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Laboratório: ICBS- sala 208
(aulas, métodos, artigos, referências, material didático)
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Prof. Paulo Roehe
Taxonomia
• Visa classificar em grupos de acordo com
propriedades físicas e químicas comuns
• Vírus no mesmo grupo frequentemente tem
propriedades biológicas semelhantes:
– Replicação
– Doença não! (cuidado!)
– Transmissão
Desenhos de vírus de mamíferos
http://viralzone.expasy.org/all_by_species/5216.html
Classificação definida pelo:
Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus
(ICTV)
ICTVdB - The Universal Virus Database
(acesso fácil na Internet)
International Committee on
Taxonomy of Viruses
Classificação viral é baseada em:
Estrutura (morfologia):





Forma
Tamanho
Simetria
Envelope
Estrutura do genoma
Propriedades físicas :
 Sensibilidade a agentes físicos e químicos
Relações antigênicas- vírus relacionados
podem ter antígenos comuns
Propriedades biológicas




Estratégias de replicação
Gama de hospedeiros
Modo de transmissão
Patogenicidade
Taxonomia: sufixos
Ordem: ... virales da ordem ....
Família ... viridae da família....
Subfamília ... virinae da subfamília...
Espécie/Gênero: ... virus
Ordens
Seis ordens estabelecidas até o presente (ICTV):
Caudovirales bacteriófagos com cauda
Herpesvirales vírus herpes de eucariotos
Mononegavirales RNA não segmentado polaridade negativa - plantas e animais .
Nidovirales RNA polaridade positiva de vertebrados.
Picornavirales pequenos vírus RNA que infectam plantas, insetos e animais.
Tymovirales RNA de fita simples; infectam plantas.
Classificação:
Pode ser abordada de diferentes formas;
Aqui: vamos apresentar as famílias de acordo
com o tipo de genoma:
Classificação de Baltimore
II
III
DNA fs
RNA fd
I
DNA fd
DNA fd
V
RNA fs(-)
RNA fs (+)
IV
RNA fs(+)
RNA fs(-)
mRNA
DNA fd
RNA
RNA/DNA
RNA fs/TR VI
VII
DNA fd/TR
9
II
II
ANELLOVIRIDAE
II
CIRCOVIRIDAE
I
ADENOVIRIDAE
PARVOVIRIDAE
I
PAPILLOMAVIRIDAE
I
POLIOMAVIRIDAE
VÍRUS DNA
HEPADNAVIRIDAE
I
HERPESVIRIDAE
I
I
POXVIRIDAE
I Famílias de vírus com genoma de DNA
Papilomaviridae
Poliomaviridae
Adenoviridae
Herpesviridae
Poxviridae
Asfarviridae
de fita dupla
papilomavírus > 70
adenovírus >40
Herpes simples
Varicela-zoster
Epstein-Barr
poxvírus (em quase todas as espécies)
PAPILOMAVIRIDAE
- DNA fita dupla circular
- Sem envelope
- Todos associados a tumores benignos
- Alguns associados a cânceres
Papilomavírus:
(>120)
- verrugas
- condiloma acuminado
- neoplasia intracervical (NIC)
- epidermodisplasia verruciforme
I
HPV - Verrugas
I
PAPILLOMAVIRIDAE
Gêneros:
1- Alphapapillomavirus
2-Betapapillomavirus
3-Gammapapillomavirus
4-Deltapapillomavirus
5-Epsilonpapillomavirus
6- Etapapillomavirus
7-Iotapapillomavirus
8-Kappapapillomavirus
9-Lambdapapillomavirus
10-Mupapillomavirus
11-Nupapillomavirus
12-Omikronpapillomavirus
13-Pipapillomavirus
14-Thetapapillomavirus
15-Xipapillomavirus
16-Zetapapillomavirus
POLIOMAVIRIDAE I
- DNA fita dupla circular
- Sem envelope
Poliomavírus: muito ubíquos, normalmente não causam doença
Causam problemas em imunodeprimidos:
A mais importante: leucoencefalopatia multifocal progressiva
(PMLE)
Carcinoma de células Merkel
Amostras padrão: BK, JC
I
ADENOVIRIDAE
“Fibras” nos pentons
-
Icosaédricos
Formato tipico de “satélite”
Não envelopados
DNA dupla fita linear
Tem potencial oncogênico (inativam p53 e pRb), mas não em humanos!
