Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Bioquímica Médica Curso de Bioenergética e Metabolismo 2010 Profs. Marcus Oliveira e Rodrigo Nunes Estudo Dirigido II 1 - A mucosa gástrica humana é capaz de produzir quantidades consideráveis de hidrogênio molecular (H2) como um sub-produto do processo de digestão de carboidratos. A bactéria gástrica Helicobacter pylori, causadora de algumas formas de gastrite, é capaz de utilizar o H 2 como um doador de elétrons para sua cadeia transportadora de elétrons através de uma enzima com atividade hidrogenase (Olson e Maier Science 2002;298(5599):1788-90). Sabe-se também que esta bactéria não sobrevive em ambientes completamente anaeróbicos. Discuta de que maneira deve ocorrer a utilização de H2 e proponha como deve ser a cadeia transportadora de elétrons e a síntese de ATP nesta bactéria. 2 - Nume experiência com mitocôndrias de fígado de rato suspensas em um meio contendo 2,5mM de Pi (fosfato inorgânico), 2,5mM de MgCl2, 0,25mM de sacarose, tampão Tris 10 mM, pH 7,4 e albumina 1mg/ml, foram adicionadas as substâncias abaixo relacionadas. Represente graficamente o consumo de oxigênio e a síntese de ATP após cada uma das sucessivas adições abaixo, justifique cada passo: a) piruvato e oxalacetato b) ADP c) DNP (dinitrofenol) d) Succinato e) Cianeto f) Malonato de sódio (10mM) Sabendo que: DNP é um agente desacoplador e malonato de sódio um análogo do malato, consequentemente um inibidor irreversivel da enzima malato desidrogenase. 3 - Faça um minidissertação (10 linhas no máximo), sobre a regulação das vias metabólicas abaixo relacionadas, quando na presença e ausência de O2, e na presença ou ausência de ATP e NADH. a) Glicólise b) Ciclo de Krebs c) Cadeia transportadora de elétrons e fosforilação oxidativa 4 - A transformação de glicose em lactato, realizada por células musculares, libera apenas 7% da energia livre contida na molécula de glicose, quando a mesma é oxidada até CO2 e H2O. a) Explique porque as células musculares não aproveitam toda a energia contida na molécula de glicose. b) De maneira experimental, podemos medir o consumo de glicose em células musculares cardíacas antes e depois da perfusão deste órgão com sangue. Se perfundirmos um coração com sangue desoxigenado, observaremos um aumento considerável do consumo de glicose. Por outro lado, se perfundirmos o coração com sangue oxigenado a taxa de consumo de glicose diminui drasticamente, mantendo-se em baixos níveis. Explique porque ocorre este fenômeno. 5 - A concentração de glicose no sangue de um ser humano sadio é em torno de 5mM. Por outro lado, a concentração de glicose intracelular encontra-se bem abaixo deste valor. Porque? Sabendo que glicose é administrada de forma intravenosa em alguns casos clínicos, e que para ser utilizada ela precisa ser fosforilada (o que representa gasto de energia) porque não administrar glicose-6 fosfato por via intravenosa? 6 - O complexo enzimático da F1Fo-ATP sintase é composto de diversas subunidades, dentre elas uma proteína inibidora (PI). Esta proteína (PI) diminui a atividade de hidrólise de ATP pela F1Fo. A análise da expressão desta proteína em diversos tecidos revelou o seguinte perfil: Nível de expressão da PI Cérebro ** Coração * Fígado ****** Rim **** Músculo esquelético *** Pulmão *** Intestino **** Pâncreas **** Em intervenções cirúrgicas é muito comum a prática de obstrução dos vasos sanguíneos de modo a evitar hemorragias. Durante esta prática, os tecidos com fluxo sanguíneo interrompido experimentam uma situação isquêmica. Após a cirurgia ocorre a desobstrução dos vasos estabelecendo a situação de reperfusão ou redisponibilização de sangue. Levando em consideração uma situação isquêmica nestes tecidos, responda as quatro questões abaixo, justificando cada item: a) Comparativamente, como deve ser a taxa de produção de lactato no músculo esquelético e no cardíaco? b) Preveja quais tecidos devem ser mais afetados em termos de lesão tecidual ou necrose. c) Compare qual deve ser a taxa de produção de lactato, os níveis de ATP celular e o grau de lesão tecidual entre o músculo esquelético de um paciente com doença de McArdle e o músculo esquelético de uma pessoa normal. Levando em consideração agora uma situação de reperfusão nestes tecidos, responda as duas questões abaixo, justificando cada item: d) Preveja qual deve ser a taxa de fluxo de elétrons nas mitocôndrias destes oito tecidos, segundos após a reperfusão. e) Preveja qual deve ser a taxa de geração de espécies reativas de oxigênio (ROS), ou radicais livres, nos oito tecidos, segundos após a reperfusão. 