Taxonomia
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Taxonomia • Visa classificar em grupos de acordo com propriedades físicas e químicas comuns • Vírus no mesmo grupo frequentemente tem propriedades biológicas semelhantes: – Replicação – Doença não! (cuidado!) – Transmissão Classificação definida pelo: Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV) ICTVdB - The Universal Virus Database (acesso fácil na Internet) International Committee on Taxonomy of Viruses A classificação dos vírus é politética • “Tem em comum muitas características, mas nenhuma em particular é essencial para a inclusão de determinado vírus em um taxon”. Classificação viral Estrutura (morfologia): Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade Taxonomia Ordem: ... virales Família ... viridae Subfamília ... virinae Espécie/Gênero: ... virus Ordens Seis ordens estebelecidas até o presente pelo ICTV: Caudovirales bacteriófagos com cauda Herpesvirales vírus herpes de eucariotos Mononegavirales RNA não segmentado polaridade negativa - plantas e animais . Nidovirales RNA polaridade positiva de vertebrados. Picornavirales pequenos vírus RNA que infectam plantas, insetos e animais. Tymovirales RNA de fita simples; infectam plantas. Como se escreve? Exemplos: 1. Família Poxviridae, sub-família Chordopoxvirinae, gênero Orthopoxvirus, vírus vaccínia. 2. Família Herpesviridae, sub-família Alphaherpesvirinae, gênero Simplexvirus, herpes vírus humano 2 (vírus do herpes simples 2). 3. Família Picornaviridae, gênero Enterovirus, poliovírus 1. 4. Ordem Mononegavirales, Família Rhabdoviridae, gênero Lyssavirus, vírus da raiva. No uso vernacular informal, deve-se substituir o uso de "ph" por "f" e o do "y" por "i", e deve-se usar assento quando apropriado. Por exemplo: alfaherpesvírus, paramixovírus, aftovírus. Fonte: Cornelia Büchen- Osmond, ICTV Classificação de Baltimore ss= fita simples ds= fita dupla (+) polaridade posirtiva (- ) polaridade negativa Vírus DNA com envelope Herpes Hepadna Irido Pox sem envelope Adeno Anelo Parvo Papiloma Polioma Vírus com DNA Exemplos (nomes comuns) Adenovirus, 1.Adenoviridae Infectious canine hepatitis virus 2.Papillomaviridae Papillomavirus Parvovirus B19, 3.Parvoviridae Canine parvovirus Herpes simplex virus, varicella4.Herpesviridae zoster virus, cytomegalovirus, Epstein-Barr virus Smallpox virus, cow pox virus, 5.Poxviridae sheep pox virus, orf virus, monkey pox virus, vaccinia virus Família 6.Hepadnaviridae 7.Polyomaviridae 8.Anelloviridae Hepatitis B virus Vírion nú/envelopado Simetria Capsídeo Tipo ácido nucléico Grupo (Baltimore) nú Icosaédrico ds I nú Icosaédrico ds circular I nú Icosaédrico ss II Envelopado Icosaédrico ds I Complexo Complexo ds I Icosaédrico circular, parcialmente dupla VII fita Icosaédrico ds circular I Icosaédrico ss circular II Envelopado Polyoma virus; JC virus (progressive multifocal nú leukoencephalopath y) Torque teno virus nú Vírus RNA com envelope Arena Arteri Astro Borna Bunya Calici Corona Filo Flavi Ortomixo Paramixo Rhabdo Toga sem envelope Picorna Reo Virus Family 1.Reoviridae 2.Picornaviridae 3.Caliciviridae 4.Togaviridae 5.Arenaviridae 6.Flaviviridae 7.Orthomyxoviridae 8.Paramyxoviridae 9.Bunyaviridae 10.Rhabdoviridae 11.Filoviridae 12.Coronaviridae 13.Astroviridae 14.Bornaviridae 15.Arteriviridae 16.Hepeviridae Examples (common names) Reovirus, Rotavirus Enterovirus, Rhinovirus, Hepatovirus, Cardiovirus, Aphthovirus, Poliovirus, Parechovirus, Erbovirus, Kobuvirus, Teschovirus, Coxsackie Norwalk virus Rubella virus Lymphocytic choriomeningitis virus Dengue virus, Hepatitis C virus, Yellow fever virus Influenzavirus A, Influenzavirus B, Influenzavirus C, Isavirus, Thogotovirus Measles virus, Mumps virus, Respiratory syncytial virus, Rinderpest virus, Canine distemper virus California encephalitis virus, Hantavirus