Gêneros:
- Mastadenovírus (em mamíferos)
- Mais de 50 distintos vírus em humanos
Herpesvirales
Família: Herpesviridae
Ordem:
I
• Três sub-famílias:
• Alfaherpesvirinae (vírus do Herpes simples, vírus
Varicela/Zoster)
• Betaherpesvirinae (Citomegalovírus; CMV)
• Gamaherpesvirinae (vírus Epstein Barr; EBV)
Família Herpesviridae
• Subfamília:
Betaherpesvirinae
– Cytomegalovirus HHV-5
– Muromegalovirus MCMV-1
– Roseolovirus HHV-6
I
I
Família Herpesviridae
• Subfamília:
Gammaherpesvirinae
– Lymphocryptovirus HHV-4 (vírus
Epstein Barr, EBV)
– Rhadinovirus
Herpes
Herpes genital
VARICELA OU CATAPORA
Fibropapilloma-associated turtle herpesvirus (FPTHV)
Koi herpesvírus
Família Herpesviridae
• Subfamília:
Betaherpesvirinae
– Cytomegalovirus HHV-5
– Muromegalovirus MCMV-1
– Roseolovirus HHV-6
RECÉM NASCIDO - CMV
Família Herpesviridae
• Subfamília:
Gammaherpesvirinae
POXVIRIDAE I
- os maiores vírus conhecidos (~ 300 nm)
- simetria complexa
- DNA duplo (codifica > 100 prots)
- multiplicação intracitoplásmica
Varíola
Molusco contagioso
Varíola
VARÍOLA
Molusco
Contagioso
como DST
II
Anelloviridae
Vírus muito pequenos,
com genoma de DNA. 1,7 – 3KB
Fita simples
Não envelopados
Muito ubíquos
Associação como doenças?
Ex: vírus Torque teno de diversas espécies
II
Família Circoviridae
- DNA fita simples, 1,76 - 3,7 kilobases
- não envelopados
- simetria icosaédrica
- Gêneros:
- Gyrovirus: vários girovírus humanos
Porcine circovirus (PCV2) detection in cytoplasm and nucleus of infected
cells. Fontes: Pigsite e The Merck Vet Manual
II
PARVOVIRIDAE
- DNA fita simples
- não envelopados (15-25 nm)
3 gêneros:
Parvovirus (MVM)
Erythrovirus (B19)
Dependovirus
Eritema infeccioso
Parvovírus B19- eritema infeccioso/ hidropsia fetal
III
Vírus com genoma RNA de fita dupla
segmentado
(Baltimore grupo III)
Birnaviridae
Reoviridae
Família Birnaviridae
- sem envelope, icosaédricos
- RNA bisegmentado
Gêneros: Aquabirnavirus; type species: Infectious pancreatic necrosis virus
Avibirnavirus; type species: Infectious bursal disease virus
Blosnavirus; type species: Blotched snakehead virus
Entomobirnavirus; type species: Drosophila X virus
III
Família Reoviridae
- dois capsídeos com
simetria icosaédrica (20-30 nm)
- RNA fita dupla
- não envelopados
- Gêneros:
Orthoreovírus
Orbivírus
Rotavírus
III
Reoviridae: duas subfamílias:
Sedoreovirinae: contém seis gêneros:
Cardoreovirus
Mimoreovirus
Orbivirus
Phytoreovirus
Rotavirus
Seadornavirus
Spinareovirinae: contém nove gêneros:
Aquareovirus
Coltivirus
Cypovirus
Dinovernavirus
Fijivirus
Idnoreovirus
Mycoreovirus
Orthoreovirus
Oryzavirus
Outro gênero não classificado:
Crabreovirus[9]
Referência sobre reovírus e terapia anti-cancer:
Gene Therapy of Cancer
Methods in Molecular Biology™ Volume 542, 2009, pp 607-634
Oncolytic Viral Therapy Using Reovirus
Chandini Thirukkumaran & Don G. Morris
IV
Vírus com genoma RNA de fita simples
não segmentados, polaridade positiva:
Arteriviridae
Astroviridae
Caliciviridae
Coronaviridae
Flaviviridae
Hepeviridae
Picornaviridae
Togaviridae
Grupo IV: RNA (+) fs
Ordem: Nidovirales
Família: ARTERIVIRIDAE
Vírus da arterite equina
Vírus da PRRS
Vírus elevador da
lactato dehidrogenase
IV
Astrovírus
• Família Astroviridae
• 28-35 nm, aparência de estrêla com 5 - 6 pontas
• RNA fs+ ~7 kb, poli-A em 3’ , sem cap em 5’
• 3 ORFs (overlap 70 nt entre ORF1a (protease) e ORF1b (RdRP)
• Dois gêneros:
» Mamastrovirus: gatos, suinos, ovelhas, etc
» Aviastrovirus: aves
IV
Família ASTROVIRIDAE
Gênero: Astrovírus
- RNA fs, nús 20-30 nm
- encontrados em fezes
- associados a diarréias
IV
Família Caliciviridae
•
•
•
•
•
RNA fita simples, nús, polaridade positiva
Gêneros:
Sapovírus
Norovírus
São as mais importantes causas de gastroenterite
viral em humanos.
