Aula Teórica - Nomenclatura e Classificação
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LABVIR Universidade Federal do Rio Grande do Sul Instituto de Ciências Básicas da Saúde Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia Disciplina de Virologia Básica CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS Equipe de Virologia ICBS/UFRGS CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS ICTV, 2016 http://www.ictvonline.org/index.asp Classificação definida pelo: Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV) ICTVdB - The Universal Virus Database International Committee on Taxonomy of Viruses Taxonomia Ordem ...virales Mononegavirales Família ...viridae Paramyxoviridae ...virinae Paramyxovirinae ...virus Morbillivirus Subfamília Gênero Espécie vírus da cinomose canina Como se escreve? Exemplos: 1. 2. Família Poxviridae, sub-família Chordopoxvirinae, gênero Orthopoxvirus, vírus vaccínia. Família Herpesviridae, sub-família Alphaherpesvirinae, gênero Simplexvirus, herpes vírus humano 2 (vírus do herpes simples 2). No uso vernacular informal, deve-se substituir o uso de "ph" por "f" e o do "y" por "i", e deve-se usar assento quando apropriado. Por exemplo: alfaherpesvírus, paramixovírus, aftovírus. Fonte: Cornelia Büchen- Osmond, ICTV Família Características estruturais; Morfológicas; Genéticas; Biológicas em comum. Família Herpesviridae Possuem vírions grandes; Com envelope contendo várias glicoproteínas; Capsídeo icosaédrico; Uma camada protéica – denominada tegumento – entre o capsídeo e o envelope; DNA de fita dupla linear; Capazes de estabelecer latência. Família Herpesviridae Subfamília Alphaherpesvirinae Betaherpesvirinae Gammaherpesvirinae Gêneros Simplexvirus Varicellovirus Espécies BoHV-1 BoHV-5 SuHV-1 “Espécie de vírus é uma de vírus que constitui uma linhagem replicativa e ocupa um nicho ecológico particular” “A classificação em subespécies, cepas, variantes e isolados não existe de forma oficial, embora sua importância seja reconhecida para o diagnóstico, para estudos biológicos e moleculares e também para a produção de vacinas.” O termo isolado (ou amostra) refere-se a um vírus que foi obtido por isolamento de uma determinada fonte de infecção (animal infectado). O termo cepa é utilizado para designar amostras de vírus que já foram bem caracterizadas e sobre as quais já se possui certo conhecimento. Classificação viral Estrutura (morfologia): Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade Uma outra classificação prática, não oficial: • Respiratórios: vírus que penetram no hospedeiro por inalação e produzem infecção e doença primariamente no trato respiratório. Ex: rinovírus, calicivírus; • Entéricos: vírus que penetram pela via oral e replicam no trato intestinal. Ex: coronavírus, rotavírus; • Arbovírus: vírus que replicam e são transmitidos por vetores artrópodos. Ex: vírus da encefalites eqüinas leste e oeste; • Vírus oncogênicos: vírus com potencial para induzir transformação celular e tumores nos hospedeiros. Ex: retrovírus, papilomavírus. Famílias virais • • • • • • • Vírus com genoma RNA de sentido positivo Vírus com genoma RNA de sentido negativo não-segmentado Vírus com genoma RNA de sentido negativo segmentado Vírus com genoma RNA de cadeia dupla Vírus com genoma RNA que realizam transcrição reversa Vírus com genoma DNA fita simples Vírus com genoma DNA fita dupla Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentados, polaridade positiva: Arteriviridae Astroviridae Caliciviridae Hepeviridae Coronaviridae Picornaviridae Flaviviridae Togaviridae ssRNA(+) CORONAVIRIDAE -Envelope lipídico com peplômeros que projetam externamente (aspecto de coroa). -Entre os vírus RNA é o que apresenta o maior genoma (27 a 32kb). -Em humanos está relacionado a resfriados comuns. Coronavirus: •Vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) •Coronavírus humano (HuCoV) •Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV) •Torovirus: •Torovirus: EToV; BToV; SToV e HToV Bronquite infecciosa das galinhas Coronavírus Infecção