Rabies virus Ebola virus, Marburg virus Corona virus Astrovirus Borna disease virus Arterivirus, Equine Arteritis Virus Hepatitis E virus Capsid Nú/Envelopado Nú Capsid Symmetry Icosaédrico Nú Nucleic acid type Group ds III Icosaédrico ss IV Nú Envelopado Icosaédrico Icosaédrico ss ss IV IV Envelopado Complexo ss(-) V Envelopado Icosaédrico ss IV Envelopado Helicoidal ss(-) V Envelopado Helicoidal ss(-) V Envelopado Helicoidal ss(-) V Envelopado Envelopado Envelopado Nú Envelopado Helicoidal Helicoidal Helicoidal Icosaédrico Helical ss(-) ss(-) ss ss ss(-) V V IV IV V Envelopado Icosaédrico ss IV Nú Icosaédrico ss IV CIRCOVIRIDAE VÍRUS DNA PARVOVIRIDAE PAPOVAVIRIDAE ADENOVIRIDAE HERPESVIRIDAE HEPADNAVIRIDAE POXVIRIDAE Vírus DNA com envelope Asfar Herpes Hepadna Irido Pox sem envelope Adeno Anelo Parvo Papiloma Polioma Família Asfarviridae • Gênero: Asfivírus: – Vírus da peste suína Africana – Somente infecta suídeos – Interesse veterinário Ordem Herpesvirales Família Herpesviridae • Subfamílias: • Alfaherpesvirinae – – – – Simplexvirus HHV-1, BHV-1, BHV-5 Varicellovirus HHV-3 Não classificado (Doença de Marek das aves) Nâo classificado (Laringotraqueíte das aves) Família Herpesviridae • Subfamília: Betaherpesvirinae – Cytomegalovirus HHV-5 – Muromegalovirus MCMV-1 – Roseolovirus HHV-6 Família Herpesviridae • Subfamília: Gammaherpesvirinae – Lymphocryptovirus HHV-4 (vírus Epstein Barr, EBV) – Rhadinovirus HEPADNAVIRIDAE - fita dupla parcial de DNA - envelopado, pleomórfico - transcrição reversa 2 gêneros: - Ortohepadnavirus: Hepatite B (humanos) - Avihepadnavirus (aves) Iridoviridae POXVIRIDAE - os maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) - simetria complexa - DNA duplo (codifica > 100 prots) - multiplicação intracitoplásmica Varíola Molusco contagioso Ectima dos ovinos Vários outros poxvírus Varíola Vírus Cantagalo- um poxvírus semelhante ao vírus vaccinia An Emergent Poxvirus from Humans and Cattle in Rio de Janeiro State: Cantagalo Virus May Derive from Brazilian Smallpox Vaccine. Clarissa R. A. Damaso,* Joseph J. Esposito,§ Richard C. Condit,¶ and Nissin Moussatche *, Damaso et al, Virology 277, 439±449 (2000) Vírus DNA com envelope Herpes Hepadna Irido Pox sem envelope Adeno Anelo Circo Parvo Papiloma Polioma ADENOVIRIDAE - icosaédricos - não envelopados - DNA dupla fita linear - potencial oncogênico (inativam p53 e pRb) Gêneros: - Mastadenovírus (em mamíferos) - Aviadenovírus (em aves) Anelloviridae Anellovirus Virus classification Group: Group II (ssDNA) Family: Anelloviridae Genera Alphatorquevirus Betatorquevirus Gammatorquevirus Deltatorquevirus Epsilontorquevirus Etatorquevirus Iotatorquevirus Thetatorquevirus Zetatorquevirus Famílias de vírus com genoma DNA de fita simples circovírus suínos ( e outros) Circoviridae Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outros) parvovírus canino-2 Parvoviridae vírus da panleucopenia felina parvovírus suíno parvovírus humano (B19) Família Circoviridae Menores vírus com genoma DNA - DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV) - simetria icosaédrica - Ex: Circovírus dos suínos, Chicken Anemia, Vírus Torque teno (TTV) (humanos e muitos outros similares em diversas espécies) Família Circoviridae Menores vírus com genoma DNA - DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV) - simetria icosaédrica - Ex: Circovírus dos suínos, Chicken Anemia, Vírus Torque teno (TTV) (humanos e muitos outros similares em diversas espécies) Circovírus Torque teno Circovírus suíno (PCV) Descoberta de um novo agente : Girovírus das aves tipo 2 • Discovery of a genome of a distant relative of chicken anemia virus reveals a new member of the genus Gyrovirus. Franciscus A. M. Rijsewijk, Helton F. dos Santos, Thais F. Teixeira, Samuel P. Cibulski, Ana Paula M. Varela, Diogenes Dezen, Ana