• Geralmente causam gastroenterites leves
em animais jovens de várias espécies.
Ordem Nidovirales
IV
Família Coronaviridae
- Pleomórficos, envelopados
- peplômeros espaçados
- RNA fs positiva (+)
Gêneros: Coronavírus; Torovírus
Coronavírus humano (resfriados)
Bronquite Infecciosa das Aves
Peritonite Infecciosa dos felinos
IV
FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE
- Flavi = amarelo
- globulares (50 nm)
- RNA fs positiva
- nucleocapsídeo icosaédrico
- envelopados
-Gêneros:
Flavivírus Febre Amarela, Dengue 1,2,3,4, Zika
Pestivírus Peste Suína
Clássica,
BVD, BDO
Hepacivirus: Hepatite C (!!!)
IV
Hepeviridae
•
•
•
•
•
Gênero Hepevírus=> Vírus da hepatite E
- Não envelopado, fs, +, 7200 nt,
- Com cap, poliadenilado
Genoma: 5´ UTR- três ORFs - 3´UTR
-
Família Picornaviridae
IV
- Pico = pequeno
- simetria icosaédrica (20-30 nm)
- RNA (+) fs
- não envelopados
- Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A)
Enterovírus (Polio, Coxsackie, Entero)
Rinovírus (resfriados)
Aftovírus (Febre Aftosa)
Vacina Sabin
IV
Família Togaviridae
- Grupo IV : RNA fs (+)
- envelopados
- pleomórficos (70 nm)
- RNA fs positiva
-Gêneros: Alfavírus (n= 27): infectam várias espécies
-Causam arboviroses:
-ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana,
-Chikungunya
Rubivírus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!)
IV
V
Vírus com genoma RNA de fita simples
não segmentado, com polaridade negativa
Filoviridae
Paramyxoviridae
Rhabdoviridae
V
Família Filoviridae
- filamentosos (80-14 000 nm)
- envelopados
- RNA fs negativa
Marburg
Ebola
Ebola
V Família Paramyxoviridae
Duas sub-famílias:
Paramyxovirinae:
Respirovirus: Parainfluenza PI-1, PI-3,
Rubulavirus: PI-2,Cachumba
Morbillivirus: Cinomose,
Sarampo,
Morbilivírus das focas
Pneumovirinae: Pneumovirus: HRSV, BRSV,
Metapneumovirus humano
Metapneumovírus aviário
Henipavirus: Hendra, Nipah
Cinomose
Família Rhabdoviridae
• forma de bala
• Simetria helicoidal
• RNA fs negativa
Gêneros:
Lyssavirus:
Raiva, Lagos Bat, Mokola,
Obodhiang, Kotonkan
Vesiculovírus: Estomatite Vesicular
Efemerovirus:
V
Vírus com genoma RNA de fita
simples, segmentado, polaridade
negativa
(Baltimore Grupo V)
Arenaviridae
Bornaviridae
Bunyaviridae
Orthomyxoviridae
V
Família: Arenaviridae
- Pleomórficos (globulares) 50-300 nm
- Envelopados
- Duas fitas simples de RNA (L e S)
- Contem ribossomos
- Usualmente são vírus latentes de roedores
Gênero Arenavirus
- Coriomeningite linfocítica
- Febre Lassa
- Febres hemorrágicas:
Argentina e Boliviana
LCMV-Lassa virus (Old World) complex:
Gbagroube virus
Ippy virus
Kodoko virus
Lassa virus
Lujo virus
Luna virus
Lunk virus
Lymphocytic choriomeningitis
virus
Merino Walk virus
Menekre virus
Mobala virus
Mopeia virus
Tacaribe virus (New World) complex:
Amapari virus
Chapare virus
Flexal virus
Guanarito virus
Junin virus
Latino virus
Machupo virus
Oliveros virus
Paraná virus
Pichinde virus
Pirital virus
Sabiá virus
Tacaribe virus
Tamiami virus
Whitewater Arroyo virus
Arenavírus: genoma de RNA segmentado, polaridade negativa (mas ambisenso!)