respiratória Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV): doença respiratória severa na Ásia. Astrovírus • Família Astroviridae • 28-35 nm, aparência de estrêla com 5 - 6 pontas • RNA fs+ ~7 kb, poli-A em 3’ , sem cap em 5’ • 3 ORFs (overlap 70 nt entre ORF1a (protease) e ORF1b (RdRP) • Mamastrovirus: gatos, suinos, ovelhas, etc • Aviastrovirus: aves Família ASTROVIRIDAE Gênero: Astrovírus - RNA fs, nús 20-30 nm - encontrados em fezes - associados a diarréias ssRNA(+) PICORNAVIRIDAE - Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovirus (poliomielite, enterovírus bovino, suíno B e humanos A, B, C e D) Rinovirus (resfriados) Aphtovirus (Febre Aftosa) Família Picornaviridae Aphtovirus (febre aftosa) - FEBRE AFTOSA – efeitos indiretos no meio ambiente - Vacina Sabin Família Caliciviridae • • • • • RNA fita simples, nús, polaridade positiva Gêneros: Sapovírus Norovírus São as mais importantes causas de gastroenterite viral em humanos. • Geralmente causam gastroenterites leves em animais jovens de várias espécies. ssRNA(+) FLAVIVIRIDAE - Estão classificados vários agentes de doenças hemorrágicas e encefalites transmitidas por mosquitos. -Gêneros: Flavivirus : vírus da febre amarela (YFV), vírus da dengue 1,2,3,4 vírus zika Pestivius: Vírus da diarreia viral bovina tipos 1 e 2 (BVDV1 e BVDV2) Vírus da peste suína clássica (CSFV) Hepacivirus: Hepatite C Família Togaviridae - Grupo IV : RNA fs (+) - envelopados - pleomórficos (70 nm) - RNA fs positiva -Gêneros: Alfavírus (n= 27): infectam várias espécies -Causam arboviroses: -ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana, -Chikungunya Rubivírus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!) Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentado, com polaridade negativa Filoviridae Paramyxoviridae Rhabdoviridae ssRNA(-) FILOVIRIDAE Gêneros: – Ebolavirus: vírus Ebola. Os vírus dessa família causam hemorrágicas em humanos. doenças Paramyxoviridae - Associados principalmente a doenças respiratórias identificadas em mamíferos e aves. Paramyxovirinae: Respirovirus: parainfluenza bovina tipo 3. Morbillivirus: cinomose, sarampo. Rubulavirus: vírus da caxumba. Pneumovirinae: Pneumovirus: Vírus sincicial respiratório bovino (BRSV) Metapneumovirus humano Metapneumovírus aviário ssRNA(+) ssRNA(-) Rhabdoviridae - Característica morfológica lembrando um projétil de arma de fogo. Gêneros: Lyssavirus: Raiva (RV) Vesiculovirus: vírus da estomatite vesicular (VSV) Vírus com genoma RNA de fita simples segmentado Arenaviridae Orthomyxoviridae Bunyaviridae Família: Arenaviridae - Pleomórficos (globulares) 50-300 nm - Envelopados - Duas fitas simples de RNA (L e S) - Contem ribossomos - Usualmente são vírus latentes de roedores Gênero Arenavirus - Coriomeningite linfocítica - Febre Lassa - Febres hemorrágicas: Argentina e Boliviana LCMV-Lassa virus (Old World) complex: Gbagroube virus Ippy virus Kodoko virus Lassa virus Lujo virus Luna virus Lunk virus Lymphocytic choriomeningitis virus Merino Walk virus Menekre virus Mobala virus Mopeia virus Tacaribe virus (New World) complex: Amapari virus Chapare virus Flexal virus Guanarito virus Junin virus Latino virus Machupo virus Oliveros virus Paraná virus Pichinde virus Pirital virus Sabiá virus Tacaribe virus Tamiami virus Whitewater Arroyo virus Família: Bunyaviridae Ordem: Mononegavirales - Globulares (100nm) - Envelopados - Três segmentos de RNA de fitasimples, polaridade negativa - Gêneros: Bunyavirus (18 grupos antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba, Guaroa e muitos outros. Nairovirus (6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus transmitidos por carrapatos). Hantavirus (pelo menos 6 vírus, não-arbo, transmitidos por roedores) ORTHOMYXOVIRIDAE - myxo = muco Glicoproteínas hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NE) - Gêneros: -Influenzavirus A (FluAV) -Influenzavirus B (FluBV) -Influenzavirus C (FluCV) Genoma segmentado : FluAV – 8 seg. FluBV – 7 seg. FluCV – 6 seg. Vírus com genoma RNA de fita dupla Reoviridae Birnaviridae REOVIRIDAE - Dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm) - Gêneros: Orthoreovirus Orbivirus (língua Azul) Rotavirus dsRNA Fonte: Simone Guadagnucci Morillo PATOGÊNESE * * Os rotavírus aderem ao epitélio do trato GI (mucosa jejunal) Aumento da Motilidade e Diminuição da Absorção Danos da região apical das vilosidades Enterotoxina viral NSP4 Zuckerman A et al, eds. Principles and Practice of Clinical Virology. 