Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria

Coleção Brasileira
de Microrganismos
de Ambiente e Indústria
CBMAI
Divisão de Recursos Microbianos
CPQBA/UNICAMP
[email protected]
Locação Institucional

Divisão de Recursos
Microbianos (DRM)



CPQBA/UNICAMP
Coord.: Gilson P. Manfio
suporte financeiro



UNICAMP
FINEP/MCT
FAPESP
http://www.cpqba.unicamp.br
Equipe
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Gilson P. Manfio, Ph.D


Valéria Maia de Oliveira, Dr.


taxonomia e preservação de leveduras
Ana Paula M. Zibordi, Bióloga


biologia molecular, filogenia, caracterização molecular de
bactérias
Mônica M. de Sillos Castro, Ms.


sistemática microbiana
taxonomia e preservação de fungos filamentosos
Patrícia M. Zachelo, Técnica

caracterização e preservação de microrganismos
Escopo

Acervo






arqueas
bactérias
fungos filamentosos e leveduras
plasmídios
OGMs (certificação em andamento)
Grupo de risco

P1 e P2
Atividades
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preservação
depósito





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público
segurança
base de dados
distribuição
identificação
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taxonomia polifásica
caracterização
convencional e
molecular
tipagem
treinamento
pesquisa
assessoria
Infra-estrutura

Preservação
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
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ultracongelador -80oC
liofilizador centrífugo
refrigeração 4oC (Castellani)
N2 líquido (no projeto)
Identificação/autenticação
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microscopia
kits rápidos
sistema de fotodocumentação digital
PCR grupo-específico (termocicladores)
sequenciador automático
sistema de eletroforese de DNA
Infra-estrutura

Informática


acesso à rede do
CPQBA/UNICAMP
servidor de rede do
CBMAI (no projeto)

Sistemas de
Informação

Intranet


gerenciamento de
solicitações e serviços
BIS (Biodiversity
Information System)



dados de catálogo
gerenciamento e
manutenção do acervo
informação associada
Intranet CBMAI

Sistema integrado para o gerenciamento de
solicitações de serviços






solicitação on-line de serviços, formulários
cadastro de clientes
andamento de serviços
resultados e relatórios
diário de bordo (avisos ligados à rotina)
rastreabilidade
Coleção de Culturas
Acervo
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


Bactérias: ~620

Bacillus isolados de processos industriais: 200

Actinomicetos de biomas brasileiros: 426
Fungos filamentosos: 19
Arqueas halofílicas: 6
Culturas-referência para aplicação: 160


normas ASTM, BS, ABNT
linhagens-tipo
Ampliação do acervo

Biota/FAPESP

Ecologia molecular de
bactérias






degradadores de
xenobióticos
Acidithiobacillus spp.
bactérias endofíticas
fixadores de nitrogênio
Microrganismos
endofíticos
Microrganismos
produtores de compostos
bioativos
CTPETRO


Microrganismos
associados a depósitos
de petróleo
Projetos Genoma

Crinipellis perniciosa

link para dados
moleculares do Projeto



Pesquisadores
Indústrias
Outras Coleções
BIS - Biodiversity Information System

dados básicos de catálogo


identificação, origem, depositante...
propriedades e aplicações

propriedades específicas





ambiente e indústria
aplicação em testes, ensaios e ensino
utilização em processos industriais
caracterização molecular

fingerprinting, seqüências

dados quimiotaxonômicos
informações confidenciais
BIS - Tabelas básicas
Espécies
Linhagens
preservação
Referências
Meios de
cultivo
Lotes de
Tabela de espécies - campos









Código da espécie
Tipo de organismo
Gênero
Espécie
Variedade
Descrição da variedade
Autor
Ano
Referências bibliográficas


Regulations
Harzard group



Observações
Taxonomia



código da espécie
referência
Estado alternativo



Observação
código da espécie
morfologia
Sinônimos
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código da espécie
nomenclatura
Tabelas de linhagens - campos