Os dois segmentos são denominados “S” (Small) e “L” (Large), Codificam 4 proteínas em
sentido ambisenso, muito particular:
Duas fitas de RNA sentido “ambíguo”, ou seja, parte do RNA codifica uma proteína (2),
outra parte gera uma cópia de sentido positivo (mRNA) para produzir proteína viral.
Família: Bunyaviridae
Ordem: Mononegavirales
- Globulares (100nm)
- Envelopados
- Três segmentos de RNA de fita simples,
polaridade negativa
- Quatro gêneros:
Bunyavirus (18 grupos
antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não
agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba,
Guaroa e muitos outros.
Phlebovirus (8 grupos antigênicos, transmitidos por
Phlebotomum).
Nairovirus
(6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus
transmitidos por carrapatos).
Hantavirus
(pelo menos 6 vírus,
não-arbo,
transmitidos por roedores)
Arenavírus: genoma de RNA segmentado, polaridade negativa
(mas ambisenso!)
Os dois segmentos são denominados “S” (Small) e “L” (Large), Codificam 4 proteínas em
sentido ambisenso, muito particular:
Duas fitas de RNA sentido “ambíguo”, ou seja, parte do RNA codifica uma proteína (2),
outra parte gera uma cópia de sentido positivo (mRNA) para produzir proteína viral.
Família: Bunyaviridae
Ordem: Mononegavirales
V
- Globulares (100nm)
- Envelopados
- Três segmentos de RNA de fita simples,
polaridade negativa
- Quatro gêneros:
Bunyavirus (18 grupos
antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não
agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba,
Guaroa e muitos outros.
Phlebovirus (8 grupos antigênicos, transmitidos por
Phlebotomum).
Nairovirus
(6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus
transmitidos por carrapatos).
Hantavirus
(pelo menos 6 vírus,
não-arbo,
transmitidos por roedores)
Orthomyxoviridae
- myxo = muco
- pleomórficos
- RNA fs (-)
- nucleocapsídeo helicoidal,
segmentado (C=7; A & B= 8)
- envelopados
- Gênero: Influenza A,B,C
> importante: A
Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado
(Baltimore grupo III)
Birnaviridae
Reoviridae
Família Birnaviridae
- sem envelope, icosaédricos
- RNA bisegmentado
Gêneros: Aquabirnavirus; type species: Infectious pancreatic necrosis virus
Avibirnavirus; type species: Infectious bursal disease virus
Blosnavirus; type species: Blotched snakehead virus
Entomobirnavirus; type species: Drosophila X virus
VI
Vírus RNA (+), com transcriptase reversa
vírus da leucemia felina
Retroviridae
imunodeficiencia humana, bovina,
felina, dos símios
Leucose dos bovinos e das aves
Visna/maedi, Artrite-encefalite caprina
VI
Família Retroviridae
- nucleocapsídeo icosaédrico
- genoma diplóide, RNA fita simples, polaridade positiva
- envelopados, frágeis
- contém transcriptase reversa
- Três Gêneros:
1- Oncovírus
Leucose bovina (bovine leukemia virus)
HTLV (Human adult T cell leukemia virus)
2- Lentivirus: Vírus da imunodeficiência humana (HIV),
Vírus da imunodeficiencia bovina (BIV),
vírus da imunodeficiencia dos símios (SIV),
vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV),
vírus da anemia infecciosa equina (EIAV)
3- Spumavírus
Retrovírus - Classificação
Leucose bovina
Caprine arthritis encephalitis
virus (CAEV)
Equine infectious anemia virus
(EIAV)
Retrovírus – Retrovírus endógenos
• Sequências inseridas nos genomas, derivadas de infecções virais antigas
=> paleovirologia.
• Provírus integrados são passados de geração em geração.
• Não patogênicos => Não são mais capazes de formar uma partícula viral
infecciosa.
• Cerca de 8% dos genomas contém retrovírus endógenos (ERVs), além de
outros “elementos virais endógenos” (EVEs), derivado dos vírus Ebola,
Borna e outros
• Sincitina: derivada de envelope de retrovírus
FIV / FeLV – Sinais Clínicos
VII
Vírus com genoma de DNA
de fita dupla que utilizam a
transcrição reversa
HEPADNAVIRIDAE
VII
- Fita dupla parcial de DNA
- Envelopado, pleomórfico
- transcrição reversa
Um gênero em humanos:
- Ortohepadnavirus: vírus da Hepatite
B