucleocapsídeo icosaédrico
- genoma diplóide, RNA fita simples, polaridade positiva
- envelopados, frágeis
- contém transcriptase reversa
- Três Gêneros:
1- Oncovírus
Leucose bovina (bovine leukemia virus)
HTLV (Human adult T cell leukemia virus)
2- Lentivirus: Vírus da imunodeficiência humana (HIV),
Vírus da imunodeficiencia bovina (BIV),
vírus da imunodeficiencia dos símios (SIV),
vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV),
vírus da anemia infecciosa equina (EIAV)
3- Spumavírus
Retrovírus - Classificação
Leucose bovina
Caprine arthritis encephalitis
virus (CAEV)
Equine infectious anemia virus
(EIAV)
Retrovírus – Retrovírus endógenos
• Sequências inseridas nos genomas, derivadas de infecções virais antigas
=> paleovirologia.
• Provírus integrados são passados de geração em geração.
• Não patogênicos => Não são mais capazes de formar uma partícula viral
infecciosa.
• Cerca de 8% dos genomas contém retrovírus endógenos (ERVs), além de
outros “elementos virais endógenos” (EVEs), derivado dos vírus Ebola,
Borna e outros
• Sincitina: derivada de envelope de retrovírus
FIV / FeLV – Sinais Clínicos
Vírus com genoma DNA
ANELLOVIRIDAE
CIRCOVIRIDAE
PARVOVIRIDAE
ADENOVIRIDAE
PAPILLOMAVIRIDAE
PAPOVAVIRIDAE
VÍRUS DNA
HEPADNAVIRIDAE
HERPESVIRIDAE
IRIDOVIRIDAE
POXVIRIDAE
Famílias de vírus com genoma DNA de
fita simples
Anelloviridae
Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outros
Circoviridae
circovírus suínos (e outros)
parvovírus canino
Parvoviridae
vírus da panleucopenia felina
parvovírus suíno
parvovírus humano (B19)
Anelloviridae
Vírus com genoma de DNA. 1,7 – 3KB
Fita simples
Não envelopados
Muito ubíquos
Associação como doenças?
Ex: vírus Torque teno de diversas espécies
Família Circoviridae
- DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV)
- simetria icosaédrica
- Ex: Circovírus dos suínos, Chicken Anemia,
Vírus Torque teno (TTV) (humanos e muitos outros
similares em diversas espécies)
Circovirose
Suína
(porcine circovirus
type 2; PCV2)
Porcine circovirus (PCV2) detection in cytoplasm and nucleus of infected
cells. Fontes: Pigsite e The Merck Vet Manual
PARVOVIRIDAE
- DNA fita simples
- não envelopados (15-25 nm)
3 gêneros:
Parvovirus (MVM)
Erythrovirus (B19)
Dependovirus
Eritema infeccioso
Parvovirose canina, suína
Famílias de vírus com genoma de DNA
de fita dupla
Papilomaviridae
Poliomaviridae
Adenoviridae
Herpesviridae
Poxviridae
papilomavírus > 70
adenovírus >40
Herpes simples
Varicela-zoster
Epstein-Barr
poxvírus (em quase todas as espécies)
PAPILOMAVIRIDAE
- DNA fita dupla circular
- Sem envelope
- Vários associados a cânceres
Papilomavírus:
(>70)
- verrugas
- condiloma acuminado
- NIC
- epidermodisplasia verruciforme
PAPILLOMAVIRIDAE
17 Gêneros ( pelo menos!!):
Alphapapillomavirus
Betapapillomavirus
Gammapapillomavirus
Deltapapillomavirus
Epsilonpapillomavirus
Etapapillomavirus
Iotapapillomavirus
Kappapapillomavirus
Lambdapapillomavirus
Mupapillomavirus
Nupapillomavirus
Omikronpapillomavirus
Pipapillomavirus
Thetapapillomavirus
Xipapillomavirus
Zetapapillomavirus
Hematúria enzoótica, câncer de bexiga
em bovinos e papilomavírus (BPV2)
•
A hematúria enzoótica (HE) bovina é de ocorrência mundial e apresenta caráter endêmico em regiões com pastagens infestadas com
samambaia (Pteridium aquilinum). Wosiacki et al.: Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 23, n. 1, p. 121-130, jan./jun. 2002
•
A HE é uma doença crônica caracterizada por sinais clínicos de hematúria intermitente, anemia e emagrecimento progressivo e por
lesões hemorrágicas, hiperplásicas e neoplásicas da mucosa da bexiga.
•
A ingestão de samambaia parece ativar o papilomavírus bovino tipo 2 (BPV2), talvez por supressão da resposta imune.
•
BPV2 pode ser detectado em tumores de bexiga de bovinos e búfalos.
•
BPV2 promove a indução da proteína viral denominada E5, uma oncoproteína que promove a divisão celular.
•
Em búfalos, a oncoproteína E5 foi somente localizada nos tecidos tumorais da bexiga e parece estar co-localizada com o superexpresso fator de crescimento beta (β) derivado de plaquetas (“platelet derived growth factor”, ou PDGF-β.) . Roperto S et al. J Gen Virol. 2013
Feb;94(Pt 2):403-8. doi: 10.1099/vir.0.047662-0. Epub 2012 Oct 24. Bovine papillomavirus type 2 infects the urinary bladder of water buffalo (Bubalus bubalis) and plays a crucial role in bubaline urothelial carcinogenesis
BPV1, BPV2 e sarcóide equino
•
O Sarcóide Equino (SE) é o tumor de pele mais comum em equídeos Wobeser et al. 2010.
Epidemiology of equine sarcoids in horses in western Canada. Can Vet J. 2010 October; 51(10): 1103–1108.
.
•
BPV1 ou BPV2 podem estar envolvidos, dependendo de outras variáveis.
•
No RS não há estudos sobre esse tema.
Known locations of sarcoids on the body of horses and donkeys in western Canada
aSome horses had sarcoids in more than 1 location on the body. Can Vet J. 2010 October; 51(10): 1103–1108
a
Known locations of sarcoids
Localização no corpo
Número (%) de animais com pelo menos 1 sarcóide
Cabeça
307 (41.1%)
Membros
149 (20.0%)
Pescoço/ombro
116 (15.5%)
Abdomen
81 (10.9%)
Axila/ Peito
59 (7.9%)
Paragenital
34 (4.6%)
Total
746 (100%)
Sarcóide equino
Sarcóide equino e BPV
Papilomatose
Bovina
(causada por 13 tipos de
Papilomavírus Bovino
(BPV)
POLIOMAVIRIDAE
- DNA fita dupla circular
- Sem envelope
- Importância em imunocomprometidos
Poliomavirus: BK, JC (leucoencefalopatia
multifocal progressiva)
ADENOVIRIDAE
- icosaédricos
- não envelopados
- DNA dupla fita linear
- potencial oncogênico (inativam p53 e pRb)
Gêneros:
- Mastadenovírus (em mamíferos)
- Aviadenovírus (em aves)
•Published: March 17, 2016
•DOI: 10.1371/journal.pone.0151921
Metagenomic Survey of Viral Diversity Obtained from Feces of Subantarctic and South
American Fur Seals
•Mariana Kluge ,
•Fabrício Souza Campos ,
•Maurício Tavares ,
•Derek Blaese de Amorim ,
•Fernanda Pedone Valdez ,
•Adriana Giongo ,
•Paulo Michel Roehe ,
•Ana Claudia Franco
HEPADNAVIRIDAE
- fita dupla parcial de DNA
- envelopado, pleomórfico
- transcrição reversa
2 gêneros:
- Ortohepadnavirus: Hepatite B (humanos)
- Avihepadnavirus (aves)
Ordem Herpesvirales
Família Herpesviridae
• Subfamílias:
• Alfaherpesvirinae (vírus do Herpes simples,
vírus da Varicela/Zoster)
• Betaherpesvirinae (Citomegalovírus; CMV)
• Gamaherpesvirinae (vírus Epstein Barr; EBV)
Herpesvírus bovino tipo 1
• Sinais clínicos
 Secreções nasais
 Secreções oculares
 Salivação excessiva
 Tosse
 Febre
 Abortos
Foto: Fernando Spilki
88
Herpesvírus bovino tipo 1
• IPB:
balanopostite
pustular
infecciosa
 Sinais clínicos:
 Vesículas no pênis
 Pústulas
 Dificuldade de urinar
 Evita a cobertura
89
Herpesvírus bovino tipo 5
Encefalite herpética bovina: animal apoiando a
cabeça contra objetos e cegueira
Foto: Fernando Spilki
Foto: Fernando Spilki
90
Fibropapilloma-associated turtle herpesvirus (FPTHV)
Koi herpesvírus
Família Herpesviridae
• Subfamília:
Betaherpesvirinae
– Cytomegalovirus HHV-5
– Muromegalovirus MCMV-1
– Roseolovirus HHV-6
Família Herpesviridae
• Subfamília:
Gammaherpesvirinae
Febre catarral maligna associada a gnús
(causada pelo Herpesvírus alcelafino tipo 1, um gamaherpesvírus)
Gnú
FCM transmitida por ovinos
Herpesvírus ovino tipo 2
(um gamaherpesvírus)
POXVIRIDAE
- os maiores vírus conhecidos (~ 300 nm)
- simetria complexa
- DNA duplo (codifica > 100 prots)
- multiplicação intracitoplásmica
Varíola
Molusco contagioso
Ectima dos ovinos
Vários outros poxvírus
Família Asfarviridae
• Gênero: Asfivírus:
– Vírus da peste suína
Africana
– Somente infecta suídeos
– Interesse veterinário