Código da Linhagem
Acesso (público ou restrito)
Código da Espécie
Patente
Observações
Depositada como – cód. espécie
Data do depósito
Status (ativo, inativo)
Preservação
Histórico (outras coleções)
Depositante



Coletor
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

Nome e Código
Data/Endereço
Nome e Código
Data/Endereço
Identificador
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Nome e Código
Data/Endereço

Meio Crescimento


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
Substrato Original
Localização Geográfica



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Nome Popular
Gênero / Espécie / Variedade
Referência
Ecologia


Referência
Hospedeiro


Local e GPS
Patogenicidade


Temperatura
Observações
Referências
Propriedades






Produção de Metabólitos
Degradação
Dados Quimiotaxonômicos
Dados Moleculares
Dados Confidenciais
Referências
Exemplo de registro no BIS

Bacillus sporothermodurans Petterson et al.
0087 Roza, C.R. (158-1) =CCT 7094. Milk UHT. GO,
Brazil. Fing: BOX-PCR data. Tax: [023, 024, 025]
Medium BHI; 37oC - FR
1 2
BOX-PCR fingerprint. Lanes: 1, DNA marker
100 bp ladder (Amersham Biosciences); 2,
strain CBMAI 0087
Exemplo de registro no BIS

Cyclothyrium Petrak
syn. Cytoplea Bizz. & Sacc.
alt. Thyridaria Sacc.
0041 Silva, M. (FB41-6), 03/99 =CCT 6596 =CBS
109850. Estuary sediment [058]. Cubatão SP,
Brazil. Degr: Degradation of pyrene,
phenanthrene, anthracene, benzo[a]pyrene and
bifenil [059]. Tolerant to pyrene [058]. Tax: [060]
Medium MA2; 28oC - FR
Exemplo de registro no BIS

Streptomyces Waksman & Henrici
0207 Sette, L.D. (LS182), 03/98. Soil contaminated
with herbicide [130]. Campinas SP, Brazil. Morphology:
photo [130]. Seq: rDNA 16S. Degr: Degradation of
alachlor herbicide [131]. Tax: [133, 134]
Medium ISP3; 30oC - FR
Optical microscopy 400X. Mycelium. Streptomyces sp. CBMAI 0207.
Bennet’s Agar. 7 days, 30oC
>CBMAI 0207 Streptomyces sp. rDNA 16S partial sequence
1
51
101
151
201
251
301
351
401
451
501
551
601
651
701
751
801
851
901
951
1001
1051
1101
1151
1201
TAACAmskGGGGmAATTGcCCCTTCATTyTGGGACAAGCCCTgGaAAACG
GGGTCTAATACCGGATAACACTCTGTCCTGCATGGGACGGGGTTGAAAGC
TCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGGGGTAA
TGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCgGCCTGAGAGGGCGACCGGCCA
CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGA
ATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATG
ACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGCAAGTGAC
GGTACCTGCAGAAGAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA
TACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTA
GGCGGCTTGTCACGTCGGATGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCCCGGGTCTG
CATTCGATACGGGCTAGCTAGAGTGTGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGG
TGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCG
GATCTCTGGCCATTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTkGGGAGCGAACA
GGrwTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGTTGGGaACTAGGTGTT
GCGACATTCCACGTCGTCGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT
GGGAGTACGCCGCAAGGCTAAACTCAAAGGAATTGACgGGGGCCCGCACA
AGCAGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAA
GGCTTGACATATACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGcCCCCCCTTGTGGTC
GGTATACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGhvmGATGTTGG
GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTCTGTGTTGCCAGCATGCCT
TCGGGGTGATGGGGACTCACAGGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAG
GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTGCACACG
TGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGAyGCCGCGAGGCGGAGCGAAT
CTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTgGGGTCTGCAACTCGACCCCATG
AAGTCGGAGTTGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCT