Dogma Central da Biologia Como o DNA se relaciona com as proteínas? - É feita uma cópia (negativa) de um trecho de DNA (transcrição) - mRNA é traduzido em proteínas (tradução) out/2007 1 Gene Definição molecular atual São segmentos úteis de DNA (ou RNA – em alguns organismos). Toda seqüência de nucleotídeos necessária para a síntese de uma cadeia polipeptídica ou de RNA funcionais. Seqüência codante ATG Promotor E1 I1 E2 Cauda de poliadenina I2 E3 PoliA Interruptor do gene Seqüência não-codante Fatores transcricionais RNA polimerase Splicing TRANSCRIÇÃO • Processo pelo qual uma molécula de RNA é sintetizada a partir da informação contida na seqüência de nucleotídeos de uma molécula de DNA fita dupla. • A transcrição representa a diversidade e a complexidade da expressão dos genes contidos em um determinado genoma. • Enquanto a síntese de DNA deve ser precisa e uniforme, a transcrição reflete o estado fisiológico da célula e, portanto, é extremamente variável para atender às suas necessidades. TRANSCRIÇÃO Características Gerais: •Complementaridade •Antiparalelismo ( T = U) •Síntese 5' 3‘ •RNA Polimerase (RNAP): • Funções reconhecem e ligam-se desnaturam DNA mantém estável a dupla fita aberta mantém estável DNA:RNA terminam síntese restauram DNA TRANSCRIÇÃO • Apenas uma das fitas do DNA é utilizada como molde, portanto, a molécula de RNA sintetizada é complementar à fita de DNA que lhe deu origem e idêntica à outra fita de DNA, sendo as timinas substituídas por uracilas • Em 1960, Hurwitz, Stevens e Weiss descobriram, independentemente, uma enzima capaz de sintetizar RNA na presença de DNA fita dupla e dos nucleotídeos A, U, C, G. • Esta enzima foi denominada RNA polimerase. DNA Transcrição DNA RNA RNA POLIMERASE • Reconhece e liga-se a seqüências específicas de DNA; • Desnatura o DNA expondo a seqüência de nucleotídeos a ser copiada; • Mantém as fitas de DNA separadas na região de síntese; • Renatura o DNA na posterior à da síntese; região imediatamente • Sozinha, ou com o auxílio de específicas, termina a síntese do RNA. proteínas RNA POLIMERASE Em eucariotos existem vários subtipos de RNA polimerases envolvidas na síntese de RNAs específicos: . RNA polimerase I – localizada no nucléolo e responsável pela síntese do RNA ribossômico . RNA polimerase II – localizada no nucleoplasma e responsável pela síntese do RNA mensageiro . RNA polimerase III – também localizada no nucleoplasma e responsável pela síntese do RNA transportador TRANSCRIÇÃO • Reação ocorre entre o radical hidroxil da extremidade 3’ de um ribonucleotídeo e o grupo fosfato do carbono 5’ do ribonucleotídeo a ser incorporado • A reação processa-se no sentido 5’ de DNA copiada é a de sentido 3’ 5’ 3’ e a fita • Diferentemente da DNA polimerase, a RNA polimerase não necessita de um iniciador (primer) para processar a síntese da nova fita TRANSCRIÇÃO 1.INÍCIO Reconhecimento de seqüências específicas no DNA 2. ALONGAMENTO Incorporação dos ribonucleotídeos 3. TERMINAÇÃO Seqüências no DNA são reconhecidas e a síntese é interrompida INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO • O DNA apresenta seqüências específicas, denominadas PROMOTORES, que sinalizam exatamente onde a síntese do RNA deve ser iniciada. • Os promotores são, primeiramente, reconhecidos por fatores de transcrição que, ligados ao DNA, interagem com outros fatores, formando um complexo ao qual a RNA polimerase se associa. INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO • As seqüências reguladoras da transcrição podem ser divididas em: . elementos promotores: seqüências de 100 a 200 nucleotídeos próximos ao sítio de início da transcrição que possuem seqüências consenso TATA denominadas “TATA box” . elementos “enhancer” ou amplificadores: seqüências pequenas de DNA que podem ocorrer na região “upstream” do gene. Ativam a expressão do mesmo. Amplificam o sinal 100 vezes e os fatores de transcrição que se ligam a eles são chamados ativadores INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO As fitas do DNA se separam 10 bases upstream ao sítio de iniciação, mais especificamente no “TATA box”. A fita molde fica exposta e, desta forma, a síntese da cadeia complementar de RNA pode ser iniciada. ALONGAMENTO DA CADEIA A polimerase desliza ao longo da fita molde extendendo um cadeia de RNA crescente no sentido 5’ 3’ através da adição de ribonucleotídeos. Este processo ocorre até a RNA polimerase encontrar uma seqüência específica no DNA que determina o término do alongamento. TÉRMINO DA TRANSCRIÇÃO • Quando a RNA polimerase encontra o sítio de terminação na fita molde, ela se desliga do DNA juntamente com a nova cadeia de RNA sintetizada devido à uma desestabilização do complexo de transcrição • O desligamento do RNA do sistema provoca a ruptura do complexo de transcrição e as fitas do DNA são renaturadas Diferenças e semelhanças entre eucariotos e procariotos Em procariotos a tradução (síntese de proteínas) e a transcrição são praticamente simultâneas Mas, em eucariotos a transcrição está separada da síntese de proteínas (tradução) pela membrana nuclear Os eucariotos processam extensivamente o RNA destinado a se tornar mRNA; transcritos primários em eucariotos recebem um "capuz" na extremidade 5' e uma cauda poli A na extremidade 3' Nos eucariotos quase todos os mRNAs são clivados; introns são retirados para formar mRNAs com mensagens contínuas O PROCESSAMENTO DO RNA • Os diferentes RNAs sintetizados no processo de transcrição são chamados de transcritos primários; • Na maioria das vezes, esses transcritos não representam a molécula madura, ou seja, aquela cuja seqüência e estrutura correspondem à forma final do RNA funcional; • Esses transcritos necessitam sofrer modificações que fazem parte do processamento do RNA. PROCESSAMENTO DO mRNA O transcrito primário da molécula de mRNA é também conhecido como pré-mRNA Este RNA precursor é sintetizado no núcleo e sofre várias alterações transformado-se no que se chama mRNA maduro ou processado. O RNA maduro é, então, transportado ao citoplasma onde será traduzido PROCESSAMENTO DO mRNA • Após o início da transcrição da molécula de mRNA é adicionado um resíduo de guanina à sua extremidade 5’. • Este resíduo chamado “cap” sofre, então, metilação (adição do radical metil) na posição 7 da guanina resultando na formação do nucleotídeo 7-metilguanilato. • O “cap” protege a extremidade 5’ da ação de exonucleases e, também, é utilizado para reconhecimento, pelo ribossomo, do sítio de início do processo de síntese protéica. PROCESSAMENTO DO mRNA • A maioria dos mRNAs possui uma seqüência de resíduos de adenina na sua extremidade 3’ que é chamada de cauda poliA e é adicionada à molécula durante a transcrição. • Quando se reconhece a seqüência AAUAAA, altamente conservada e localizada 10 a 30 nucleotídeos “upstream” ao sítio de poliadenilação, é um sinal de que a molécula está terminando e que deve ser adicionada a cauda poliA à extremidade da mesma. PROCESSAMENTO DO mRNA • Após a adição do “cap” 5’ e da cauda poliA, a molécula de pré-mRNA sofre o processo de excisão dos introns e junção dos exons, mecanismo conhecido como “splicing” e migra para o citoplasma da célula. • Os introns apresentam um grau de conservação maior do que os exons além de apresentarem uma característica muito importante: Os primeiros e os últimos dois nucleotídeos da extremidade 5’ e 3’, GU e AG, são altamente conservados. RNAm liga-se as Ribonucleoproteínas nucleares pequenas (snRNPs) Splicing mediado por spliceossomo: Utiliza ATP •FUNÇÃO: ajuda a clivar no sítio de splicing remove intron une os éxons anteriores e posteriores PROCESSAMENTO DO mRNA Splicing: •FUNÇÃO: ajuda a clivar no sítio de splicing remove intron impede afastamento dos éxons une os éxons PROCESSAMENTO DO mRNA Estrutura do mRNA PROCESSAMENTO DO mRNA • Um transcrito primário pode ser processado de diferentes maneiras sendo que o que é intron para um mRNA pode ser exon para outro mRNA que provém do mesmo RNA precursor • Esta diferença de processamento pode ser devida à presença de dois ou mais sítios de poliadenilação e/ou à diferença no processo de “splicing” do pré-mRNA •Control of alternative RNA splicing and gene expression by eukaryotic riboswithces, Nature, vol. 447, pág. 497, 2007. Processamento alternativo do RNA 23.000 genes 100.000 proteínas MOLÉCULAS DE RNA • RNA mensageiro – carrega a informação copiada do DNA sob a forma de inúmeros “triplets” cada um especificando um aminoácido • RNA transportador – decifra o código representado pelo mRNA • RNA ribossômico – associa-se com uma série de proteínas para formar os ribossomos