Taxonomia • Visa classificar em grupos de acordo com propriedades físicas e químicas comuns • Vírus no mesmo grupo frequentemente tem propriedades biológicas semelhantes: – Replicação – Doença não! (cuidado!) – Transmissão Classificação definida pelo: Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV) ICTVdB - The Universal Virus Database (acesso fácil na Internet) International Committee on Taxonomy of Viruses Classificação viral Estrutura (morfologia): Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade Taxonomia Ordem: ... virales Família ... viridae Subfamília ... virinae Espécie/Gênero: ... virus Ordens Seis ordens estabelecidas até o presente (ICTV): Caudovirales bacteriófagos com cauda Herpesvirales vírus herpes de eucariotos Mononegavirales RNA não segmentado polaridade negativa - plantas e animais . Nidovirales RNA polaridade positiva de vertebrados. Picornavirales pequenos vírus RNA que infectam plantas, insetos e animais. Tymovirales RNA de fita simples; infectam plantas. Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentados, polaridade positiva: Arteriviridae Astroviridae Caliciviridae Coronaviridae Flaviviridae Hepeviridae Picornaviridae Togaviridae Astrovírus • Família Astroviridae • 28-35 nm, aparência de estrêla com 5 - 6 pontas • RNA fs+ ~7 kb, poli-A em 3’ , sem cap em 5’ • 3 ORFs (overlap 70 nt entre ORF1a (protease) e ORF1b (RdRP) • Dois gêneros: » Mamastrovirus: gatos, suinos, ovelhas, etc » Aviastrovirus: aves Família ASTROVIRIDAE Gênero: Astrovírus - RNA fs, nús 20-30 nm - encontrados em fezes - associados a diarréias Família Caliciviridae • • • • • RNA fita simples, nús, polaridade positiva Gêneros: Sapovírus Norovírus São as mais importantes causas de gastroenterite viral em adultos. • Geralmente causam gastroenterites leves em jovens. • Alguns tipos de norovírus são zoonóticos Ordem Nidovirales Família Coronaviridae - Pleomórficos, envelopados - peplômeros espaçados - RNA fs positiva (+) Gêneros: Coronavírus; Torovírus Coronavírus humano (resfriados) Bronquite Infecciosa das Aves Peritonite Infecciosa dos felinos FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE - Flavi = amarelo - globulares (50 nm) - RNA fs positiva - nucleocapsídeo icosaédrico - envelopados -Gêneros: Flavivírus Febre Amarela, Dengue 1,2,3,4 Pestivírus Hepacivirus: Hepatite C (!!!) Hepeviridae • Gênero Hepevirus=> Vírus da hepatite E • Genótipos 1 e 2 infectam humanos • Genótipos 3 e 4 são zoonóticos=> humanos e várias outras espécies • - Não envelopado, fs, +, 7200 nt, • - Com cap, poliadenilado • Genoma: 5´ UTR- três ORFs - 3´UTR Família Picornaviridae - Pico = pequeno - simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA (+) fs - não envelopados - 13 Gêneros: Ex: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovírus (Polio, Coxsackie, Entero) Rinovírus (resfriados) Família Togaviridae - Grupo IV : RNA fs (+) - envelopados - pleomórficos (70 nm) - RNA fs positiva -Gêneros: Alfavírus (n= 27): infectam várias espécies -Causam arboviroses: -ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana Rubivírus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!) Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentado, com polaridade negativa Filoviridae Paramyxoviridae Rhabdoviridae Família Filoviridae - filamentosos (80-14 000 nm) - envelopados - RNA fs negativa Ebola Marburg Família Paramyxoviridae Duas sub-famílias: Paramyxovirinae: Generos: Respirovirus: Parainfluenza PI-1, PI-3, Rubulavirus: PI-2,Cachumba Morbillivirus: Cinomose, Sarampo, Morbilivírus das focas Pneumovirinae: Pneumovirus: HRSV, BRSV, Metapneumovirus humano Metapneumovírus aviário Henipavirus: Hendra, Nipah Família Rhabdoviridae • forma de bala • Simetria helicoidal • RNA fs negativa Gêneros: Lyssavirus: Raiva, Lagos Bat, Mokola, Obodhiang, Kotonkan Vesiculovírus: Estomatite Vesicular Efemerovirus: Vírus com genoma RNA de fita simples, segmentado, polaridade negativa (Baltimore Grupo V) Arenaviridae Bornaviridae Bunyaviridae Orthomyxoviridae Família: Arenaviridae - Pleomórficos (globulares) 50-300 nm - Envelopados - Duas fitas simples de RNA (L e S) - Contem ribossomos - Usualmente são vírus latentes de roedores Gênero Arenavirus - Coriomeningite linfocítica - Febre Lassa - Febres hemorrágicas: Argentina e Boliviana LCMV-Lassa virus (Old World) complex: Gbagroube virus Ippy virus Kodoko virus Lassa virus Lujo virus Luna virus Lunk virus Lymphocytic choriomeningitis virus Merino Walk virus Menekre virus Mobala virus Mopeia virus Tacaribe virus (New World) complex: Amapari virus Chapare virus Flexal virus Guanarito virus Junin virus Latino virus Machupo virus Oliveros virus Paraná virus Pichinde virus Pirital virus Sabiá virus Tacaribe virus Tamiami virus Whitewater Arroyo virus Arenavírus: genoma de RNA segmentado, polaridade negativa (mas ambisenso!) Os dois segmentos são denominados “S” (Small) e “L” (Large), Codificam 4 proteínas em sentido ambisenso, muito particular: Duas fitas de RNA sentido “ambíguo”, ou seja, parte do RNA codifica uma proteína (2), outra parte gera uma cópia de sentido positivo (mRNA) para produzir proteína viral. Família: Bunyaviridae Ordem: Mononegavirales - Globulares (100nm) - Envelopados - Três segmentos de RNA de fita simples, polaridade negativa - Quatro gêneros: Bunyavirus (18 grupos antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba, Guaroa e muitos outros. Phlebovirus (8 grupos antigênicos, transmitidos por Phlebotomum). Nairovirus (6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus transmitidos por carrapatos). Hantavirus (pelo menos 6 vírus, não-arbo, transmitidos por roedores) Orthomyxoviridae - myxo = muco - pleomórficos - RNA fs (-) - nucleocapsídeo helicoidal, segmentado (C=7; A & B= 8) - envelopados - Gêneros: Influenza A,B,C > importante: A Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado (Baltimore grupo III) Birnaviridae Reoviridae Família Birnaviridae - sem envelope, icosaédricos - RNA bisegmentado Gêneros: Aquabirnavirus; type species: Infectious pancreatic necrosis virus Avibirnavirus; type species: Infectious bursal disease virus Blosnavirus; type species: Blotched snakehead virus Entomobirnavirus; type species: Drosophila X virus Família Reoviridae - dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA fita dupla - não envelopados - Gêneros: Orthoreovírus Orbivírus Rotavírus Os reovírus apresentam propriedades oncolíticas e tem sido testados como anti-cancerígenos. Reoviridae: duas subfamílias: Sedoreovirinae: contém seis gêneros: Cardoreovirus Mimoreovirus Orbivirus Phytoreovirus Rotavirus Seadornavirus Spinareovirinae: contém nove gêneros: Aquareovirus Coltivirus Cypovirus Dinovernavirus Fijivirus Idnoreovirus Mycoreovirus Orthoreovirus Oryzavirus Outro gênero não classificado: Crabreovirus[9] Referência sobre reovírus e terapia anticancer: Gene Therapy of Cancer Methods in Molecular Biology™ Volume 542, 2009, pp 607-634 Oncolytic Viral Therapy Using Reovirus Chandini Thirukkumaran & Don G. Morri Vírus RNA (+), com transcriptase reversa vírus da leucemia felina Retroviridae imunodeficiencia humana, bovina, felina, dos símios Leucose dos bovinos e das aves Visna/maedi, Artrite-encefalite caprina Família Retroviridae - nucleocapsídeo icosaédrico - genoma diplóide, RNA fita simples, polaridade positiva - envelopados, frágeis - contém transcriptase reversa - Três Gêneros: 1- Oncovírus Leucose bovina (bovine leukemia virus) HTLV (Human adult T cell leukemia virus) 2- Lentivirus: Vírus da imunodeficiência humana (HIV), Vírus da imunodeficiencia bovina (BIV), vírus da imunodeficiencia dos símios (SIV), vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV), vírus da anemia infecciosa equina (EIAV) 3- Spumavírus Vírus com genoma DNA ANELLOVIRIDAE PARVOVIRIDAE ADENOVIRIDAE CIRCOVIRIDAE HEPADNAVIRIDAE PAPILLOMAVIRIDAE PAPOVAVIRIDAE VÍRUS DNA HERPESVIRIDAE POXVIRIDAE Famílias de vírus com genoma DNA de fita simples Anelloviridae Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outros Circoviridae Circovírus, gyrovirus parvovírus canino Parvoviridae vírus da panleucopenia felina parvovírus suíno parvovírus humano (B19) Anelloviridae Vírus muito pequenos, com genoma de DNA. 1,7 – 3KB Fita simples Não envelopados Muito ubíquos Associação como doenças? Ex: vírus Torque teno de diversas espécies Família Circoviridae - DNA fita simples, 1,76 - 3,7 kilobases - simetria icosaédrica - Gêneros: Circovirus: Circovírus dos suínos Gyrovirus: vários girovírus humanos PARVOVIRIDAE - DNA fita simples - não envelopados (15-25 nm) 3 gêneros: Parvovirus (MVM) Erythrovirus (B19) Dependovirus Eritema infeccioso Famílias de vírus com genoma de DNA de fita dupla Papilomaviridae Poliomaviridae Adenoviridae Herpesviridae Poxviridae papilomavírus > 70 adenovírus >40 Herpes simples Varicela-zoster Epstein-Barr poxvírus (em quase todas as espécies) PAPILOMAVIRIDAE - DNA fita dupla circular - Sem envelope - Todos associados a tumores benignos - Alguns associados a cânceres Papilomavírus: (>120) - verrugas - condiloma acuminado - neoplasia intracervical (NIC) - epidermodisplasia verruciforme PAPILLOMAVIRIDAE Gêneros: 1- Alphapapillomavirus 2-Betapapillomavirus 3-Gammapapillomavirus 4-Deltapapillomavirus 5-Epsilonpapillomavirus 6- Etapapillomavirus 7-Iotapapillomavirus 8-Kappapapillomavirus 9-Lambdapapillomavirus 10-Mupapillomavirus 11-Nupapillomavirus 12-Omikronpapillomavirus 13-Pipapillomavirus 14-Thetapapillomavirus 15-Xipapillomavirus 16-Zetapapillomavirus POLIOMAVIRIDAE - DNA fita dupla circular - Sem envelope Poliomavírus: muito ubíquos, normalmente não causam doença Causam problemas em imunodeprimidos: A mais importante: leucoencefalopatia multifocal progressiva (PMLE) Carcinoma de células Merkel Amostras padrão: BK, JC ADENOVIRIDAE “Fibras” nos pentons - Icosaédricos Formato tipico de “satélite” Não envelopados DNA dupla fita linear Tem potencial oncogênico (inativam p53 e pRb), mas não em humanos! Gêneros: - Mastadenovírus (em mamíferos) - Mais de 50 distintos vírus em humanos HEPADNAVIRIDAE - Fita dupla parcial de DNA - Envelopado, pleomórfico - Atenção: faz transcrição reversa ! Um gênero em humanos: - Ortohepadnavirus: Hepatite B Herpesvirales Família: Herpesviridae Ordem: • Três sub-famílias: • Alfaherpesvirinae (vírus do Herpes simples, vírus Varicela/Zoster) • Betaherpesvirinae (Citomegalovírus; CMV) • Gamaherpesvirinae (vírus Epstein Barr; EBV) Família Herpesviridae • Subfamília: Betaherpesvirinae – Cytomegalovirus HHV-5 – Muromegalovirus MCMV-1 – Roseolovirus HHV-6 Família Herpesviridae • Subfamília: Gammaherpesvirinae – Lymphocryptovirus HHV-4 (vírus Epstein Barr, EBV) – Rhadinovirus POXVIRIDAE - os maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) - simetria complexa - DNA duplo (codifica > 100 prots) - multiplicação intracitoplásmica Varíola Molusco contagioso