7 - Foi identificado um novo organismo eucariótico chamado Numhynthendunadadi biochymikha que possui mitocôndrias e vive obrigatoriamente numa variedade de cana de açúcar num meio com altíssimas concentrações de glicose em torno de 1 molar (concentrações de glicose intracelular média em células eucarióticas variam em torno de 0,0002 molar !). O genoma deste organismo foi totalmente seqüenciado e revelou diferenças marcantes em algumas enzimas do metabolismo energético. Uma destas enzimas é a glicose fosforilase que catalisa a fosforilação de glicose a glicose-6 fosfato e a outra enzima é a frutose-6 fosfato fosforilase que catalisa a fosforilação de frutose 6-fosfato a frutose 1,6 bisfosfato. Ambas enzimas utilizam fosfato inorgânico como substrato para suas reações. Os complexos da piruvato desidrogenase e alfacetoglutarato desidrogenase deste organismo também são diferentes já que estão ancoradas à membrana interna mitocondrial e ambas transferem seus elétrons para o FAD que é reduzido à FADH2 e que posteriormente é reoxidado, transferindo os elétrons para a ubiquinona. A transferência de elétrons do citossol para a mitocôndria deste organismo é feita através da atividade da gliceraldeído 3 fosfato desidrogenase. Todas as demais reações do metabolismo energético são iguais às de outras células eucarióticas. Baseado nestas informações responda as questões abaixo, justificando cada item: a) Estime o rendimento energético da oxidação da glicose a CO2 e água deste organismo. Leve em consideração que cada molécula de NADH gera 3 ATPs e cada molécula de FADH2 gera 2 ATPs. b) Porque este organismo vive obrigatoriamente nesta variedade de cana de açúcar? Explique sob o ponto de vista termodinâmico. 8 - Tonhão procurou assistência médica após sentir fortes dores musculares e fraqueza quando jogava uma partida de futebol no Aterro do Flamengo. Análises bioquímicas feitas a partir de biópsias musculares e exames clínicos mostraram as seguintes dados: Tonhão Normal Glicogênio muscular 200 mg /g 15 mg / g Lactato sérico após exercício 0.5 mM 15 mM Atividade fosfofruto cinase 1 muscular 0.32 Unidades / g 0.34 Unidades / g Atividade citrato sintase muscular 0.76 Unidades / g 0.73 Unidades / g Recentemente foi proposto um tratamento experimental de modo a reverter o quadro clínico de fraqueza muscular exibido por Tonhão. Este tratamento consiste na suplementação da refeição com mingau de amido de milho antes do exercício físico intenso. Este tratamento impediu completamente a fadiga muscular precoce de Tonhão. Hoje em dia Tonhão é rico e aparece nos rótulos de um importante fabricante de amido de milho Tonhão ! a) Qual é a provável disfunção metabólica do Tonhão? b) Qual é o rendimento da via glicolítica usando glicogênio ou glicose? c) Por que o tratamento com mingau reverteu o quadro clínico do Tonhão? 9 - Em condições ótimas, a adição de succinato a uma preparação de mitocondrias isoladas de cérebro de rato promove aumento do potencial da membrana mitocondrial interna (ΔΨm), consumo de oxigênio e formação de espécies reativas de oxigênio (ROS). A adição de ADP a mistura de reação promove um aumento na velocidade de consumo de oxigênio, diminuição no (ΔΨm), diminuição da formação de ROS e síntese de ATP. Ao se adicionar DNP (ionóforo de prótons) à mitocondria respirando: O que deverá acontecer com a velocidade de consumo de oxigênio, formação de ROS, (ΔΨm) e síntese de ATP? a) Na ausência de ADP. b) Na presença de ADP. 10 - Durante o dia, as plantas utilizam a água como principal doador de elétrons nos cloroplastos, resultando na produção de O2, NADPH e ATP. A atividade de oxidação de água realizada no foto-sistema 2 é inibida pela exposição excessiva à radiação ultravioleta. Em artigo recente (Mano, Hideg, e Asada Arch Biochem Biophys. 2004 Sep 1;429:71-80) foi demonstrado que o ascorbato (vitamina C) funciona como um doador de elétrons alternativo para os dois foto-sistemas 1 e 2 mesmo na presença de luz ultravioleta. Durante a oxidação de ascorbato os autores mostraram que não ocorre geração de potencial de membrana no lúmen dos tilacóides. Baseado nisto, pergunta-se: a) Existe alguma alteração na síntese de ATP e NADPH quando as plantas utilizam o ascorbato ao invés da água como doador de elétrons? Porque? b) Como deve ser a atividade da RuBisCO quando os cloroplastos utilizam ascorbato como um doador de elétrons alternativo?