Cláudia Franco, Paulo M. Roehe. Publicado em: Archives of Virology, 2011 • DOI 10.1007/s00705-011-0971-6 PARVOVIRIDAE - DNA fita simples - não envelopados (15-25 nm) 3 gêneros: Parvovirus (MVM) Erythrovirus (B19) Dependovirus Eritema infeccioso Parvovirose canina, suína Famílias de vírus com genoma de DNA de fita dupla Papilomaviridae Poliomaviridae Adenoviridae Herpesviridae Poxviridae papilomavírus > 70 adenovírus >40 Herpes simples Varicela-zoster Epstein-Barr poxvírus (em quase todas as espécies) PAPILOMAVIRIDAE - DNA fita dupla circular - Sem envelope - Vários associados a cânceres Papilomavírus: (>70) - verrugas - condiloma acuminado - NIC - epidermodisplasia verruciforme POLIOMAVIRIDAE - DNA fita dupla circular - Sem envelope - Importância em imunocomprometidos Poliomavirus: BK, JC (leucoencefalopatia multifocal progressiva) Vírus RNA com envelope Arena Arteri Astro Borna Bunya Calici Corona Filo Flavi Ortomixo Paramixo Rhabdo Toga sem envelope Birna Picorna Reo Grupo IV: RNA (+) fs Ordem: Nidovirales Família: ARTERIVIRIDAE Vírus da arterite equina Vírus da PRRS Vírus elevador da lactato dehidrogenase Família ASTROVIRIDAE Gênero: Astrovírus - RNA fs, nús 20-30 nm - encontrados em fezes - associados a diarréias Família Caliciviridae • • • • • RNA fita simples, nús, polaridade positiva Gêneros: Sapovírus Norovírus São as mais importantes causas de gastroenterite viral em humanos. • Geralmente causam gastroenterites leves em animais jovens de várias espécies . Capsídeo - norovírus Hepeviridae • • • • • Gênero Hepevírus=> Vírus da hepatite E - Não envelopado, fs, +, 7200 nt, - Com cap, poliadenilado Genoma: 5´ UTR- três ORFs - 3´UTR - Vírus da Hepatite E (HEV) • Quatro genotipos: 1,2,3,4 • Genotipos 1 e 2: epidemias associadas a água • Genotipos 3 e 4: são zoonóticos - infectam suínos (raramente outros primatas não humanos) e humanos; causam hepatites esporádicas de origem zoonótica. • Pelo menos 3 genotipos de HEV aviários já foram detectados mundialmente, mas estes tem cerca de 50% de similaridade nas sequencias de nt c/HEV mamíferos Ordem Nidovirales Família Coronaviridae - Pleomórficos, envelopados - peplômeros espaçados - RNA fs positiva (+) Gêneros: Coronavírus; Torovírus Coronavírus humano (resfriados) Bronquite Infecciosa das Aves Peritonite Infecciosa dos felinos Coronavírus Infecção respiratória FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE - Flavi = amarelo - globulares (50 nm) - RNA fs positiva - nucleocapsídeo icosaédrico - envelopados -Gêneros: Flavivírus Febre Amarela, Dengue 1,2,3,4 Pestivírus Peste Suína Clássica, BVD, BDO Hepacivirus: Hepatite C (!!!) Família Togaviridae - Grupo IV : RNA fs (+) - envelopados - pleomórficos (70 nm) - RNA fs positiva -Gêneros: Alfavírus (n= 27): infectam várias espécies -Causam arboviroses: -ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana Rubivírus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!) Família Filoviridae - filamentosos (80-14 000 nm) - envelopados - RNA fs negativa Marburg Ebola Família Paramyxoviridae Duas sub-famílias: Paramyxovirinae: Respirovirus: Parainfluenza PI-1, PI-3, Rubulavirus: PI-2,Cachumba Morbillivirus: Cinomose, Sarampo, Morbilivírus das focas Pneumovirinae: Pneumovirus: HRSV, BRSV, Metapneumovirus humano Metapneumovírus aviário Henipavirus: Hendra, Nipah Vírus Nipah – “flying foxes”, ou raposas voadoras Família Rhabdoviridae • forma de bala • Simetria helicoidal • RNA fs negativa Gêneros: Lyssavirus: Raiva, Lagos Bat, Mokola, Obodhiang, Kotonkan Vesiculovírus: Estomatite Vesicular Efemerovirus: Vírus com genoma RNA de fita simples segmentado Família: Arenaviridae - Pleomórficos (globulares) 50-300 nm - Envelopados - Duas fitas simples de RNA (L e S) - Contem ribossomos - Usualmente são vírus latentes de roedores Gênero Arenavirus - Coriomeningite linfocítica - Febre Lassa - Febres hemorrágicas: Argentina e Boliviana Orthomyxoviridae - myxo = muco - pleomórficos - RNA fs (-) - nucleocapsídeo helicoidal, segmentado (C=7; A & B= 8) - envelopados - Gênero: Influenza A,B,C > importante: A Família: Bunyaviridae Ordem: Mononegavirales - Globulares (100nm) - Envelopados - Três segmentos de RNA de fita simples, polaridade negativa - Quatro gêneros: Bunyavirus (18 grupos antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba, Guaroa e muitos outros. Phlebovirus (8 grupos antigênicos, transmitidos por Phlebotomum). Nairovirus (6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus transmitidos por carrapatos). Hantavirus (pelo menos 6 vírus, não-arbo, transmitidos por roedores) Hantavirose- A síndrome pulmonar por Hantavírus Em SC: O brotamento da Taquara No MS: O plantio de soja Todos: O desmatamento Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado Família Picornaviridae - Pico = pequeno - simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA (+) fs - não envelopados - Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovírus (Polio, Coxsackie, Entero) Rinovírus (resfriados) Aftovírus (Febre Aftosa) Família Picornaviridae Aftovírus (Febre Aftosa) - Febre Aftosa – efeitos indiretos no meio ambiente - Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado Vírus com genomas de RNA de cadeia dupla • Reoviridae – 10 a 12 segmentos de RNA • Birnaviridae – 2 segmentos de RNA Família Birnaviridae - sem envelope, icosaédricos - RNA bisegmentado Gêneros: Entomobirnavírus Aquabirnavírus Avibirnavírus (Gumboro) Família Reoviridae - dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA f`dupla - não envelopados - Gêneros: Orthoreovírus Orbivírus Rotavírus Rotavírus: aptos a resistir ao pH ácido estomacal Rotavírus (Courtesia de Linda Stannard, University of Cape Town, S.A.) SDS-PAGE (ELETROFORESE EM GEL DE POLIACRILAMIDA) Fonte: Simone Guadagnucci Morillo Fonte: Simone Guadagnucci Morillo PATOGÊNESE * * Os rotavírus aderem ao epitélio do trato GI (mucosa jejunal) Aumento da Motilidade e Diminuição da Absorção Danos da região apical das vilosidades Enterotoxina viral NSP4 Zuckerman A et al, eds. Principles and Practice of Clinical Virology. 2nd ed. Londres: John Wiley & Sons; 990:182. Vírus RNA (+), com transcriptase reversa vírus da leucemia felina Retroviridae imunodeficiencia humana, bovina, felina, dos símios Leucose dos bovinos e das aves Visna/maedi, Artrite-encefalite caprina Família Retroviridae - nucleocapsídeo icosaédrico - genoma diplóide, RNA fita simples, polaridade positiva - envelopados, frágeis - contém transcriptase reversa - Três Gêneros: 1- Oncovírus Leucose bovina (bovine leukemia virus) HTLV (Human adult T cell leukemia virus) 2- Lentivirus: Vírus da imunodeficiência humana (HIV), Vírus da imunodeficiencia bovina (BIV), vírus da imunodeficiencia dos símios (SIV), vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV), vírus da anemia infecciosa equina (EIAV) 3- Spumavírus Type A (donut) Endogenous viruses Type B (eccentric) MMTV Type C (central) ALV, RSV Type D (bar) Mason Pfizer virus Lentivirus (cone) HIV Spumavirus (central) Foamy viruses 19531966 W Bernhard, F Haguenau, L Gross, others description of the morphology / morphogenesis of retroviruses and classification of murine and avian types A, B, C and D retroviruses LEMBRE-SE ! Arbovirus (arthropod borne virus) = vírus transmitidos por artrópodos! Os arbovírus pertencem a diversas famílias! (ex.: Bunya, Toga, Flavi) Aguarde!!! • Este slide vai ser acrescentado a seguir!!! Vírus com genoma DNA Famílias de vírus com genoma DNA de fita simples circovírus suínos ( e outros) Circoviridae Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outros) parvovírus canino-2 Parvoviridae vírus da panleucopenia felina parvovírus suíno parvovírus humano (B19)