2nd ed. Londres: John Wiley & Sons; 990:182. Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado Retroviridae ssRNA (RT) Retroviridae - Replicação viral complexa; integra seu provírus ao DNA da célula: infectam o hospedeiro para o resto da vida. - Associados a doenças tumorais e imunossupressivas. Orthoretrovirinae Alpharetrovirus: leucose aviária (ALV) Gammaretrovirus: leucose felina (FeLV) Deltateretrovirus: leucose bovina (VLB) Lentivirus: anemia infecciosa equina (EIAV) imunodeficiência felina (FIV) imunodeficiência humana (HIV) Imunodeficiência humana (HIV) Imunodeficiência felina (FIV) Vírus com genoma DNA fita simples Anelloviridae Circoviridae Parvoviridae Anelloviridae Vírus com genoma de DNA. 1,7 – 3KB Fita simples Não envelopados Muito ubíquos Associação como doenças? Ex: vírus Torque teno de diversas espécies ssDNA CIRCOVIRIDAE Menores vírus com genoma DNA Gêneros: CIRCOVIRIDAE Swan circovirus Goose circovirus Porcine circovirus 1 genus Circovirus Porcine circovirus 2 Bat cyclovirus Cyclovirusa genus ´Cyclovirus´ Cyclovirus TN18 Chicken anemia virusa Chicken anemia virusb Chicken anemia virusc Chicken gyrovirus Avian gyrovirus 2 2 Max. divergence 309, Clustal V (PAM250) genus Gyrovirus Descoberta de um novo agente : Girovírus das aves tipo 2 Discovery of a genome of a distant relative of chicken anemia virus reveals a new member of the genus Gyrovirus. Franciscus A. M. Rijsewijk, Helton F. dos Santos, Thais F. Teixeira, Samuel P. Cibulski, Ana Paula M. Varela, Diogenes Dezen, Ana Cláudia Franco, Paulo M. Roehe. Publicado em: Archives of Virology, 2011 • DOI 10.1007/s00705-011-0971-6 ssDNA PARVOVIRIDAE Parvovirus: parvovírus canino tipos 1 e 2 (CPV-1; CPV-2), vírus da panleucopenia felina (FPLV), parvovírus suíno (PPV), parvovírus bovino (BPV); Erythrovirus: vírus B19 humano (aborto) Dependovirus: vírus adeno-associado 2 (AAV). Vírus com genoma DNA fita dupla Papillomaviridae Polyomaviridae Adenoviridae Hepadnaviridae Herpesviridae Poxviridae Asfarviridae dsDNA PAPILOMAVIRIDAE - Vários associados a cânceres Papilomavírus: - Verrugas - Epidermodisplasia verruciforme Alphapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-32); Betapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-5); Gammapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-4) Epsilonpapillomavirus: papilomavírus bovino tipo 5 (BPV-5); PAPILLOMAVIRIDAE 17 Gêneros ( pelo menos!!): Alphapapillomavirus Betapapillomavirus Gammapapillomavirus Deltapapillomavirus Epsilonpapillomavirus Etapapillomavirus Iotapapillomavirus Kappapapillomavirus Lambdapapillomavirus Mupapillomavirus Nupapillomavirus Omikronpapillomavirus Pipapillomavirus Thetapapillomavirus Xipapillomavirus Zetapapillomavirus HEPADNAVIRIDAE dsDNA (RT) - Transcrição reversa 2 gêneros: - Ortohepadnavirus: hepatite B (HBV) - Humano - Avihepadnavirus: vírus da hepatite B dos marrecos (DHBV) dsDNA HERPESVIRIDAE • Alfaherpesvirinae – Simplexvirus: » Herpesvírus bovino tipo 2 » Vírus do herpes simplex humano tipo 1 e 2 (HSV-1 e HSV-2) – Varicellovirus: » Vírus da rinotraqueíte bovina (BoHV-1) » BoHV-5 » SuHV-1 – Mardivirus: » Vírus da doença de Marek – Iltovirus: » Vírus da laringotraqueíte infecciosa das galinhas (ILTV) dsDNA POXVIRIDAE - Um dos maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) - simetria complexa (retangular ou ovoide) Avipoxvirus: bouba aviária Orthopoxvirus: Varíola Parapoxvirus: ectima contagioso dos ovinos (ORFV) Vários outros poxvírus Varíola Humana (VARV) LABVIR Universidade Federal do Rio Grande do Sul Instituto de Ciências Básicas da Saúde Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia Disciplina de Virologia Básica CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS Obrigado!
